289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_2001 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_2001  rRNA large subunit methyltransferase  100 
 
 
159 aa  322  2e-87  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.554964  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1945  rRNA large subunit methyltransferase  73.58 
 
 
159 aa  249  1e-65  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0305883  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2173  rRNA large subunit methyltransferase  74.21 
 
 
159 aa  246  1e-64  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.015076  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0027  rRNA large subunit methyltransferase  63.52 
 
 
159 aa  206  7e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000611129  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0070  rRNA large subunit methyltransferase  61.64 
 
 
159 aa  202  1e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000017339  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3999  rRNA large subunit methyltransferase  61.01 
 
 
159 aa  196  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5582  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 
159 aa  193  9e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5312  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 
159 aa  193  9e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5156  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 
159 aa  193  9e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0136607  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5708  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 
159 aa  193  9e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5353  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 
159 aa  193  9e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000123546  hitchhiker  7.68925e-17 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5608  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 
159 aa  192  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.91271  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5252  rRNA large subunit methyltransferase  59.12 
 
 
159 aa  192  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5140  rRNA large subunit methyltransferase  58.49 
 
 
159 aa  192  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0439038  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5565  rRNA large subunit methyltransferase  58.49 
 
 
167 aa  191  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5705e-39 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5643  rRNA large subunit methyltransferase  58.49 
 
 
167 aa  191  4e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00520396  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0108  hypothetical protein  55.97 
 
 
160 aa  190  7e-48  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3402  protein of unknown function DUF163  58.49 
 
 
159 aa  185  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000153536  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2438  rRNA large subunit methyltransferase  57.86 
 
 
159 aa  185  2e-46  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000743067  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2927  rRNA large subunit methyltransferase  55.97 
 
 
159 aa  183  7e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2610  rRNA large subunit methyltransferase  55.97 
 
 
159 aa  183  7e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3531  rRNA large subunit methyltransferase  55.97 
 
 
177 aa  180  6e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0910  rRNA large subunit methyltransferase  54.72 
 
 
159 aa  177  4e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000742092  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0024  rRNA large subunit methyltransferase  54.09 
 
 
159 aa  175  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000287275  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0024  rRNA large subunit methyltransferase  54.09 
 
 
159 aa  175  3e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  decreased coverage  0.000337367  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2529  rRNA large subunit methyltransferase  54.09 
 
 
159 aa  174  4e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000224859  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0291  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
159 aa  173  7e-43  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.191259  normal  0.200135 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1588  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
159 aa  173  7e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0556  rRNA large subunit methyltransferase  51.57 
 
 
159 aa  172  9.999999999999999e-43  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0360  rRNA large subunit methyltransferase  50.94 
 
 
159 aa  171  3.9999999999999995e-42  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.615006  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1622  rRNA large subunit methyltransferase  50.94 
 
 
159 aa  169  1e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2894  protein of unknown function DUF163  51.9 
 
 
159 aa  164  5e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.577579  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4914  rRNA large subunit methyltransferase  46.54 
 
 
160 aa  163  6.9999999999999995e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000673176  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20240  conserved hypothetical protein TIGR00246  48.43 
 
 
159 aa  161  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0291  protein of unknown function DUF163  48.75 
 
 
160 aa  157  5e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0186032  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2326  rRNA large subunit methyltransferase  44.03 
 
 
159 aa  152  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000881248  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3387  rRNA large subunit methyltransferase  47.8 
 
 
159 aa  152  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19420  hypothetical protein  48.43 
 
 
156 aa  148  4e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000114035 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0118  protein of unknown function DUF163  46.54 
 
 
165 aa  144  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.825891  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0073  protein of unknown function DUF163  44.03 
 
 
159 aa  143  8.000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00804321  normal  0.0154947 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2340  rRNA large subunit methyltransferase  47.65 
 
 
155 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000321376  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2916  protein of unknown function DUF163  41.51 
 
 
159 aa  139  9.999999999999999e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.539435  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3293  hypothetical protein  45.28 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2340  hypothetical protein  44.03 
 
 
159 aa  138  3e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.663621 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2467  hypothetical protein  40.25 
 
 
159 aa  132  1.9999999999999998e-30  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.574307  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0677  hypothetical protein  42.14 
 
 
158 aa  130  5e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2416  hypothetical protein  40.88 
 
 
160 aa  130  7.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0648918  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2595  hypothetical protein  37.74 
 
 
159 aa  128  4.0000000000000003e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1037  protein of unknown function DUF163  42.33 
 
 
154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0171  conserved hypothetical protein TIGR00246  40.88 
 
 
159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2576  hypothetical protein  41.51 
 
 
156 aa  124  5e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000709351  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0254  hypothetical protein  38.99 
 
 
153 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0655  protein of unknown function DUF163  38.61 
 
 
157 aa  118  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01660  hypothetical protein  40.25 
 
 
150 aa  118  3.9999999999999996e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.134339  hitchhiker  0.00000000000774135 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00605  hypothetical protein  39.62 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000332715  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2990  protein of unknown function DUF163  39.62 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000047133  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0725  rRNA large subunit methyltransferase  39.62 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000708993  normal  0.106325 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0656  rRNA large subunit methyltransferase  39.62 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000108281  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0662  rRNA large subunit methyltransferase  39.62 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000637947  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0615  rRNA large subunit methyltransferase  39.62 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000121913  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3009  rRNA large subunit methyltransferase  39.62 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000000239477  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0688  rRNA large subunit methyltransferase  39.62 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000154252  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00594  hypothetical protein  39.62 
 
 
155 aa  117  4.9999999999999996e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000243444  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2090  rRNA large subunit methyltransferase  43.04 
 
 
157 aa  117  7.999999999999999e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0022  protein of unknown function DUF163  41.1 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000120768  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0244  protein of unknown function DUF163  37.74 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.998147  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3495  rRNA large subunit methyltransferase  40.51 
 
 
157 aa  116  1.9999999999999998e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0587384  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4971  rRNA large subunit methyltransferase  37.11 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.170653  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0255  protein of unknown function DUF163  38.36 
 
 
153 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0353542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2849  hypothetical protein  37.11 
 
 
155 aa  115  1.9999999999999998e-25  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.158377  hitchhiker  0.0000000861677 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1077  protein of unknown function DUF163  44.03 
 
 
154 aa  115  1.9999999999999998e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2907  rRNA large subunit methyltransferase  38.41 
 
 
156 aa  115  3e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0757  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
155 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00922876  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0683  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
155 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000302367  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0743  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
155 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000786877  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0801  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
155 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000227115  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0697  rRNA large subunit methyltransferase  38.99 
 
 
155 aa  115  3e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00566103  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3799  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 
155 aa  114  5e-25  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0474  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 
156 aa  114  7.999999999999999e-25  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0372612  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0986  rRNA large subunit methyltransferase  39.62 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1105  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
155 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.909306  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2934  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000178909  decreased coverage  0.00747753 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0233  hypothetical protein  38.04 
 
 
153 aa  112  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.585462  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1171  rRNA large subunit methyltransferase  38.36 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.195021  normal  0.132715 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12050  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0613288  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0433  rRNA large subunit methyltransferase  37.27 
 
 
166 aa  111  5e-24  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1544  hypothetical protein  36.48 
 
 
155 aa  110  6e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00441553  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1182  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
156 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.159956  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0613  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 
155 aa  110  7.000000000000001e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3149  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
156 aa  110  7.000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.788661  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4861  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 
155 aa  110  9e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.394825  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4808  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 
155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.24458 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3707  rRNA large subunit methyltransferase  33.96 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000116859  decreased coverage  0.000000222893 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2948  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0113814  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3020  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000384125  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1847  rRNA large subunit methyltransferase  36.48 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0406  hypothetical protein  36.48 
 
 
155 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.57756  normal  0.24642 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0700  rRNA large subunit methyltransferase  35.22 
 
 
156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00000000637083  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1420  hypothetical protein  38.12 
 
 
157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.290854 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4683  rRNA large subunit methyltransferase  35.85 
 
 
155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>