20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0025 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0025  aldolase  100 
 
 
472 aa  965    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1611  fructose-bisphosphate aldolase, class-II, putative  26.71 
 
 
379 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.455667  normal  0.226673 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0218  ketose-bisphosphate aldolase class-II  26.05 
 
 
421 aa  58.5  0.0000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.551518  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0088  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  31.43 
 
 
283 aa  57.4  0.0000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000126307  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1245  fructose-bisphosphate aldolase, class-II, putative  23.22 
 
 
364 aa  52.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.845677  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1969  fructose-bisphosphate aldolase  23.32 
 
 
379 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1761  fructose-bisphosphate aldolase  25.47 
 
 
361 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000165684  normal  0.0733362 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1325  fructose-bisphosphate aldolase  27.44 
 
 
374 aa  49.3  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1021  fructose-bisphosphate aldolase  27.88 
 
 
324 aa  49.7  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0751312  normal  0.0186184 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0728  fructose-bisphosphate aldolase  26.88 
 
 
324 aa  48.9  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4839  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  32.64 
 
 
284 aa  47.8  0.0005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.317142  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1253  fructose-bisphosphate aldolase  26.75 
 
 
324 aa  47  0.0008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.750489  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1329  fructose-bisphosphate aldolase  26.22 
 
 
324 aa  46.6  0.0009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.569053  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0131  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  31.01 
 
 
308 aa  46.6  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1045  fructose-bisphosphate aldolase  24.22 
 
 
324 aa  44.7  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000000468946  unclonable  0.00000168547 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1362  fructose-bisphosphate aldolase  25.45 
 
 
324 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0057  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  28.09 
 
 
284 aa  45.1  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0610638  hitchhiker  0.000350407 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2222  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  26.82 
 
 
311 aa  43.9  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000908669  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1705  ketose-bisphosphate aldolase  24.59 
 
 
274 aa  43.5  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18020  fructose-1,6-bisphosphate aldolase, class II  29.63 
 
 
284 aa  43.1  0.01  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000218144  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>