More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1628 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1628  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 
216 aa  445  1.0000000000000001e-124  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A10  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  97.22 
 
 
216 aa  439  9.999999999999999e-123  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0000852984  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0933  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  50 
 
 
212 aa  225  4e-58  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000401651  normal  0.238349 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00441  predicted transporter subunit: ATP-binding component of ABC superfamily  48.76 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0569  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  48.76 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0529  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  48.76 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00446  hypothetical protein  48.76 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0594  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  48.76 
 
 
225 aa  200  9.999999999999999e-51  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.355686 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0539  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  48.76 
 
 
225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4667  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  48.99 
 
 
225 aa  199  1.9999999999999998e-50  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0425  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  48.26 
 
 
225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3120  ABC transporter related protein  48.26 
 
 
225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.981007  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3126  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  48.26 
 
 
225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000946354 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0688  ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 
218 aa  189  2.9999999999999997e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.580982  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0551  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  46.77 
 
 
225 aa  187  8e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.522757  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0610  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  46.27 
 
 
225 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0566  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  46.27 
 
 
225 aa  186  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0556  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  46.27 
 
 
225 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0549  putative ABC transporter ATP-binding protein YbbL  46.27 
 
 
225 aa  186  3e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2530  ABC transporter related  42.63 
 
 
220 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00573558  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2481  ABC transporter related  42.63 
 
 
220 aa  159  3e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000539797  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2681  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.91 
 
 
344 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.255864  normal  0.491584 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4911  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.19 
 
 
336 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2038  ABC transporter, ATP-binding protein  38.42 
 
 
220 aa  140  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.436914  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3872  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.17 
 
 
340 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3492  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.71 
 
 
343 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.993193  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3479  sulphate transport system permease protein 1  38.71 
 
 
343 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3542  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.71 
 
 
343 aa  137  1e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3171  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.44 
 
 
333 aa  136  2e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.659319  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1903  sulphate transport system permease protein 1  38.57 
 
 
343 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000843013  hitchhiker  0.000000000000895278 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12425  sulfate-transport ATP-binding protein ABC transporter cysA1  38.71 
 
 
351 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00408359  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0449  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  40.38 
 
 
366 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0126  ABC type ATPase  37.27 
 
 
352 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00228603 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1086  ABC transporter related  35.68 
 
 
222 aa  130  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.76035  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2777  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.44 
 
 
332 aa  129  2.0000000000000002e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4965  ABC transporter related  36.79 
 
 
357 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0950419  normal  0.125498 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3807  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.91 
 
 
355 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.772256 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1646  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  39.09 
 
 
363 aa  129  4.0000000000000003e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2357  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  39.62 
 
 
343 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0369029  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1685  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  36.32 
 
 
357 aa  127  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.409231 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2107  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  40.1 
 
 
363 aa  127  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1680  sulphate transport system permease protein 1  35.65 
 
 
338 aa  126  2.0000000000000002e-28  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.070095  normal  0.46795 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3796  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.73 
 
 
360 aa  126  2.0000000000000002e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.327654  normal  0.344897 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1467  ABC transporter related protein  34.21 
 
 
222 aa  126  3e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1739  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.87 
 
 
355 aa  126  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2267  ABC transporter related protein  36.71 
 
 
351 aa  125  3e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.272447 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1349  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 
343 aa  125  4.0000000000000003e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0503  sulphate transport system permease protein 1  36.59 
 
 
360 aa  125  4.0000000000000003e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2379  sulphate transport system permease protein 1  37.79 
 
 
362 aa  124  8.000000000000001e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2958  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.48 
 
 
365 aa  124  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3091  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 
330 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.711753  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1014  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.48 
 
 
357 aa  124  1e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.939142  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1788  ABC transporter related protein  36.57 
 
 
317 aa  124  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.703394  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2023  ABC transporter related  37.05 
 
 
366 aa  123  2e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.264561 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3450  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.11 
 
 
351 aa  123  2e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3891  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.31 
 
 
356 aa  122  3e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.540067  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2408  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  35.32 
 
 
345 aa  122  3e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.048511 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3500  ABC transporter related  35.65 
 
 
348 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0327  ABC transporter related  37.32 
 
 
244 aa  122  3e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.115025  normal  0.15023 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0541  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.84 
 
 
339 aa  122  3e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3573  ABC transporter related  35.65 
 
 
348 aa  122  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.736918  normal  0.213742 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1199  sulfate ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
357 aa  122  4e-27  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1074  ABC sulfate/thiosulfate transporter, ATPase subunit CysA  36.87 
 
 
269 aa  122  4e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000278365  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2335  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.87 
 
 
375 aa  122  4e-27  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0909589  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4115  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  37.44 
 
 
357 aa  122  4e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1531  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.67 
 
 
353 aa  122  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1370  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.94 
 
 
373 aa  122  4e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1522  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.87 
 
 
375 aa  122  4e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.164669  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1186  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.36 
 
 
330 aa  122  5e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4587  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.82 
 
 
375 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1234  ABC spermidine/putrescine transporter, ATPase subunit  36.97 
 
 
367 aa  122  5e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0541634  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0253  phosphate ABC transporter ATP-binding protein  36.84 
 
 
240 aa  122  5e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000710517  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2056  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  34.88 
 
 
355 aa  121  6e-27  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.938805  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2548  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.41 
 
 
374 aa  122  6e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.469643  normal  0.012535 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3183  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.89 
 
 
353 aa  121  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0268964  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1639  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.11 
 
 
359 aa  121  8e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4107  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  33.8 
 
 
357 aa  121  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2841  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  38.43 
 
 
346 aa  120  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0714016  normal  0.325359 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4094  ABC transporter related  37.33 
 
 
226 aa  120  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1495  sulphate transport system permease protein 1  35.19 
 
 
338 aa  120  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.625572  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0595  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.99 
 
 
347 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.645255 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0750  polyamine/opine/phosphonate ABC transporter ATPase  35.98 
 
 
363 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0659663  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2073  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.91 
 
 
374 aa  120  9.999999999999999e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.603613  hitchhiker  7.48501e-17 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1387  sulphate transport system permease protein 1  36.87 
 
 
240 aa  121  9.999999999999999e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.748727 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1546  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  35.94 
 
 
362 aa  120  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1128  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA  35.02 
 
 
357 aa  120  9.999999999999999e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1047  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  36.41 
 
 
330 aa  120  9.999999999999999e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6271  ABC transporter related  33.96 
 
 
356 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0482396  normal  0.559983 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  39.41 
 
 
233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0327  spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.27 
 
 
355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.100504  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2270  ABC transporter related  36.2 
 
 
250 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.42707  normal  0.355714 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3420  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.8 
 
 
226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0399135  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2754  lipoprotein releasing system, ATP-binding protein  34.8 
 
 
226 aa  119  1.9999999999999998e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.662272  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0568  ABC transporter related  36.24 
 
 
363 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0218426  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0964  sulfate ABC transporter, ATPase subunit  34.56 
 
 
369 aa  120  1.9999999999999998e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0028  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.96 
 
 
378 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0855838  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0323  spermidine/putrescine ABC transporter ATPase subunit  37.21 
 
 
357 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.000000345783  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4913  ABC transporter related  35.68 
 
 
353 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.801745 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0301  putative spermidine/putrescine ABC transporter, ATP-binding protein  34.27 
 
 
355 aa  120  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00163011  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4466  ABC transporter-like  38 
 
 
351 aa  119  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.486534  normal  0.871415 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>