More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1895 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1895  50S ribosomal protein L5  100 
 
 
180 aa  362  2e-99  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000163356  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0070  50S ribosomal protein L5  95.56 
 
 
180 aa  350  7e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.488123  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2390  50S ribosomal protein L5  87.22 
 
 
180 aa  326  9e-89  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000832727  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1471  50S ribosomal protein L5  77.22 
 
 
180 aa  293  7e-79  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000027583  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0119  50S ribosomal protein L5  78.09 
 
 
179 aa  292  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0208  50S ribosomal protein L5  74.44 
 
 
180 aa  286  9e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2265  50S ribosomal protein L5  78.09 
 
 
179 aa  285  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00132272  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0607  50S ribosomal protein L5  73.89 
 
 
180 aa  286  2e-76  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000230236  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0303  50S ribosomal protein L5  73.89 
 
 
180 aa  285  2e-76  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0918778  unclonable  1.5322100000000002e-28 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2306  50S ribosomal protein L5  78.09 
 
 
179 aa  285  2e-76  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00313059  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0123  50S ribosomal protein L5  76.97 
 
 
179 aa  284  4e-76  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0122  50S ribosomal protein L5  76.4 
 
 
179 aa  282  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000110602  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0122  50S ribosomal protein L5  76.4 
 
 
179 aa  282  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000142561  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0122  50S ribosomal protein L5  76.4 
 
 
179 aa  282  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000641034  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0153  50S ribosomal protein L5  76.4 
 
 
179 aa  282  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0116  50S ribosomal protein L5  76.4 
 
 
179 aa  282  2.0000000000000002e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000121875  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0118  50S ribosomal protein L5  75.84 
 
 
179 aa  280  6.000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000024971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0116  50S ribosomal protein L5  75.84 
 
 
179 aa  280  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000167515  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0143  50S ribosomal protein L5  75.84 
 
 
179 aa  280  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000984973  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0134  50S ribosomal protein L5  75.84 
 
 
179 aa  280  6.000000000000001e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  7.52131e-62 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1819  50S ribosomal protein L5  75.84 
 
 
179 aa  280  9e-75  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.160424  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5183  50S ribosomal protein L5  75.84 
 
 
179 aa  280  9e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000305231  unclonable  1.92416e-25 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0117  50S ribosomal protein L5  75.28 
 
 
179 aa  278  2e-74  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000973841  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2915  50S ribosomal protein L5  69.49 
 
 
182 aa  267  8e-71  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2702  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 
179 aa  264  4e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2387  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 
179 aa  264  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0434  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 
179 aa  262  2e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000357124  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2448  50S ribosomal protein L5  67.43 
 
 
180 aa  259  1e-68  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.449269 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1512  ribosomal protein L5  69.71 
 
 
183 aa  258  3e-68  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.527961  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0879  50S ribosomal protein L5  66.85 
 
 
179 aa  257  7e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.273914  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0332  50S ribosomal protein L5  65.54 
 
 
179 aa  256  1e-67  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.0000306823  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0298  ribosomal protein L5  66.29 
 
 
180 aa  256  1e-67  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000000255601  normal  0.102158 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2321  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 
178 aa  256  1e-67  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.000058995  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0770  50S ribosomal protein L5  64.97 
 
 
180 aa  254  3e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000253341  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00742  50S ribosomal protein L5  64.41 
 
 
179 aa  254  5e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0227  50S ribosomal protein L5  65.54 
 
 
181 aa  253  1.0000000000000001e-66  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000836347  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2699  ribosomal protein L5  64.97 
 
 
179 aa  253  1.0000000000000001e-66  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2845  50S ribosomal protein L5  66.86 
 
 
179 aa  251  3e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.136132  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3655  50S ribosomal protein L5  66.67 
 
 
179 aa  251  3e-66  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000538083  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2162  50S ribosomal protein L5  63.28 
 
 
179 aa  251  4.0000000000000004e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000000313261  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001730  LSU ribosomal protein L5p (L11e)  62.71 
 
 
179 aa  249  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000273991  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1078  50S ribosomal protein L5  65.14 
 
 
179 aa  249  2e-65  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0364811  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2806  50S ribosomal protein L5  62.29 
 
 
192 aa  249  2e-65  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.452001  normal  0.44759 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0638  50S ribosomal protein L5  64 
 
 
179 aa  248  4e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000002891  hitchhiker  0.0000000142331 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1733  ribosomal protein L5  62.57 
 
 
180 aa  248  5e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000736649  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3739  50S ribosomal protein L5P  62.15 
 
 
179 aa  247  7e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000568765  hitchhiker  0.00392049 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0945  50S ribosomal protein L5  65.71 
 
 
179 aa  246  1e-64  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0195859  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1238  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 
220 aa  246  1e-64  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.467467  hitchhiker  0.000847503 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1855  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 
179 aa  246  1e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.215848  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2143  50S ribosomal protein L5  65.14 
 
 
180 aa  246  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.244881  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0692  50S ribosomal protein L5  66.29 
 
 
179 aa  246  1e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.182498  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0417  ribosomal protein L5  61.58 
 
 
179 aa  246  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.000637588  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2571  50S ribosomal protein L5  61.93 
 
 
182 aa  245  3e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3316  50S ribosomal protein L5  65.14 
 
 
179 aa  244  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000267314 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1358  50S ribosomal protein L5  63.43 
 
 
179 aa  244  4e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000000713607  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0993  50S ribosomal protein L5  64.77 
 
 
179 aa  244  4e-64  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.188772  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1562  ribosomal protein L5  65.56 
 
 
180 aa  244  4e-64  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00268047  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0237  ribosomal protein L5  62.64 
 
 
180 aa  244  4.9999999999999997e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.588088  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0731  50S ribosomal protein L5  61.36 
 
 
179 aa  244  6e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00207885  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0703  50S ribosomal protein L5  61.02 
 
 
182 aa  243  8e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000000777115  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0237  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
180 aa  243  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.922109 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0240  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
180 aa  243  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3715  50S ribosomal protein L5  58.89 
 
 
180 aa  243  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1567  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  242  1.9999999999999999e-63  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3624  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000000960301  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3732  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0475697  normal  0.0194704 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3697  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000182939  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4014  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 
180 aa  241  3.9999999999999997e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00014513  hitchhiker  0.0000181617 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3624  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.000930132  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3795  50S ribosomal protein L5  60.45 
 
 
179 aa  241  3.9999999999999997e-63  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0138381  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl135  50S ribosomal protein L5  62.78 
 
 
180 aa  241  5e-63  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1923  50S ribosomal protein L5  60.11 
 
 
180 aa  240  7e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.360867 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0072  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  240  7e-63  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000153515  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0211  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  240  7e-63  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000226613  unclonable  0.0000000000144866 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0206  50S ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  240  7e-63  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000474066  hitchhiker  0.00760067 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0335  ribosomal protein L5  59.32 
 
 
179 aa  240  7e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000137819  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1273  ribosomal protein L5  64.97 
 
 
184 aa  239  2e-62  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0243  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  239  2e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0211  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  239  2e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000150399  hitchhiker  0.00000000169962 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3012  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 
180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0815277  hitchhiker  0.00971192 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1304  50S ribosomal protein L5  59.55 
 
 
180 aa  238  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604119  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1341  50S ribosomal protein L5  62.86 
 
 
193 aa  238  4e-62  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.156081 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3512  50S ribosomal protein L5  59.89 
 
 
179 aa  238  4e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.0000147954  hitchhiker  0.00000011465 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2676  50S ribosomal protein L5  61.58 
 
 
179 aa  238  5e-62  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.365679  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4264  ribosomal protein L5  61.02 
 
 
179 aa  237  5.999999999999999e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000000140666  unclonable  0.00000000000331495 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1934  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 
180 aa  237  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1945  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 
180 aa  237  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2030  50S ribosomal protein L5  58.99 
 
 
180 aa  237  5.999999999999999e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0708246  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0433  50S ribosomal protein L5  57.78 
 
 
179 aa  237  6.999999999999999e-62  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0138752  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23350  LSU ribosomal protein L5P  59.89 
 
 
181 aa  237  6.999999999999999e-62  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000205512  hitchhiker  0.000000148901 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1261  50S ribosomal protein L5  60.57 
 
 
193 aa  236  9e-62  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.479244  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1149  ribosomal protein L5  61.58 
 
 
186 aa  236  1e-61  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.000000871662  hitchhiker  0.000556767 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1352  ribosomal protein L5  58.33 
 
 
193 aa  236  1e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0713  50S ribosomal protein L5  60.56 
 
 
184 aa  236  1e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000209145  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4678  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  236  1e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000391972  unclonable  0.0000000125829 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0170  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  235  2e-61  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000106117  hitchhiker  0.000364727 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0196  50S ribosomal protein L5  58.76 
 
 
179 aa  235  2e-61  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000388699  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3747  50S ribosomal protein L5  58.19 
 
 
179 aa  235  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.000000000384321  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3150  50S ribosomal protein L5  63.89 
 
 
184 aa  236  2e-61  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.624164 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3000  50S ribosomal protein L5  57.3 
 
 
181 aa  235  2e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.414556  hitchhiker  0.00644408 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>