282 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1632 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1632  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  100 
 
 
287 aa  577  1e-164  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000451911  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1732  glycerol uptake facilitator protein, putative  65.59 
 
 
282 aa  366  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0128526  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2341  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  55.9 
 
 
289 aa  305  6e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.395885  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1732  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  44.79 
 
 
287 aa  241  1e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000479183  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0086  glycerol facilitator-aquaporin  47.57 
 
 
243 aa  226  3e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000385513 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0349  glycerol uptake facilitator or related permease (major Intrinsic protein family)  43.66 
 
 
250 aa  223  3e-57  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000402346  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0480  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  41.9 
 
 
289 aa  219  3e-56  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000000000262851  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1213  glycerol uptake facilitator  49.44 
 
 
244 aa  205  9e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2513  MIP family channel protein  42.65 
 
 
255 aa  186  5e-46  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.341 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1170  putative glycerol uptake facilitator protein  40.96 
 
 
234 aa  185  9e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.351362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1001  glycerol uptake facilitator protein  40.96 
 
 
234 aa  185  9e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.379218  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1019  MIP family channel protein  43.17 
 
 
242 aa  180  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3650  MIP family channel protein  40.96 
 
 
250 aa  179  4e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.348942  normal  0.828638 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1065  MIP family channel protein  40.74 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.547307  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2846  MIP family channel protein  37.82 
 
 
236 aa  173  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000324919  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4234  glycerol uptake facilitator protein  40.84 
 
 
273 aa  170  2e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000125591  decreased coverage  0.000000000395439 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1065  glycerol uptake facilitator protein  40.84 
 
 
273 aa  170  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000246889  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0947  MIP family channel protein  39.69 
 
 
273 aa  169  4e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000138868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1105  glycerol uptake facilitator protein  41.22 
 
 
273 aa  169  5e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.5867199999999997e-51 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2043  MIP family channel protein  40.89 
 
 
240 aa  169  5e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536083  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0806  MIP family channel protein  40.84 
 
 
273 aa  169  5e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000186398  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0946  glycerol uptake facilitator protein  40.84 
 
 
278 aa  168  8e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.82294e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0937  glycerol uptake facilitator protein  40.84 
 
 
278 aa  168  8e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.0000000000181424  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2561  glycerol uptake facilitator glpF  37.27 
 
 
235 aa  168  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1194  glycerol uptake facilitator protein  40.84 
 
 
273 aa  168  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000435303  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1124  glycerol uptake facilitator protein  40.84 
 
 
273 aa  168  1e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000312031  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0959  glycerol uptake facilitator protein  40.84 
 
 
278 aa  167  1e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000387378  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1267  MIP family channel protein  39.05 
 
 
275 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000000541866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1025  glycerol uptake facilitator protein  40.84 
 
 
273 aa  167  2e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000147152  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2878  glycerol uptake facilitator protein  36.9 
 
 
235 aa  167  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0275  glycerol uptake facilitator protein  37.97 
 
 
232 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2149  MIP family channel protein  38.75 
 
 
272 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1918  MIP family channel protein  39.78 
 
 
255 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.157288  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0866  glycerol uptake facilitator protein  38.52 
 
 
274 aa  160  3e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.306502  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1765  MIP family channel protein  41.41 
 
 
244 aa  156  3e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.459656 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1358  MIP family channel protein  37.78 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00322648  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1384  MIP family channel protein  37.78 
 
 
272 aa  153  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000466  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0637  major intrinsic protein, glycerol uptake channel  36.4 
 
 
237 aa  152  4e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3322  MIP family channel protein  36.4 
 
 
237 aa  152  4e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.218114 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4188  MIP family channel protein  36.88 
 
 
243 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.394775 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0598  glycerol uptake facilitator protein  36.9 
 
 
238 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0239  glycerol uptake facilitator protein  36.53 
 
 
238 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.160483  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0905  glycerol uptake facilitator protein  36.53 
 
 
238 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2707  glycerol uptake facilitator protein  36.53 
 
 
238 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2370  glycerol uptake facilitator protein  36.53 
 
 
238 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.925384  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0724  glycerol uptake facilitator protein  36.53 
 
 
238 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.122714  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0738  glycerol uptake facilitator protein  36.53 
 
 
238 aa  150  3e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2451  glycerol uptake facilitator protein  36.53 
 
 
238 aa  150  3e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.287324  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1487  glycerol uptake facilitator  35.42 
 
 
242 aa  145  1e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00172082  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0486  major intrinsic protein  35.48 
 
 
246 aa  144  2e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.39672  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2604  MIP family channel protein  37.01 
 
 
238 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0618  MIP family channel protein  36.08 
 
 
238 aa  143  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2732  MIP family channel protein  37.01 
 
 
238 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6007  Aquaporin  37.01 
 
 
238 aa  142  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264936  normal  0.939787 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0294  MIP family channel protein  34.2 
 
 
239 aa  142  9e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000000803178  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2068  MIP family channel protein  37.01 
 
 
238 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.104324  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2679  MIP family channel protein  37.01 
 
 
238 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.824387  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2708  MIP family channel protein  37.01 
 
 
238 aa  142  9e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200517  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0379  MIP family channel protein  36.61 
 
 
242 aa  139  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.995202  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_23040  MIP family channel protein  38.6 
 
 
240 aa  138  1e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5041  major intrinsic protein  37.96 
 
 
240 aa  137  2e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1653  glycerol uptake facilitator protein  35.42 
 
 
237 aa  137  3.0000000000000003e-31  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2249  major intrinsic protein  38.1 
 
 
249 aa  135  6.0000000000000005e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.0000222007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0726  major intrinsic protein  36.22 
 
 
247 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000820267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6410  major intrinsic protein  36.54 
 
 
246 aa  132  6e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0075  major intrinsic protein  36.33 
 
 
244 aa  132  7.999999999999999e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29930  permease, glycerol uptake facilitator  36.06 
 
 
239 aa  130  2.0000000000000002e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5936  major intrinsic protein  38.35 
 
 
241 aa  130  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1986  major intrinsic protein  36.76 
 
 
249 aa  129  7.000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000584519 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1557  major intrinsic protein  35.9 
 
 
242 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3541  major intrinsic protein  35.96 
 
 
233 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5300  major intrinsic protein  36.26 
 
 
249 aa  123  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3290  major intrinsic protein  35.38 
 
 
252 aa  123  3e-27  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.881341  normal  0.0169929 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2177  major intrinsic protein  35.4 
 
 
243 aa  123  4e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.416578  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1752  major intrinsic protein  34.56 
 
 
235 aa  122  9e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0217  glycerol uptake facilitator protein  35.04 
 
 
259 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4219  major intrinsic protein  33.96 
 
 
241 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.673856  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0255  glycerol uptake facilitator related permease (major Intrinsic protein family)  32.84 
 
 
238 aa  115  7.999999999999999e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0373  major intrinsic protein  34.33 
 
 
250 aa  109  4.0000000000000004e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421217  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2383  major intrinsic protein  32.58 
 
 
241 aa  109  4.0000000000000004e-23  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0390  major intrinsic protein  31.45 
 
 
244 aa  109  5e-23  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.143775  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2523  MIP family channel protein  32.97 
 
 
274 aa  109  6e-23  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5125  MIP family channel protein  31.36 
 
 
284 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_06810  permease, glycerol uptake facilitator  32.95 
 
 
245 aa  105  8e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0559  major intrinsic protein  33.96 
 
 
245 aa  104  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000202801 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0875  MIP family channel protein  32.17 
 
 
295 aa  103  2e-21  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05780  MIP family channel protein  33.21 
 
 
315 aa  101  1e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1246  MIP family channel protein  30.88 
 
 
246 aa  94  2e-18  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0878  major intrinsic protein  34.11 
 
 
244 aa  93.6  3e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1940  MIP family channel protein  28.26 
 
 
267 aa  93.6  4e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0245  glycerol uptake facilitator  31.4 
 
 
254 aa  92  9e-18  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3914  MIP family channel protein  30.18 
 
 
338 aa  91.3  2e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.223328  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03915  MIP aquaporin (Eurofung)  27.82 
 
 
340 aa  87.4  2e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.182238 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2986  MIP family channel protein  29.2 
 
 
268 aa  87  3e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.862108  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2332  MIP family channel protein  27.5 
 
 
295 aa  85.9  7e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1007  MIP family channel protein  30.63 
 
 
281 aa  84.7  0.000000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0697124  decreased coverage  0.00139101 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4609  MIP family channel protein  30 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.344473 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0253  major intrinsic protein  30.31 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.740215  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0495  MIP family channel protein  29.59 
 
 
279 aa  82.4  0.000000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0810  major intrinsic protein  29.89 
 
 
252 aa  82  0.00000000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.199879 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>