29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1974 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1974  hypothetical protein  100 
 
 
100 aa  204  3e-52  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344944  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2138  hypothetical protein  81.52 
 
 
95 aa  154  4e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00185054  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0791  hypothetical protein  36.36 
 
 
85 aa  56.6  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.00610853  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0132  hypothetical protein  39.47 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.12929  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0528  hypothetical protein  39.47 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0456568  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0515  hypothetical protein  39.47 
 
 
87 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000247738  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1612  hypothetical protein  37.5 
 
 
81 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0770  hypothetical protein  32.14 
 
 
81 aa  48.5  0.00003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.119581  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0039  protein of unknown function DUF1021  28.57 
 
 
85 aa  47  0.00008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0144278  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0403  protein of unknown function DUF1021  37.33 
 
 
78 aa  46.2  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0277649  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0597  hypothetical protein  37.18 
 
 
89 aa  45.8  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0037  protein of unknown function DUF1021  28.57 
 
 
85 aa  44.7  0.0004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0020  protein of unknown function DUF1021  34.21 
 
 
88 aa  45.1  0.0004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1548  hypothetical protein  34.72 
 
 
84 aa  44.3  0.0005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0038  hypothetical protein  34.25 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0041  veg protein  34.25 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0048  veg protein  34.25 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5268  veg protein  34.25 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.868803  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0048  veg protein  34.25 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.503705  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0042  veg protein  34.25 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0039  veg protein  34.25 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0041  veg protein  34.25 
 
 
86 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0052  veg protein  34.25 
 
 
86 aa  43.9  0.0008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0039  veg protein  32.88 
 
 
86 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0170  protein of unknown function DUF1021  32.88 
 
 
91 aa  41.6  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.105171  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0057  hypothetical protein  30.99 
 
 
91 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000870517 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0209  hypothetical protein  34.29 
 
 
79 aa  40.4  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000139685  normal  0.0119119 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2190  hypothetical protein  31.94 
 
 
78 aa  40  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.427413  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2480  hypothetical protein  31.94 
 
 
78 aa  40  0.01  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>