More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1803 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004116  SAG0110  DNA repair protein RadA  92.7 
 
 		 454 aa  780    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.242522  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2361  DNA repair protein RadA  81.95 
 
 		 453 aa  692    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1803  DNA repair protein RadA  100 
 
 		 415 aa  835    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0157  DNA repair protein RadA  68.98 
 
 		 408 aa  579  1e-164  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0301  DNA repair protein RadA  66.83 
 
 		 457 aa  568  1e-161  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0077  DNA repair protein RadA  65.91 
 
 		 458 aa  548  1e-155  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0078  DNA repair protein RadA  64.76 
 
 		 458 aa  545  1e-154  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0103  DNA repair protein RadA  65.66 
 
 		 458 aa  545  1e-154  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00530334  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0077  DNA repair protein RadA  65.01 
 
 		 458 aa  546  1e-154  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5223  DNA repair protein RadA  65.66 
 
 		 458 aa  547  1e-154  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00190969  unclonable  1.94383e-25 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0082  DNA repair protein RadA  65.41 
 
 		 458 aa  544  1e-153  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0082  DNA repair protein RadA  65.41 
 
 		 458 aa  544  1e-153  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0079  DNA repair protein RadA  65.41 
 
 		 458 aa  544  1e-153  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0112  DNA repair protein RadA  65.41 
 
 		 458 aa  544  1e-153  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.328977  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0081  DNA repair protein RadA  65.41 
 
 		 458 aa  544  1e-153  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0084  DNA repair protein RadA  65.5 
 
 		 457 aa  541  1e-153  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.391084  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0092  DNA repair protein RadA  65.41 
 
 		 458 aa  544  1e-153  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.92971e-61 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0080  DNA repair protein RadA  65.84 
 
 		 484 aa  541  9.999999999999999e-153  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0318  DNA repair protein RadA  63.24 
 
 		 470 aa  531  1e-149  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0336  DNA repair protein RadA  60.19 
 
 		 459 aa  527  1e-148  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000102144 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0548  DNA repair protein RadA  63.45 
 
 		 454 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0562  DNA repair protein RadA  63.45 
 
 		 454 aa  510  1e-143  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0166  DNA repair protein RadA  61.77 
 
 		 457 aa  499  1e-140  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0285  DNA repair protein RadA  55.75 
 
 		 450 aa  450  1e-125  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0463822  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3277  DNA repair protein RadA  55.53 
 
 		 449 aa  446  1.0000000000000001e-124  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.142573  normal  0.6246 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1786  DNA repair protein RadA  53.41 
 
 		 454 aa  442  1e-123  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000301687  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2764  DNA repair protein RadA  53.98 
 
 		 460 aa  444  1e-123  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000385269  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2739  DNA repair protein RadA  53.03 
 
 		 448 aa  444  1e-123  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0390  DNA repair protein RadA  54.27 
 
 		 449 aa  434  1e-120  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0198908  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2341  DNA repair protein RadA  51.88 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2490  DNA repair protein RadA  52.37 
 
 		 489 aa  429  1e-119  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.858464  normal  0.0874227 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0130  DNA repair protein RadA  53.77 
 
 		 453 aa  430  1e-119  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000766532  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0422  DNA repair protein RadA  54.11 
 
 		 448 aa  427  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00757431  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0400  DNA repair protein RadA  53.9 
 
 		 450 aa  422  1e-117  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000197198  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2065  DNA repair protein RadA  52.66 
 
 		 446 aa  423  1e-117  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0567358  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0182  DNA repair protein RadA  56.42 
 
 		 449 aa  420  1e-116  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0878  DNA repair protein RadA  51.9 
 
 		 457 aa  415  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0836  DNA repair protein RadA  49.87 
 
 		 457 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0984957  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00880  DNA repair protein RadA  50.75 
 
 		 451 aa  416  9.999999999999999e-116  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.00000000000000121912  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3459  DNA repair protein RadA  53.67 
 
 		 452 aa  412  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.261832  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0184  DNA repair protein RadA  52 
 
 		 476 aa  414  1e-114  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00274159  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3255  DNA repair protein RadA  49.76 
 
 		 465 aa  412  1e-114  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4772  DNA repair protein RadA  50.5 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000283378 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0256  DNA repair protein RadA  51.7 
 
 		 457 aa  409  1e-113  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00319082  normal  0.307702 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0125  DNA repair protein RadA  48.88 
 
 		 458 aa  409  1e-113  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0263  DNA repair protein RadA  50.52 
 
 		 452 aa  409  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.992448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0828  DNA repair protein RadA  50.5 
 
 		 453 aa  405  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0373  DNA repair protein RadA  51.21 
 
 		 452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0711643  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1877  DNA repair protein RadA  48.94 
 
 		 507 aa  407  1.0000000000000001e-112  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.647793 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0584  DNA repair protein RadA  47.88 
 
 		 518 aa  407  1.0000000000000001e-112  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.50622  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01480  putative DNA repair protein  49.25 
 
 		 453 aa  402  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_58  DNA repair protein RadA  50.49 
 
 		 462 aa  399  9.999999999999999e-111  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3614  DNA repair protein RadA  50.25 
 
 		 455 aa  400  9.999999999999999e-111  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.356128  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4206  DNA repair protein RadA  46.59 
 
 		 520 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1707  DNA repair protein RadA  49.39 
 
 		 453 aa  401  9.999999999999999e-111  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0112208  normal  0.59861 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2303  DNA repair protein RadA  47.56 
 
 		 514 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0182  DNA repair protein RadA  50.6 
 
 		 445 aa  396  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.28154  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2354  DNA repair protein RadA  47.56 
 
 		 514 aa  395  1e-109  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.561638  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0058  DNA repair protein RadA  50.49 
 
 		 462 aa  394  1e-108  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0052  DNA repair protein RadA  50.86 
 
 		 464 aa  392  1e-108  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.980062  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0506  DNA repair protein RadA  50.25 
 
 		 461 aa  394  1e-108  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.382346  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3455  DNA repair protein RadA  50.86 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0603  DNA repair protein RadA  47.88 
 
 		 462 aa  392  1e-108  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.981961  normal  0.107382 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1348  DNA repair protein RadA  53.98 
 
 		 460 aa  392  1e-108  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0396  DNA repair protein RadA  51.43 
 
 		 443 aa  391  1e-107  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0956  DNA repair protein RadA  46.94 
 
 		 517 aa  390  1e-107  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0419823 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2366  DNA repair protein RadA  49 
 
 		 451 aa  389  1e-107  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000262714  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0227  DNA repair protein RadA  47.89 
 
 		 461 aa  386  1e-106  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1732  DNA repair protein RadA  52.22 
 
 		 462 aa  388  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0794111 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1168  DNA repair protein RadA  49.12 
 
 		 463 aa  388  1e-106  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.215526 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2017  DNA repair protein RadA  50.74 
 
 		 464 aa  386  1e-106  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.404277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4466  DNA repair protein RadA  46.56 
 
 		 468 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1452  DNA repair protein RadA  50.81 
 
 		 478 aa  382  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00987951 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2129  DNA repair protein RadA  48.02 
 
 		 454 aa  384  1e-105  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.124782  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01471  DNA repair protein RadA  50.4 
 
 		 461 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3606  DNA repair protein RadA  50.62 
 
 		 462 aa  381  1e-104  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1987  DNA repair protein RadA  48.04 
 
 		 453 aa  379  1e-104  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.355792 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2711  DNA repair protein RadA  47.76 
 
 		 454 aa  380  1e-104  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1499  DNA repair protein RadA  51.27 
 
 		 459 aa  379  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02051  DNA repair protein RadA  51.27 
 
 		 459 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.169271  normal  0.619218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0470  DNA repair protein RadA  47.75 
 
 		 472 aa  378  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.435063  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0729  DNA repair protein RadA  50.66 
 
 		 467 aa  373  1e-102  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.634843 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3485  DNA repair protein RadA  51.69 
 
 		 474 aa  372  1e-102  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.692018 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2129  DNA repair protein RadA  49.87 
 
 		 455 aa  374  1e-102  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.875143  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3538  DNA repair protein RadA  50.62 
 
 		 462 aa  374  1e-102  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2430  DNA repair protein RadA  49.37 
 
 		 453 aa  372  1e-102  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0571  DNA repair protein RadA  50.38 
 
 		 494 aa  368  1e-101  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9143  DNA repair protein RadA  46.65 
 
 		 466 aa  371  1e-101  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4999  DNA repair protein RadA  52.15 
 
 		 483 aa  371  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.412289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2456  DNA repair protein RadA  49.87 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0309  DNA repair protein RadA  49.73 
 
 		 465 aa  369  1e-101  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.503927  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1119  DNA repair protein RadA  49.87 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.340586 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2606  DNA repair protein RadA  46.7 
 
 		 460 aa  370  1e-101  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2743  DNA repair protein RadA  49.37 
 
 		 453 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0589  DNA repair protein RadA  48.25 
 
 		 451 aa  369  1e-101  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.268839  hitchhiker  1.37134e-16 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3412  DNA repair protein RadA  47.35 
 
 		 475 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.176098  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1507  DNA repair protein RadA  50.42 
 
 		 466 aa  367  1e-100  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0776  DNA repair protein RadA  49.46 
 
 		 448 aa  366  1e-100  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01611  DNA repair protein RadA  48.94 
 
 		 450 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.821199  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0135  DNA repair protein RadA  46.39 
 
 		 449 aa  365  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>