More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1621 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1621  DNA polymerase IV  100 
 
 		 367 aa  757    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1726  DNA polymerase IV  75.84 
 
 		 364 aa  583  1.0000000000000001e-165  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.503643  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2314  DNA polymerase IV  61 
 
 		 364 aa  458  9.999999999999999e-129  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.023311  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3597  DNA-directed DNA polymerase  50 
 
 		 380 aa  332  5e-90  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.456033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0318  DNA-directed DNA polymerase  44.54 
 
 		 372 aa  319  5e-86  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.154893 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1949  DNA polymerase IV  45.94 
 
 		 356 aa  317  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.259115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1983  DNA polymerase IV  45.94 
 
 		 356 aa  317  1e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1432  DNA-directed DNA polymerase  44.29 
 
 		 374 aa  305  7e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.517371  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1433  DNA polymerase IV  44.82 
 
 		 356 aa  303  2.0000000000000002e-81  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2654  DNA polymerase IV  45.17 
 
 		 378 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2280  DNA-directed DNA polymerase  45.17 
 
 		 378 aa  301  1e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.924608  hitchhiker  0.0000031101 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2663  DNA-directed DNA polymerase  43.47 
 
 		 358 aa  300  2e-80  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0579235  normal  0.454418 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1818  DNA polymerase IV  43.85 
 
 		 359 aa  300  3e-80  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.432608  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7175  DNA-directed DNA polymerase  43.93 
 
 		 371 aa  296  4e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1272  DNA-directed DNA polymerase  42.86 
 
 		 359 aa  295  7e-79  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0732  DNA-directed DNA polymerase  44.17 
 
 		 363 aa  293  2e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.833353  normal  0.0993965 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1538  DNA polymerase IV  44.31 
 
 		 359 aa  293  4e-78  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.142291  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0418  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  43.37 
 
 		 373 aa  292  5e-78  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1586  nucleotidyltransferase/DNA polymerase for DNA repair  42.54 
 
 		 361 aa  290  2e-77  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1923  DNA-directed DNA polymerase  43.23 
 
 		 369 aa  287  2e-76  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000722148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5155  DNA polymerase IV  41.79 
 
 		 363 aa  285  5.999999999999999e-76  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.702969 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5353  DNA polymerase IV  42.98 
 
 		 378 aa  283  5.000000000000001e-75  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.198836  normal  0.299038 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6078  DNA polymerase IV  41.11 
 
 		 365 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0756  DNA polymerase IV  44.12 
 
 		 376 aa  281  9e-75  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3374  DNA polymerase IV  42.69 
 
 		 385 aa  281  1e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2656  DNA polymerase IV  41.81 
 
 		 378 aa  280  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0473  DNA-directed DNA polymerase  42.61 
 
 		 375 aa  280  4e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2024  DNA-directed DNA polymerase  42.15 
 
 		 373 aa  278  8e-74  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1867  DNA-directed DNA polymerase  42.09 
 
 		 356 aa  278  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2775  DNA-directed DNA polymerase  42.78 
 
 		 355 aa  278  1e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0883  DNA-directed DNA polymerase  42.33 
 
 		 360 aa  275  1.0000000000000001e-72  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3537  DNA-directed DNA polymerase  40.06 
 
 		 357 aa  274  2.0000000000000002e-72  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1330  DNA-directed DNA polymerase  39.88 
 
 		 359 aa  273  3e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.64899  normal  0.124466 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2097  DNA-directed DNA polymerase  42.2 
 
 		 373 aa  272  6e-72  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3636  DNA polymerase IV  40.45 
 
 		 396 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.892851 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3265  DNA polymerase IV  40.51 
 
 		 354 aa  270  2.9999999999999997e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3160  DNA-directed DNA polymerase  41.08 
 
 		 359 aa  269  7e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1640  DNA-directed DNA polymerase  40.94 
 
 		 360 aa  267  2e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.582821 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0455  DNA polymerase IV  40.06 
 
 		 356 aa  267  2e-70  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1563  DNA-directed DNA polymerase  40.62 
 
 		 371 aa  265  8e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.233621  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1185  DNA-directed DNA polymerase  39.66 
 
 		 381 aa  265  1e-69  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.129375  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0965  DNA polymerase IV  39.89 
 
 		 350 aa  263  4.999999999999999e-69  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0961  DNA polymerase IV  41.18 
 
 		 359 aa  262  8.999999999999999e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.215034  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3422  DNA polymerase IV  41.24 
 
 		 360 aa  260  2e-68  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2871  DNA polymerase IV  40.16 
 
 		 359 aa  260  3e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0662  DNA-directed DNA polymerase  41.81 
 
 		 353 aa  259  4e-68  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0195  DNA polymerase IV  42.46 
 
 		 389 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02810  DNA polymerase IV  42.77 
 
 		 368 aa  259  5.0000000000000005e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.495536  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03139  DNA polymerase IV  39.48 
 
 		 369 aa  259  6e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0383  ImpB/MucB/SamB family protein  40.29 
 
 		 357 aa  258  8e-68  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00108419  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2507  DNA-directed DNA polymerase  41.5 
 
 		 358 aa  258  8e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000000247622  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3092  DNA polymerase IV  39.57 
 
 		 358 aa  258  9e-68  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2179  DNA polymerase IV  41.53 
 
 		 405 aa  256  6e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.288104  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3604  DNA polymerase IV  40.68 
 
 		 364 aa  255  7e-67  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.85941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1876  DNA polymerase IV  39.24 
 
 		 360 aa  255  8e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37100  DNA polymerase IV  39.44 
 
 		 353 aa  255  8e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1726  DNA polymerase IV  39.89 
 
 		 352 aa  255  9e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.000164893  normal  0.305741 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1635  DNA polymerase IV  40.45 
 
 		 357 aa  254  2.0000000000000002e-66  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.107243  normal  0.427706 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1587  DNA polymerase IV  39.89 
 
 		 362 aa  253  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.937216  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0947  DNA polymerase IV  40.64 
 
 		 359 aa  253  3e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1963  DNA polymerase IV  40.45 
 
 		 357 aa  253  3e-66  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.148262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3308  DNA polymerase IV  39.44 
 
 		 352 aa  253  4.0000000000000004e-66  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00714145  hitchhiker  0.00000429031 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0285  DNA polymerase IV  40.44 
 
 		 351 aa  253  4.0000000000000004e-66  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.32449 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1444  DNA polymerase IV  38.89 
 
 		 466 aa  253  4.0000000000000004e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.754501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0380  DNA-directed DNA polymerase  39.89 
 
 		 360 aa  252  6e-66  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.158929  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1566  DNA polymerase IV  42.74 
 
 		 369 aa  252  6e-66  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0682981  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0762  DNA polymerase IV  40.56 
 
 		 352 aa  252  8.000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.072436 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3296  DNA polymerase IV  39.11 
 
 		 352 aa  252  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3157  DNA polymerase IV  39.11 
 
 		 352 aa  252  9.000000000000001e-66  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0985  DNA polymerase IV  40.37 
 
 		 359 aa  251  1e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002716  DNA polymerase IV  39.51 
 
 		 356 aa  251  1e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0962  DNA polymerase IV  40.56 
 
 		 353 aa  251  2e-65  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0949  DNA polymerase IV  40.37 
 
 		 359 aa  251  2e-65  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00226  DNA polymerase IV  39.89 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3376  DNA-directed DNA polymerase  39.89 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3349  DNA polymerase IV  39.89 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00229  hypothetical protein  39.89 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0276  DNA polymerase IV  39.89 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.820662 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2331  DNA-directed DNA polymerase  40.88 
 
 		 408 aa  249  4e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.632571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0265  DNA polymerase IV  39.89 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0260  DNA polymerase IV  39.89 
 
 		 351 aa  249  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5890  DNA-directed DNA polymerase  40.44 
 
 		 409 aa  249  6e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.315723  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0347  DNA polymerase IV  39.17 
 
 		 351 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0343  DNA polymerase IV  39.44 
 
 		 351 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.663031 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0362  DNA polymerase IV  39.17 
 
 		 351 aa  249  7e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.933253  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0354  DNA polymerase IV  39.17 
 
 		 351 aa  248  9e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000360383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52310  DNA polymerase IV  48.62 
 
 		 349 aa  248  9e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.88026 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0927  DNA polymerase IV  40.06 
 
 		 352 aa  247  2e-64  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.716542  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0352  DNA polymerase IV  39.17 
 
 		 351 aa  248  2e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.990512 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2071  DNA-directed DNA polymerase  39.44 
 
 		 348 aa  247  2e-64  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.485173  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0228  DNA polymerase IV  39.72 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.190428  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1232  DNA polymerase IV  39.34 
 
 		 354 aa  247  2e-64  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.46587  normal  0.838167 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2052  DNA polymerase IV  40.91 
 
 		 407 aa  247  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.217696  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4012  DNA polymerase IV  38.78 
 
 		 354 aa  246  4e-64  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.333158  normal  0.93726 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0935  DNA polymerase IV  39.89 
 
 		 358 aa  246  4e-64  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3438  DNA polymerase IV  38.48 
 
 		 352 aa  246  4e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03264  DNA polymerase IV  40.22 
 
 		 372 aa  246  4e-64  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0951  DNA polymerase IV  40.17 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.126406  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1114  DNA polymerase IV  39.44 
 
 		 357 aa  246  4.9999999999999997e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4215  DNA polymerase IV  39.61 
 
 		 354 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.154299  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>