269 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_t0179 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  tRNA-Arg-3  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Arg-4  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0605047  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0030  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.238826  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0179  tRNA-Arg  100 
 
 
74 bp  147  4.0000000000000006e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0020  tRNA-Arg  94.59 
 
 
74 bp  115  1.0000000000000001e-24  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0041  tRNA-Arg  93.24 
 
 
77 bp  107  4e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000000324571  normal  0.101543 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0026  tRNA-Arg  93.06 
 
 
77 bp  103  5e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000000155557  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t32  tRNA-Arg  91.89 
 
 
77 bp  99.6  9e-20  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0011176  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0296  tRNA-Arg  94.55 
 
 
74 bp  85.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0007006  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_t0562  tRNA-Arg  94.55 
 
 
74 bp  85.7  0.000000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0081  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000923685  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0029  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000030616  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0028  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000292353  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0027  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000312011  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0080  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000233743  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0083  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000215013  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_R0030  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000300498  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0077  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000716248  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0079  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000061602  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0082  tRNA-Arg  91.53 
 
 
77 bp  77.8  0.0000000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000302683  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0037  tRNA-Arg  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180168  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0038  tRNA-Arg  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000238811  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0039  tRNA-Arg  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000255751  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_R0041  tRNA-Arg  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000126984  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0021  tRNA-Arg  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.0000000063734  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0022  tRNA-Arg  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00000000656086  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0045  tRNA-Arg  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.24786  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0046  tRNA-Arg  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.345279  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0047  tRNA-Arg  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.349818  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0049  tRNA-Arg  91.38 
 
 
77 bp  75.8  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.871156  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna113  tRNA-Arg  90.16 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00652394  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0108  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000272922  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0117  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000112266  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0101  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000000012367  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0099  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000165314  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t026  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000584816  hitchhiker  0.00000103487 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0118  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000119067  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_t085  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_t086  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0116  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000102508  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0115  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000013002  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0119  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000131096  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0098  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000015782  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0095  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000000787124  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0092  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00111673  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0091  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00116714  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0089  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00125706  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0106  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000188181  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0109  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000932697  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t022  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000204678  hitchhiker  0.0000000336806 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0095  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000145401  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna111  tRNA-Arg  90.16 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00293303  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0093  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000449843  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0110  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000105777  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03499  tRNA-Arg  90.16 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0107  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000203726  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03502  tRNA-Arg  90.16 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0045  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000301516  normal  0.527619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_R0094  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000391203  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03501  tRNA-Arg  90.16 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna106  tRNA-Arg  90.16 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000169695  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03503  tRNA-Arg  90.16 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03504  tRNA-Arg  90.16 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03506  tRNA-Arg  90.16 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0044  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000826054  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t023  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000185233  hitchhiker  0.0000000311481 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0046  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000243564  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna109  tRNA-Arg  90.16 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000319749  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t019  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000120774  hitchhiker  0.0000000298076 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna108  tRNA-Arg  90.16 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000789461  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0045  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000233183  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna110  tRNA-Arg  90.16 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00293303  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0047  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000279999  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_R0113  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000084866  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna112  tRNA-Arg  90.16 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00685075  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0043  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000028364  normal  0.527619 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_R0104  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000547181  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t021  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000593467  hitchhiker  0.0000000311481 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_t024  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000647415  hitchhiker  0.000000189876 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03500  tRNA-Arg  90.16 
 
 
74 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_rna114  tRNA-Arg  90.16 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0142172  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0043  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000142097  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0037  tRNA-Arg  87.67 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.678102  normal  0.176002 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_R0045  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000160555  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_R0100  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.00000000127337  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0039  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000292486  normal  0.532289 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0040  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000315714  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0041  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000275058  normal  0.527619 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_R0042  tRNA-Arg  91.23 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000264574  normal  0.527619 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0035  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042903  hitchhiker  0.00756104 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0039  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0446173  hitchhiker  0.00751458 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0108  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0114  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.195511  hitchhiker  0.0000613432 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0107  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0037  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0424751  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_R0020  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000211793  normal  0.0116052 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0115  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.125071  hitchhiker  0.0000608145 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_R0036  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.042903  hitchhiker  0.00773647 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0112  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.456139  hitchhiker  0.0000639392 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_R0113  tRNA-Arg  89.66 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.196307  hitchhiker  0.0000602904 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>