More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1887 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0078  preprotein translocase subunit SecY  81.8 
 
 
434 aa  721    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0917629  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1887  preprotein translocase subunit SecY  100 
 
 
431 aa  857    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.729916  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2381  preprotein translocase subunit SecY  66.28 
 
 
439 aa  592  1e-168  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00042664  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1463  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  52.09 
 
 
438 aa  456  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000110167  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0310  preprotein translocase subunit SecY  52.09 
 
 
431 aa  447  1.0000000000000001e-124  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  8.823840000000001e-28 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0215  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  47.56 
 
 
444 aa  421  1e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0127  preprotein translocase subunit SecY  49.3 
 
 
430 aa  410  1e-113  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0130  preprotein translocase subunit SecY  48.73 
 
 
433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0066731  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0130  preprotein translocase subunit SecY  48.73 
 
 
433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00164171  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0126  preprotein translocase subunit SecY  48.73 
 
 
433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0265701  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0124  preprotein translocase subunit SecY  48.73 
 
 
433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.64549  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0131  preprotein translocase subunit SecY  48.6 
 
 
430 aa  408  1.0000000000000001e-112  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.129381  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0130  preprotein translocase subunit SecY  48.73 
 
 
433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00952483  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0125  preprotein translocase subunit SecY  48.73 
 
 
433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00395698  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5175  preprotein translocase subunit SecY  48.73 
 
 
433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000485174  unclonable  4.1263e-25 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0161  preprotein translocase subunit SecY  48.73 
 
 
433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000198533  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0151  preprotein translocase subunit SecY  48.73 
 
 
433 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0158065  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2469  preprotein translocase subunit SecY  48.15 
 
 
434 aa  395  1e-109  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0545369  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0614  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  48.28 
 
 
448 aa  397  1e-109  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00397866  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2547  preprotein translocase subunit SecY  47.92 
 
 
434 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0673869  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2747  preprotein translocase subunit SecY  48.15 
 
 
434 aa  392  1e-108  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.787541  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2734  preprotein translocase subunit SecY  47.92 
 
 
434 aa  392  1e-108  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.356112  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2412  preprotein translocase subunit SecY  48.15 
 
 
434 aa  394  1e-108  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00625491  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2766  preprotein translocase subunit SecY  47.45 
 
 
434 aa  390  1e-107  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00224272  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2503  preprotein translocase subunit SecY  47.92 
 
 
434 aa  391  1e-107  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000332806  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2545  preprotein translocase subunit SecY  47.92 
 
 
434 aa  391  1e-107  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000778926 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0124  preprotein translocase subunit SecY  48.27 
 
 
433 aa  389  1e-107  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000327784  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2742  preprotein translocase subunit SecY  47.92 
 
 
434 aa  391  1e-107  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.53667e-23 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2790  preprotein translocase subunit SecY  47.22 
 
 
434 aa  379  1e-104  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000168645  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1843  preprotein translocase subunit SecY  47.26 
 
 
434 aa  375  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.019643  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2298  preprotein translocase subunit SecY  45.65 
 
 
430 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2257  preprotein translocase subunit SecY  45.65 
 
 
430 aa  364  2e-99  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0110363  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1811  preprotein translocase subunit SecY  46.17 
 
 
430 aa  362  8e-99  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.741103  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2691  preprotein translocase, SecY subunit  42.82 
 
 
430 aa  337  1.9999999999999998e-91  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.803147  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0142  preprotein translocase, SecY subunit  49.57 
 
 
355 aa  320  3e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.58947e-61 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0245  preprotein translocase subunit SecY  39.08 
 
 
424 aa  310  2.9999999999999997e-83  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.101058  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0214  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  40.93 
 
 
419 aa  303  3.0000000000000004e-81  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.32801  normal  0.494063 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1726  preprotein translocase, SecY subunit  39.27 
 
 
435 aa  300  5e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000716119  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0306  preprotein translocase subunit SecY  40.6 
 
 
421 aa  299  8e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0894763  normal  0.194972 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0235  preprotein translocase subunit SecY  40 
 
 
419 aa  298  2e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00849669  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2440  preprotein translocase subunit SecY  40.37 
 
 
420 aa  297  3e-79  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0442  preprotein translocase subunit SecY  40.9 
 
 
429 aa  295  1e-78  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2313  preprotein translocase subunit SecY  39.11 
 
 
421 aa  294  3e-78  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0367996  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4301  preprotein translocase, SecY subunit  36.38 
 
 
432 aa  293  4e-78  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0517  preprotein translocase, SecY subunit  37.3 
 
 
443 aa  292  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  unclonable  0.0000000000266535 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0347  preprotein translocase, SecY subunit  37.3 
 
 
443 aa  292  1e-77  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.742267  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1009  preprotein translocase subunit SecY  39.39 
 
 
439 aa  290  4e-77  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00114462  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0867  protein translocase subunit secY/sec61 alpha  38.71 
 
 
442 aa  289  5.0000000000000004e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000152006  hitchhiker  0.00837403 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0233  preprotein translocase subunit SecY  39.53 
 
 
446 aa  288  1e-76  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000181445  unclonable  0.0000105897 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00958  preprotein translocase subunit SecY  39.15 
 
 
434 aa  288  2e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0058755  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0621  preprotein translocase subunit SecY  40.83 
 
 
439 aa  287  2.9999999999999996e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.468859  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3889  preprotein translocase subunit SecY  37.32 
 
 
442 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.000822061  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0646  preprotein translocase, SecY subunit  36.85 
 
 
444 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.617938  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4528  preprotein translocase subunit SecY  36.85 
 
 
444 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.447133  normal  0.242735 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5059  preprotein translocase subunit SecY  37.32 
 
 
442 aa  286  5.999999999999999e-76  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000898122  normal  0.284155 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0507  preprotein translocase subunit SecY  36.85 
 
 
443 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0640452  normal  0.0135524 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4729  preprotein translocase subunit SecY  36.85 
 
 
443 aa  286  7e-76  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0376135  normal  0.430849 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1504  preprotein translocase subunit SecY  38.89 
 
 
419 aa  285  9e-76  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0739  preprotein translocase subunit SecY  37.24 
 
 
440 aa  285  9e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00521081  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0309  preprotein translocase subunit SecY  35.48 
 
 
443 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0197098  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1926  preprotein translocase, SecY subunit  37.5 
 
 
449 aa  285  1.0000000000000001e-75  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.796685  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4298  preprotein translocase subunit SecY  38.88 
 
 
446 aa  285  1.0000000000000001e-75  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000258427  unclonable  0.0000000000837901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0474  preprotein translocase subunit SecY  36.85 
 
 
443 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.733359  hitchhiker  0.00000433507 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0504  preprotein translocase subunit SecY  36.85 
 
 
443 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390206  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0178  preprotein translocase subunit SecY  38.69 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000408952  hitchhiker  0.00214614 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0778  preprotein translocase, SecY subunit  39.35 
 
 
430 aa  284  2.0000000000000002e-75  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000100686  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4670  preprotein translocase subunit SecY  38.64 
 
 
446 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000509869  unclonable  0.0000000121988 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0857  preprotein translocase subunit SecY  37.56 
 
 
442 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09050  preprotein translocase subunit SecY  37.56 
 
 
442 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.224184 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2305  preprotein translocase subunit SecY  39.95 
 
 
437 aa  283  4.0000000000000003e-75  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0622  preprotein translocase, SecY subunit  38.25 
 
 
444 aa  283  4.0000000000000003e-75  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.925436 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1856  preprotein translocase, SecY subunit  37 
 
 
446 aa  283  4.0000000000000003e-75  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0112849  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2198  preprotein translocase, SecY subunit  38.6 
 
 
448 aa  282  6.000000000000001e-75  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0470035  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0401  preprotein translocase subunit SecY  40.2 
 
 
439 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1831  preprotein translocase subunit SecY  36.01 
 
 
443 aa  282  7.000000000000001e-75  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.321149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0393  preprotein translocase subunit SecY  40.2 
 
 
439 aa  282  7.000000000000001e-75  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0413341  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1634  preprotein translocase subunit SecY  37.99 
 
 
452 aa  281  1e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0116955  normal  0.0410443 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2158  preprotein translocase, SecY subunit  39.58 
 
 
426 aa  281  1e-74  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00470545  normal  0.460281 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1106  protein translocase subunit SecY/sec61 alpha  36.4 
 
 
438 aa  281  1e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.105713 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1931  preprotein translocase subunit SecY  39.35 
 
 
445 aa  281  1e-74  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.776856  normal  0.537809 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01360  preprotein translocase, SecY subunit  39.4 
 
 
422 aa  281  2e-74  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000700723  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0080  preprotein translocase subunit SecY  38.33 
 
 
441 aa  281  2e-74  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0404503  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0168  preprotein translocase subunit SecY  38.23 
 
 
446 aa  281  2e-74  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000114541  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0607  preprotein translocase, SecY subunit  36.64 
 
 
429 aa  281  2e-74  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0598508  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0340  preprotein translocase subunit SecY  38.5 
 
 
443 aa  281  2e-74  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00542322  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0425  preprotein translocase subunit SecY  38.05 
 
 
437 aa  280  3e-74  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.65116  normal  0.157207 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0721  preprotein translocase subunit SecY  37.39 
 
 
435 aa  280  3e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1042  preprotein translocase subunit SecY  40.2 
 
 
439 aa  280  3e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0718  preprotein translocase subunit SecY  36.81 
 
 
448 aa  280  3e-74  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.214912  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2986  preprotein translocase subunit SecY  36.6 
 
 
448 aa  280  5e-74  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.135734  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4223  preprotein translocase subunit SecY  40.69 
 
 
436 aa  280  5e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0505149  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2403  preprotein translocase subunit SecY  36.7 
 
 
443 aa  280  5e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0193161  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0886  preprotein translocase subunit SecY  37.88 
 
 
418 aa  279  7e-74  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.609907  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2044  preprotein translocase subunit SecY  36.7 
 
 
441 aa  279  7e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00113194  normal  0.318737 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001722  preprotein translocase SecY subunit  37.76 
 
 
444 aa  278  1e-73  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000228975  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00750  preprotein translocase subunit SecY  37.76 
 
 
444 aa  278  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3885  preprotein translocase subunit SecY  36.12 
 
 
437 aa  278  1e-73  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1834  preprotein translocase subunit SecY  38.93 
 
 
442 aa  278  2e-73  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00171083  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0190  preprotein translocase subunit SecY  38.69 
 
 
446 aa  278  2e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000711222  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0219  preprotein translocase subunit SecY  38.23 
 
 
446 aa  277  2e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000110874  hitchhiker  0.00000000176689 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>