35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1684 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1684  response regulator  100 
 
 		 148 aa  302  1.0000000000000001e-81  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.00000929378  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0405  response regulator  45.33 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.84109  normal  0.361757 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5380  response regulator, LytTR family  41.1 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4893  response regulator  41.1 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2811  response regulator receiver protein  33.56 
 
 		 152 aa  72  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2433  hypothetical protein  28.97 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2387  hypothetical protein  28.97 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0703  response regulator receiver protein  26.35 
 
 		 145 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22920  response regulator of the LytR/AlgR family  27.03 
 
 		 146 aa  55.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16700  response regulator of the LytR/AlgR family  29.66 
 
 		 146 aa  54.7  0.0000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.442012 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3422  response regulator receiver domain-containing protein  32.2 
 
 		 291 aa  54.3  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00728631 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0724  response regulator  32.26 
 
 		 149 aa  52.4  0.000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.432871  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1413  response regulator  29.81 
 
 		 176 aa  47.4  0.00006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00405485  hitchhiker  1.97823e-19 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1569  two component transcriptional regulator, LytTR family  32 
 
 		 240 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000000531282 
 
 
-
 
NC_008504  LACR_B4  response regulator  28.87 
 
 		 145 aa  46.2  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.283822  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0937  response regulator  28.1 
 
 		 145 aa  45.4  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000000122555  normal  0.418012 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0847  response regulator receiver  25.98 
 
 		 232 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00260  response regulator of the LytR/AlgR family  27.33 
 
 		 147 aa  45.1  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000118135 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3900  response regulator receiver domain-containing protein  27.5 
 
 		 261 aa  43.5  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2400  response regulator receiver protein  31.11 
 
 		 236 aa  42.7  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.14107  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1924  two component transcriptional regulator, LytTR family  31.4 
 
 		 250 aa  43.5  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0488  response regulator receiver protein  25 
 
 		 252 aa  42.7  0.002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5142  two component transcriptional regulator, LytTR family  32.63 
 
 		 244 aa  42  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.546377  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1330  LytTR family two component transcriptional regulator  28.72 
 
 		 261 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.80792  hitchhiker  0.00674538 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0765  LytR/AlgR family transcriptional regulator  26.6 
 
 		 247 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.584976  normal  0.255142 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0114  LytTR family two component transcriptional regulator  27.35 
 
 		 226 aa  41.6  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.310837  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2766  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.26 
 
 		 241 aa  41.6  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1420  response regulator receiver protein  32.89 
 
 		 150 aa  41.2  0.005  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1650  response regulator receiver protein  26.71 
 
 		 146 aa  41.2  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  29.89 
 
 		 268 aa  40.8  0.006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2673  response regulator receiver protein  29.9 
 
 		 268 aa  40.8  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.587227  normal  0.606797 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4386  two component transcriptional regulator, LytTR family  30.34 
 
 		 260 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4408  two component transcriptional regulator, LytTR family  35.56 
 
 		 268 aa  40.4  0.008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0991  LytTR family two component transcriptional regulator  40.3 
 
 		 229 aa  40.4  0.008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0979  LytTR family two component transcriptional regulator  30.11 
 
 		 242 aa  40  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0238694 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>