More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1950 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  82.55 
 
 		 426 aa  706    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 426 aa  877    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2228  histidyl-tRNA synthetase  62.97 
 
 		 430 aa  570  1e-161  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 433 aa  500  1e-140  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  55.06 
 
 		 425 aa  475  1e-133  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0859  histidyl-tRNA synthetase  53.97 
 
 		 428 aa  470  1.0000000000000001e-131  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  51.92 
 
 		 426 aa  452  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  52.4 
 
 		 423 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  50.35 
 
 		 423 aa  447  1.0000000000000001e-124  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  49.65 
 
 		 423 aa  442  1e-123  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 423 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 423 aa  444  1e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 423 aa  444  1e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 423 aa  444  1e-123  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 423 aa  443  1e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  50.49 
 
 		 423 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  49.88 
 
 		 419 aa  435  1e-121  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  47.63 
 
 		 424 aa  426  1e-118  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  50.12 
 
 		 419 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1830  histidyl-tRNA synthetase  49.41 
 
 		 433 aa  414  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  47.72 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0589  histidyl-tRNA synthetase  49.16 
 
 		 422 aa  405  1.0000000000000001e-112  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1721  histidyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000299078  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1688  histidyl-tRNA synthetase  48.92 
 
 		 420 aa  402  1e-111  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0106909  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  49.03 
 
 		 429 aa  395  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  47.2 
 
 		 423 aa  394  1e-108  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2038  histidyl-tRNA synthetase  46.63 
 
 		 420 aa  392  1e-108  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.292734  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  45.06 
 
 		 421 aa  392  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  46.37 
 
 		 419 aa  390  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 435 aa  390  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  46.38 
 
 		 420 aa  385  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  46.43 
 
 		 418 aa  380  1e-104  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  45.5 
 
 		 421 aa  380  1e-104  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  44.94 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 424 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  43.72 
 
 		 417 aa  369  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  46.39 
 
 		 430 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  44.77 
 
 		 419 aa  365  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  43.84 
 
 		 422 aa  367  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1435  histidyl-tRNA synthetase  46.27 
 
 		 423 aa  365  1e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.122406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 416 aa  364  1e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 416 aa  363  3e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  44.26 
 
 		 445 aa  363  4e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2357  histidyl-tRNA synthetase  44.71 
 
 		 414 aa  363  4e-99  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.99285  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3125  histidyl-tRNA synthetase  45 
 
 		 426 aa  362  8e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0624144  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 415 aa  361  1e-98  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  47.33 
 
 		 415 aa  360  2e-98  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  44.44 
 
 		 430 aa  359  6e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  43.86 
 
 		 413 aa  358  7e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2445  histidyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 414 aa  358  7e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.228667  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2048  Histidine--tRNA ligase  44.22 
 
 		 424 aa  358  9e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.167894  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  43.11 
 
 		 415 aa  358  9e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0735  histidyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 427 aa  358  9.999999999999999e-98  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0854  histidyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0897  histidyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.475429  hitchhiker  0.000000578873 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0884  histidyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 429 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.265271  normal  0.401715 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3013  histidyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 424 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0623  histidyl-tRNA synthetase  43.24 
 
 		 426 aa  357  2.9999999999999997e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  43.22 
 
 		 429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  41.33 
 
 		 414 aa  355  8.999999999999999e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2889  histidyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 424 aa  355  1e-96  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.731565  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2313  histidyl-tRNA synthetase  43.37 
 
 		 415 aa  355  1e-96  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.335262 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  44.53 
 
 		 423 aa  355  1e-96  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1259  histidyl-tRNA synthetase  41.13 
 
 		 424 aa  355  1e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.544922  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1119  histidyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 424 aa  354  1e-96  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  42.09 
 
 		 419 aa  355  1e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  41.04 
 
 		 424 aa  353  4e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02406  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.820666  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1154  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  352  5e-96  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.708603  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06491  histidyl-tRNA synthetase  42.51 
 
 		 426 aa  352  5e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1163  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  352  5e-96  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.878668  normal  0.0105907 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2665  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  352  5e-96  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0415954  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3738  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  352  5e-96  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2798  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  352  5e-96  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0241493  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02368  hypothetical protein  41.47 
 
 		 424 aa  352  5e-96  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.965235  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2666  histidyl-tRNA synthetase  41.47 
 
 		 424 aa  352  5e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.557016  normal  0.28458 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1294  histidyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 424 aa  351  1e-95  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0289  histidyl-tRNA synthetase  43.91 
 
 		 422 aa  351  1e-95  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4600  histidyl-tRNA synthetase  42.62 
 
 		 429 aa  351  1e-95  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0417  histidyl-tRNA synthetase  42.18 
 
 		 424 aa  351  1e-95  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00143012 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  43.18 
 
 		 413 aa  350  2e-95  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 421 aa  350  3e-95  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2673  histidyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 424 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06791  histidyl-tRNA synthetase  42.27 
 
 		 426 aa  349  4e-95  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3008  histidyl-tRNA synthetase  41.23 
 
 		 424 aa  349  4e-95  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2760  histidyl-tRNA synthetase  40.9 
 
 		 424 aa  349  4e-95  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.580022 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1187  histidyl-tRNA synthetase  41.94 
 
 		 424 aa  348  9e-95  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.557803  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 415 aa  348  1e-94  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2890  histidyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.112536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1249  histidyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 429 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0462121  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  43.69 
 
 		 423 aa  347  2e-94  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  42.11 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2716  histidyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 424 aa  347  2e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  43.48 
 
 		 411 aa  347  2e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  40.76 
 
 		 424 aa  347  3e-94  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2779  histidyl-tRNA synthetase  40.66 
 
 		 424 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>