More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SYO3AOP1_0005 on replicon NC_010730
Organism: Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010730  SYO3AOP1_0005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  100 
 
 
206 aa  416  9.999999999999999e-116  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0820  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  48.97 
 
 
214 aa  191  9e-48  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00000106219  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1240  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.59 
 
 
216 aa  157  9e-38  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3304  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.52 
 
 
217 aa  155  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.324027  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2902  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.52 
 
 
217 aa  155  3e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00933541  hitchhiker  0.00130381 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1234  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.81 
 
 
202 aa  155  3e-37  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0604  thiamine-phosphate diphosphorylase  39.11 
 
 
217 aa  154  8e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0199515  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2663  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.1 
 
 
209 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.989358 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0392  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.46 
 
 
214 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.309762 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0687  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.6 
 
 
222 aa  149  3e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2067  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  41.5 
 
 
213 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.946147  normal  0.117527 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.61 
 
 
211 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.656978  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4341  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.98 
 
 
205 aa  144  9e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3685  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.41 
 
 
210 aa  143  1e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0958  thiamine monophosphate synthase  40.2 
 
 
212 aa  142  5e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.578889  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4946  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.32 
 
 
207 aa  141  9e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09270  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.54 
 
 
209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.36456  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2999  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.56 
 
 
224 aa  139  3e-32  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.718744  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4799  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40 
 
 
205 aa  139  3e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3901  thiamine monophosphate synthase  40.59 
 
 
211 aa  137  7.999999999999999e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1500  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.92 
 
 
207 aa  136  2e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2628  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.45 
 
 
234 aa  136  2e-31  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0637  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.59 
 
 
207 aa  135  5e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.578758  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.25 
 
 
212 aa  134  7.000000000000001e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3432  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.18 
 
 
343 aa  134  8e-31  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2763  phosphomethylpyrimidine kinase  37.62 
 
 
492 aa  134  9e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00755044  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2684  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.18 
 
 
343 aa  134  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12400  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.56 
 
 
209 aa  133  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4659  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.59 
 
 
207 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.448839  normal  0.475374 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4783  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.59 
 
 
207 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.655377  normal  0.0379586 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1989  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.14 
 
 
210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4837  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.59 
 
 
207 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2788  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.15 
 
 
208 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.305449  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1132  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.59 
 
 
209 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0497  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.08 
 
 
203 aa  129  3e-29  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2556  thiamine monophosphate synthase  39.8 
 
 
211 aa  128  6e-29  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2935  thiamine monophosphate synthase  36.59 
 
 
213 aa  128  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.571154  hitchhiker  5.39936e-16 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0400  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.32 
 
 
204 aa  128  6e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1934  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  39.8 
 
 
206 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0782  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.78 
 
 
352 aa  126  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0390  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.68 
 
 
207 aa  125  3e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.312895 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0436  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.05 
 
 
204 aa  124  8.000000000000001e-28  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.408006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2521  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.68 
 
 
346 aa  124  1e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0461  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.19 
 
 
206 aa  124  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.037147  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0061  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.5 
 
 
205 aa  123  2e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0221396  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3773  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.61 
 
 
209 aa  121  7e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0971718 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1005  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.89 
 
 
202 aa  121  9e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0358  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.17 
 
 
219 aa  121  9e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0605  thiamine-phosphate pyrophosphorylase/phosphomethylpyrimidine kinase  33.99 
 
 
490 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5047  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.45 
 
 
379 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.554063  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0446  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.67 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1532  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.45 
 
 
206 aa  120  9.999999999999999e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3528  phosphomethylpyrimidine kinase  35.92 
 
 
484 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3851  phosphomethylpyrimidine kinase  37.07 
 
 
497 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4121  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.68 
 
 
228 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00354479 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1080  thiamine-phosphate diphosphorylase  32.99 
 
 
216 aa  119  3e-26  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0652  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.5 
 
 
218 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.614638  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2235  hydroxymethylpyrimidine/phosphomethylpyrimidine kinase  35.15 
 
 
479 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1529  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.68 
 
 
207 aa  119  3.9999999999999996e-26  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.691821  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1155  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.69 
 
 
197 aa  118  6e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00149529  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4884  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.5 
 
 
218 aa  118  7e-26  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2166  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.6 
 
 
213 aa  118  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00215489  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2128  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.6 
 
 
213 aa  118  7e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000263441  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0440  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.96 
 
 
219 aa  117  9e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.56 
 
 
224 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2062  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.31 
 
 
216 aa  117  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0114882  normal  0.0947623 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0816  thiamine monophosphate synthase  34.98 
 
 
217 aa  117  9.999999999999999e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.380112  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3462  phosphomethylpyrimidine kinase  35.6 
 
 
484 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0665  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34 
 
 
218 aa  117  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.3513e-26 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0566  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.32 
 
 
211 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000752501  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_688  ThiE-associated domain protein/thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
352 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000736904  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0828  thiamine-phosphate diphosphorylase  33.51 
 
 
217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0364  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  37.63 
 
 
217 aa  115  3e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0487  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.56 
 
 
219 aa  116  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0420  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.56 
 
 
219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3318  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.35 
 
 
220 aa  115  5e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.195577  normal  0.0232291 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2583  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  38.62 
 
 
360 aa  115  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0349  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.48 
 
 
219 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0353  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.56 
 
 
219 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2908  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.7 
 
 
368 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0708  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.82 
 
 
352 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0376  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.33 
 
 
214 aa  112  3e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.756236  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2347  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  40.12 
 
 
221 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0604  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.5 
 
 
536 aa  112  3e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0363  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.02 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.45254  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3660  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  33.5 
 
 
220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0377  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.02 
 
 
219 aa  112  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17535  predicted protein  34.2 
 
 
478 aa  111  6e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.274913 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0116  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.33 
 
 
205 aa  111  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1368  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  36.08 
 
 
365 aa  111  9e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.524473  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1927  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.02 
 
 
236 aa  111  9e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0119683 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2595  phosphomethylpyrimidine kinase  33.5 
 
 
494 aa  111  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.61105  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2909  phosphomethylpyrimidine kinase  32.18 
 
 
497 aa  110  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.112824 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1336  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.84 
 
 
207 aa  111  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.108459  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0593  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.65 
 
 
206 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0144  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  31.34 
 
 
344 aa  110  2.0000000000000002e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1543  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  30.85 
 
 
207 aa  109  2.0000000000000002e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0451009  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3314  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  34.04 
 
 
347 aa  109  3e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2591  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  32.09 
 
 
214 aa  108  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_14351  thiamine-phosphate pyrophosphorylase  35.9 
 
 
353 aa  107  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>