219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1587 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1587  DMT family permease  100 
 
 
304 aa  591  1e-168  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000814807  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1666  hypothetical protein  58.55 
 
 
304 aa  340  2e-92  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.656198  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2596  protein of unknown function DUF6 transmembrane  41.78 
 
 
314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000123708  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0884  transporter  36.9 
 
 
299 aa  215  7e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1128  phosphate acetyltransferase (phosphotransacetylase)  36.52 
 
 
300 aa  214  9.999999999999999e-55  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00496781  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1424  protein of unknown function DUF6 transmembrane  38.62 
 
 
530 aa  213  3.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000539805  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1423  protein of unknown function DUF6 transmembrane  37.59 
 
 
520 aa  204  1e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  decreased coverage  0.00000166292  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1777  transporter  36.81 
 
 
296 aa  187  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0876  integral membrane protein  35.84 
 
 
290 aa  181  1e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00907858  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1617  transporter  34.35 
 
 
296 aa  179  4e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0033  carboxylate/amino acid/amine transporter  38.31 
 
 
301 aa  179  4e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.777153  normal  0.606163 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0947  integral membrane protein  35.49 
 
 
290 aa  179  4.999999999999999e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.114087  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5085  carboxylate/amino acid/amine transporter  37.58 
 
 
307 aa  178  1e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.35072 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4095  carboxylate/amino acid/amine transporter  37.07 
 
 
315 aa  177  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03543  predicted inner membrane protein  37.25 
 
 
307 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0045  carboxylate/amino acid/amine transporter  37.25 
 
 
307 aa  176  3e-43  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03485  hypothetical protein  37.25 
 
 
307 aa  176  3e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3972  carboxylate/amino acid/amine transporter  37.07 
 
 
315 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4158  carboxylate/amino acid/amine transporter  37.07 
 
 
315 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.565076  normal  0.615657 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3990  carboxylate/amino acid/amine transporter  37.07 
 
 
315 aa  176  3e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4167  carboxylate/amino acid/amine transporter  37.25 
 
 
307 aa  176  3e-43  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4044  carboxylate/amino acid/amine transporter  37.07 
 
 
315 aa  176  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0378511 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3872  carboxylate/amino acid/amine transporter  36.93 
 
 
307 aa  176  4e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0040  carboxylate/amino acid/amine transporter  36.93 
 
 
307 aa  176  5e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4015  carboxylate/amino acid/amine transporter  37.25 
 
 
307 aa  176  5e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.972202  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4115  carboxylate/amino acid/amine transporter  37.29 
 
 
299 aa  174  9.999999999999999e-43  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.210953  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0379  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34.02 
 
 
321 aa  171  2e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.234172  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11190  membrane protein  32.9 
 
 
325 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.720311 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1293  protein of unknown function DUF6 transmembrane  34 
 
 
331 aa  165  9e-40  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2244  DMT family permease  34.57 
 
 
297 aa  157  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.705911  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26320  predicted permease, DMT superfamily  34.95 
 
 
319 aa  155  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0634  DMT family permease  33.45 
 
 
300 aa  149  4e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.190735  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0979  DMT family permease  30.82 
 
 
299 aa  149  6e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.974492  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1176  hypothetical protein  32.99 
 
 
358 aa  147  3e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.640658 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0492  DMT family permease  29.61 
 
 
308 aa  145  9e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.348836  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0637  transporter, EamA family  29.28 
 
 
308 aa  144  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1143  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.71 
 
 
293 aa  144  2e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0494  DMT family permease  30.67 
 
 
308 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1107  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30.46 
 
 
303 aa  143  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000007978  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0645  EamA family protein  28.71 
 
 
308 aa  142  5e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0550  EamA family protein  29.28 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0581  eama family protein  29.28 
 
 
308 aa  141  9.999999999999999e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1785  DMT family permease  31.08 
 
 
297 aa  142  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000100378  hitchhiker  2.8549e-18 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0707  transporter, EamA family  28.95 
 
 
308 aa  138  1e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1929  protein of unknown function DUF6 transmembrane  31.03 
 
 
313 aa  138  1e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0619  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  28.52 
 
 
308 aa  137  2e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0495  hypothetical protein  27.78 
 
 
310 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4720  transporter, Drug/Metabolite Exporter family  29.21 
 
 
308 aa  137  2e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1667  DMT family permease  31.19 
 
 
309 aa  134  3e-30  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000699147  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1827  protein of unknown function DUF6 transmembrane  33 
 
 
309 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0523447  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0427  hypothetical protein  32.2 
 
 
304 aa  132  5e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1835  EamA family protein  30.65 
 
 
322 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.749092  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0919  hypothetical protein  28.62 
 
 
305 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1892  transporter, EamA family  30.15 
 
 
322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0271761  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1633  hypothetical protein  30.67 
 
 
321 aa  126  5e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.614704  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0548  DMT family permease  25.94 
 
 
306 aa  118  9.999999999999999e-26  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.956641  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1774  transporter, EamA family  30.89 
 
 
321 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.456325  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2610  hypothetical protein  28.84 
 
 
320 aa  116  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2557  hypothetical protein  28.84 
 
 
320 aa  116  5e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1583  drug/metabolite exporter family protein  30.37 
 
 
322 aa  114  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0220405  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1412  hypothetical protein  28.71 
 
 
322 aa  114  2.0000000000000002e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0642059  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1631  EamA family protein  29.75 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00303775  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1609  drug/metabolite exporter family protein  29.75 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0313056  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1759  eama family protein  29.75 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0623862  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1809  transporter, EamA family  29.75 
 
 
322 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1569  DMT family permease  26.52 
 
 
295 aa  99.4  7e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0792  protein of unknown function DUF6 transmembrane  26.54 
 
 
296 aa  94.4  2e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.90814  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2001  hypothetical protein  23.97 
 
 
315 aa  90.9  2e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00115846  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0348  protein of unknown function DUF6 transmembrane  24.44 
 
 
309 aa  88.2  1e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0150113 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1301  hypothetical protein  26.55 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.488706  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2367  hypothetical protein  27.36 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.169121  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2247  hypothetical protein  27.03 
 
 
309 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.654485 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1010  integral membrane protein  35.21 
 
 
150 aa  76.3  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00787572  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0621  protein of unknown function DUF6 transmembrane  30 
 
 
310 aa  73.6  0.000000000004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0929157  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1059  hypothetical protein  23.05 
 
 
317 aa  73.2  0.000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.999604  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5670  hypothetical protein  26.69 
 
 
309 aa  71.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.846294 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0996  hypothetical protein  24.32 
 
 
274 aa  72  0.00000000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.31188  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3876  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.57 
 
 
348 aa  71.2  0.00000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0949  hypothetical protein  27.03 
 
 
397 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.217606  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2908  hypothetical protein  25.74 
 
 
297 aa  70.5  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.903302 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2351  hypothetical protein  26.35 
 
 
309 aa  70.1  0.00000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.240563 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27470  predicted membrane protein  25.08 
 
 
289 aa  69.7  0.00000000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1716  hypothetical protein  25.93 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.131137  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2328  hypothetical protein  25.93 
 
 
309 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2634  DMT family permease  24.61 
 
 
327 aa  68.6  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0644823  normal  0.93988 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1925  hypothetical protein  26.38 
 
 
315 aa  66.6  0.0000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1044  hypothetical protein  26.15 
 
 
308 aa  63.5  0.000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1008  hypothetical protein  23.18 
 
 
312 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.508617 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4102  hypothetical protein  23.6 
 
 
357 aa  61.6  0.00000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4226  hypothetical protein  25.81 
 
 
320 aa  60.5  0.00000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1341  protein of unknown function DUF6 transmembrane  27.18 
 
 
321 aa  59.7  0.00000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000917632 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1879  hypothetical protein  23.05 
 
 
304 aa  59.3  0.00000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5292  protein of unknown function DUF6 transmembrane  21.61 
 
 
341 aa  58.9  0.00000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2885  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.52 
 
 
325 aa  58.5  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1868  hypothetical protein  22.7 
 
 
300 aa  58.5  0.0000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2617  hypothetical protein  24.91 
 
 
325 aa  57.8  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.387385  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1758  protein of unknown function DUF6 transmembrane  25.49 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000138196  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2856  hypothetical protein  22.22 
 
 
288 aa  57.4  0.0000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.566948  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24730  predicted permease, DMT superfamily  23.62 
 
 
356 aa  57  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0680  hypothetical protein  27.08 
 
 
305 aa  57  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>