More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1656 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0461  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  79.3 
 
 
579 aa  940    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1656  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  100 
 
 
581 aa  1184    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1245  ABC transporter related  48.89 
 
 
594 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00497584  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1528  ABC transporter, transmembrane region  47.05 
 
 
587 aa  566  1e-160  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00299054  normal  0.0159788 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3786  ABC transporter  46.88 
 
 
587 aa  567  1e-160  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.469191  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3466  ABC transporter ATP-binding/permease  47.22 
 
 
587 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.197712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3432  ABC transporter, ATP-binding protein  47.22 
 
 
587 aa  560  1e-158  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000147455  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3384  ABC transporter, ATP-binding protein  47.22 
 
 
587 aa  560  1e-158  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.603869  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3740  ABC transporter permease/ATP-binding protein  47.22 
 
 
587 aa  560  1e-158  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.037622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2332  ABC transporter-related protein  47.54 
 
 
587 aa  560  1e-158  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000229781  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3695  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  47.22 
 
 
587 aa  560  1e-158  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000106018 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3719  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  46.88 
 
 
587 aa  556  1e-157  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3714  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  46.7 
 
 
587 aa  554  1e-156  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.207401  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2126  ABC transporter related protein  47.26 
 
 
592 aa  536  1e-151  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3365  ABC transporter related  46.88 
 
 
587 aa  536  1e-151  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000714306  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0797  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  45.9 
 
 
597 aa  506  9.999999999999999e-143  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000300454  hitchhiker  1.49077e-19 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2848  ABC transporter related  46.44 
 
 
606 aa  498  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0334718  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1937  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  43.86 
 
 
599 aa  485  1e-136  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1635  ABC-type multidrug transport system, ATPase and permease component  42.76 
 
 
604 aa  481  1e-134  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2181  ABC transporter related  43.15 
 
 
600 aa  458  1e-127  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1391  ABC transporter permease  42.49 
 
 
594 aa  457  1e-127  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.641297  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1201  ABC transporter related protein  39.59 
 
 
594 aa  445  1e-123  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0834  ABC transporter related  43.75 
 
 
677 aa  426  1e-118  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.34775  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0443  ABC transporter related  39.23 
 
 
588 aa  413  1e-114  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000201252  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0313  ABC transporter, ATP-binding/membrane-spanning protein  41.11 
 
 
590 aa  409  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0943  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  41.51 
 
 
666 aa  408  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.10956  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0946  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.73 
 
 
666 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4431  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.73 
 
 
666 aa  406  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0490625  normal  0.190774 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1034  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.73 
 
 
666 aa  405  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000960134  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0907  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  41.92 
 
 
666 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0151268  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0759  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  41.73 
 
 
666 aa  405  1e-111  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0752  multidrug resistance ABC transporter, ATP-binding protein and permease  41.73 
 
 
666 aa  404  1e-111  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1469  ABC transporter related protein  37.02 
 
 
586 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0686  ABC transporter-related protein  41.41 
 
 
666 aa  402  9.999999999999999e-111  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0199671  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0758  ABC transporter related  41.31 
 
 
666 aa  396  1e-109  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.621384  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2627  ABC transporter related  37.02 
 
 
592 aa  398  1e-109  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2371  ABC transporter, ATPase subunit  36.49 
 
 
622 aa  392  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.684572 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4763  ABC transporter related  38.14 
 
 
591 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.116722  normal  0.0159357 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1227  ABC transporter related  37 
 
 
589 aa  384  1e-105  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.175574 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2505  ABC transporter related protein  34.86 
 
 
607 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.152219  normal  0.502097 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0669  ABC transporter related  38.82 
 
 
588 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.921203  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0648  ABC transporter related  35.64 
 
 
623 aa  382  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.986523 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0673  ABC transporter related  40.7 
 
 
650 aa  380  1e-104  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2618  ABC transporter related  37.54 
 
 
617 aa  379  1e-104  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000100526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3872  ABC transporter related  37.2 
 
 
585 aa  380  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2306  ABC transporter related  37.12 
 
 
610 aa  376  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.306403 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02525  hypothetical protein  38.47 
 
 
592 aa  376  1e-103  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0418  ABC transporter related protein  34.9 
 
 
600 aa  377  1e-103  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0387  ABC transporter related  36.08 
 
 
611 aa  373  1e-102  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  unclonable  0.000000031667  normal  0.0347309 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0494  ABC transporter related  34.06 
 
 
611 aa  373  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0118  ABC transporter related  39.88 
 
 
645 aa  373  1e-102  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.00403697  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1108  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  36.46 
 
 
592 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.689619  hitchhiker  0.00000403597 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4668  ABC transporter, transmembrane region  35.49 
 
 
584 aa  375  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0624  ABC transporter, transmembrane region  34.02 
 
 
597 aa  372  1e-102  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0335  ABC transporter transmembrane region  37.17 
 
 
588 aa  371  1e-101  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0419  ABC transporter-related protein  37.74 
 
 
608 aa  372  1e-101  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0718918 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1942  ABC transporter, transmembrane region  34.18 
 
 
594 aa  372  1e-101  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0453  ATPase  34.03 
 
 
614 aa  371  1e-101  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003565  putative ATP-binding component of a transport system  39.51 
 
 
591 aa  371  1e-101  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0801  ABC transporter-like protein  34.2 
 
 
635 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.678319 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2717  ABC transporter related  34.64 
 
 
608 aa  370  1e-101  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1526  ABC transporter related  36.11 
 
 
597 aa  370  1e-101  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00462588  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0649  ABC transporter transmembrane region  34.02 
 
 
597 aa  372  1e-101  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.564007  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19280  ABC transporter related  35.7 
 
 
609 aa  369  1e-100  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1761  ATPase  35.6 
 
 
611 aa  368  1e-100  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.115592  normal  0.424794 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0422  ABC transporter related  35.09 
 
 
613 aa  367  1e-100  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.333547  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1430  ABC transporter related  37.31 
 
 
592 aa  368  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2497  ABC transporter related  33.39 
 
 
614 aa  366  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0033  ABC transporter related  34.6 
 
 
602 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2350  ABC transporter related protein  36.36 
 
 
620 aa  365  2e-99  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2809  ABC transporter related protein  37.31 
 
 
685 aa  364  2e-99  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000401282  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3416  ABC transporter-related protein  32.58 
 
 
602 aa  363  4e-99  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0387  ABC transporter related  36.24 
 
 
619 aa  363  4e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.102241  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1359  ABC transporter related  36.21 
 
 
608 aa  362  8e-99  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0318  ABC transporter related  36.03 
 
 
603 aa  362  1e-98  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2669  ABC transporter related  36.03 
 
 
637 aa  362  1e-98  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.871518  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0034  ABC transporter related protein  33.51 
 
 
603 aa  362  1e-98  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2254  ABC transporter related  36.47 
 
 
592 aa  362  1e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0397  ABC transporter related protein  34.78 
 
 
586 aa  361  2e-98  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000282557  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13518  ATPase  33.85 
 
 
587 aa  360  3e-98  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0101  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  34.97 
 
 
592 aa  360  4e-98  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1250  ABC transporter related  34.58 
 
 
610 aa  360  4e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0492  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.6 
 
 
593 aa  359  9e-98  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0917  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  33.74 
 
 
593 aa  359  9.999999999999999e-98  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0569  ABC transporter related  36.46 
 
 
597 aa  358  9.999999999999999e-98  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00401  fused predicted multidrug transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  34.78 
 
 
593 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00405  hypothetical protein  34.78 
 
 
593 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1776  ABC transporter, permease/ATP-binding protein  34.52 
 
 
589 aa  357  2.9999999999999997e-97  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.184019  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2866  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.84 
 
 
594 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.749426  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0485  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.78 
 
 
593 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3058  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.88 
 
 
597 aa  357  3.9999999999999996e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2613  ABC transporter, transmembrane region  33.5 
 
 
625 aa  357  3.9999999999999996e-97  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.200186  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3160  ABC transporter related protein  34.6 
 
 
593 aa  357  5e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0537  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.6 
 
 
593 aa  357  5e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3079  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  35.74 
 
 
607 aa  356  5e-97  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0526  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.6 
 
 
593 aa  357  5e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3166  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.6 
 
 
593 aa  357  5e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3627  ABC transporter related  35.22 
 
 
617 aa  356  5.999999999999999e-97  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3221  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  35.74 
 
 
607 aa  356  6.999999999999999e-97  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0504  putative multidrug transporter membraneATP-binding components  34.78 
 
 
593 aa  356  7.999999999999999e-97  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>