More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1694 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1694  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 
529 aa  1059    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0047408  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2552  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.93 
 
 
524 aa  172  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000541437  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0552  ABC transporter, ATP-binding protein  24.52 
 
 
588 aa  153  5.9999999999999996e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000126297 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1355  ABC transporter related  26.46 
 
 
546 aa  149  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0799142  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1365  ABC transporter related  25.46 
 
 
577 aa  148  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0358  ABC transporter related  27.31 
 
 
572 aa  146  1e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1056  ABC transporter related  25 
 
 
546 aa  143  6e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000469517  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3863  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  24.54 
 
 
736 aa  144  6e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.779093  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0568  ABC transporter related  26.46 
 
 
578 aa  137  4e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1274  ABC transporter related protein  25.71 
 
 
572 aa  131  4.0000000000000003e-29  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0134  ABC transporter related  24.95 
 
 
574 aa  131  4.0000000000000003e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0215  ABC transporter related  27.31 
 
 
530 aa  130  9.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2197  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  24.91 
 
 
627 aa  129  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl168  unknown substrate ABC transporter permease component  24.54 
 
 
530 aa  128  3e-28  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1342  ABC transporter related  25 
 
 
671 aa  127  3e-28  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0813  ABC transporter, ATP-binding protein/permease  24.49 
 
 
528 aa  126  8.000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00386251  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2781  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  23.95 
 
 
609 aa  124  4e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000466613  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0336  ABC transporter related  24.43 
 
 
541 aa  124  6e-27  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16410  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.19 
 
 
671 aa  123  7e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.623342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5285  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.8 
 
 
571 aa  123  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1055  ABC transporter related  23.78 
 
 
554 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000118268  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1958  ABC transporter-like protein  24.44 
 
 
636 aa  121  3e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.169751 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0005  type I secretion system ATPase  28.92 
 
 
738 aa  121  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.4635  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0812  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.04 
 
 
537 aa  120  4.9999999999999996e-26  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000243426  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1921  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  27.78 
 
 
522 aa  119  9e-26  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.684588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1777  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  24.53 
 
 
573 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00514902  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0084  bacteriocin-processing peptidase  26.98 
 
 
715 aa  119  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2075  ABC transporter related protein  23.68 
 
 
632 aa  118  1.9999999999999998e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3593  ABC transporter related  22.04 
 
 
624 aa  118  1.9999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0413499  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5268  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.36 
 
 
571 aa  118  3e-25  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4860  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.36 
 
 
571 aa  118  3e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.201042  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4875  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding and permease  26.36 
 
 
571 aa  118  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.259113  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4974  ABC transporter related  26.58 
 
 
571 aa  118  3e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5298  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.36 
 
 
571 aa  118  3e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5658  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.58 
 
 
571 aa  118  3e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  25.48 
 
 
760 aa  118  3e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1938  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25 
 
 
593 aa  118  3e-25  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5030  ABC transporter ATP-binding/permease  26.36 
 
 
571 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487117  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5411  ABC transporter permease/ATP-binding protein  26.36 
 
 
571 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5343  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.36 
 
 
571 aa  117  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_14311  hypothetical protein  27.95 
 
 
968 aa  117  3.9999999999999997e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0047  ABC transporter related  25.67 
 
 
580 aa  117  5e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00438981  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1829  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  25.65 
 
 
525 aa  117  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000147985  normal  0.205804 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1305  ABC transporter related  25.06 
 
 
598 aa  117  6e-25  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0351  ABC transporter related protein  27.43 
 
 
526 aa  116  7.999999999999999e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1050  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  22.14 
 
 
609 aa  116  8.999999999999998e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.718087  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0988  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  22.14 
 
 
591 aa  116  8.999999999999998e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0685  ABC transporter-related protein  29.15 
 
 
584 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0583  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25.95 
 
 
586 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1718  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  26.81 
 
 
563 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.066866  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4793  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.38 
 
 
586 aa  116  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.646278  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2882  ABC transporter related protein  26.14 
 
 
600 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00823072  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5708  ABC transporter related  26.25 
 
 
764 aa  116  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.920431  normal  0.127768 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1525  ABC transporter related  24.95 
 
 
581 aa  115  1.0000000000000001e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.628149  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2733  ABC transporter related  22.83 
 
 
631 aa  116  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.021846  normal  0.190322 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2187  ABC transporter related  28.47 
 
 
595 aa  116  1.0000000000000001e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18960  ABC transporter related  24.04 
 
 
556 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1158  ABC-type multidrug transport system ATPase and permease components  24.47 
 
 
614 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0064562  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3528  ABC transporter related  28.17 
 
 
589 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  25.48 
 
 
597 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0584  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.15 
 
 
586 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0444  ABC transporter related  25.56 
 
 
586 aa  115  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0439  ABC transporter ATP-binding and permease; multidrug resistance protein  26.15 
 
 
586 aa  114  3e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.214785  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0511  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  26.15 
 
 
586 aa  114  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3857  ABC transporter related protein  21.75 
 
 
640 aa  114  4.0000000000000004e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.087772  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0945  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.28 
 
 
586 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.580157 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0316  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.22 
 
 
529 aa  114  5e-24  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000154446  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0758  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein and permease  28.28 
 
 
586 aa  114  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1715  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  39.75 
 
 
579 aa  114  5e-24  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.989561  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0906  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.28 
 
 
586 aa  114  5e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.000129836  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0818  ABC transporter related  28 
 
 
569 aa  114  6e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.153053  normal  0.572134 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1033  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.28 
 
 
586 aa  114  6e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000502591  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0124  ABC transporter related  25.38 
 
 
573 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1244  ABC transporter related  22.85 
 
 
589 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000217275  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0471  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  24.3 
 
 
593 aa  113  7.000000000000001e-24  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0344277  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0809  ABC transporter ATP-binding/permease  28.28 
 
 
586 aa  113  9e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00766142  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0852  ABC transporter permease/ATP-binding protein  28.28 
 
 
586 aa  113  9e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16330  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  21.57 
 
 
622 aa  112  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.867591  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0496  ABC transporter ATP-binding/permease  25.95 
 
 
586 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.384636  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1213  type I secretion system ATPase  27.27 
 
 
738 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.466678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0688  ABC transporter related  24.75 
 
 
559 aa  112  1.0000000000000001e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0528  ABC transporter permease/ATP-binding protein  25.95 
 
 
586 aa  113  1.0000000000000001e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.249641  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0994  ABC transporter related  28.57 
 
 
652 aa  113  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0989062  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1653  bacteriocin/lantibiotic ABC transporter  27.08 
 
 
722 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.521591  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1983  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  35.75 
 
 
579 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3277  ABC transporter CydDC cysteine exporter (CydDC- E) family permease/ATP-binding protein CydC  26.81 
 
 
559 aa  113  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3183  ABC transporter related protein  23.86 
 
 
615 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0496576  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0416  cyclic nucleotide-binding protein  23.22 
 
 
600 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1216  transport ATP-binding protein CydC  33.52 
 
 
548 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.257864  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2511  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  25 
 
 
555 aa  112  2.0000000000000002e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000220967  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0942  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  26.9 
 
 
586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.785069  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0830  ABC transporter related  29.5 
 
 
612 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000934514 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2633  ABC transporter-related protein  32.82 
 
 
547 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000348658  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1339  ABC transporter related  25.45 
 
 
572 aa  112  2.0000000000000002e-23  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.491462  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0838  ABC transporter related  22.2 
 
 
640 aa  112  2.0000000000000002e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2443  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  28.57 
 
 
573 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0221682  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4432  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  28.28 
 
 
548 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000325117  normal  0.0473884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1010  ABC transporter related  23.51 
 
 
639 aa  112  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0384863 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2235  cysteine/glutathione ABC transporter membrane/ATP-binding component  28.57 
 
 
573 aa  112  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.228638  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0532  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  25.43 
 
 
586 aa  112  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.117534  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>