More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1453 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1453  transaminase  100 
 
 
369 aa  760    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000422446  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1384  transaminase  54.05 
 
 
373 aa  434  1e-120  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2317  transaminase  52.82 
 
 
376 aa  413  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22340  aminotransferase  51.35 
 
 
372 aa  409  1e-113  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000310554  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0155  aminotransferase class I and II  51.89 
 
 
372 aa  402  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01640  aminotransferase  49.73 
 
 
372 aa  400  9.999999999999999e-111  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.278296  hitchhiker  0.0000000160919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4257  transaminase  42.7 
 
 
374 aa  339  4e-92  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5695  transaminase  41.89 
 
 
374 aa  330  2e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.679406 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2069  transaminase  41.94 
 
 
374 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0152643 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05340  aspartate/tyrosine/aromatic aminotransferase  37.1 
 
 
377 aa  273  4.0000000000000004e-72  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05193  aminotransferase function, hypothetical (Eurofung)  39.75 
 
 
409 aa  271  9e-72  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1447  aminotransferase class I and II  32 
 
 
368 aa  199  6e-50  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0268591  normal  0.142096 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_50446  Aspartate aminotransferase (Transaminase A) (AspAT)  31.58 
 
 
404 aa  193  4e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.566303 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0549  aminotransferase  30.14 
 
 
380 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1405  aminotransferase, class I and II  29.95 
 
 
362 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.269129  normal  0.550876 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0519  aminotransferase class I and II  32.17 
 
 
377 aa  175  9.999999999999999e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_515  aminotransferase, DapL-like protein  29.3 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2143  aminotransferase class I and II  29.35 
 
 
356 aa  172  9e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0576  aminotransferase, classes I and II  27.89 
 
 
383 aa  168  2e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2228  putative aminotransferase protein  29.86 
 
 
379 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.8778 
 
 
-
 
NC_003296  RS01751  putative aminotransferase protein  33.55 
 
 
374 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.267131  normal  0.787087 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1580  aminotransferase class I and II  29.27 
 
 
382 aa  159  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.12368 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0212  hypothetical protein  27.54 
 
 
362 aa  146  5e-34  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4902  aminotransferase class I and II  31.97 
 
 
375 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000774086 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1475  aminotransferase  29.07 
 
 
363 aa  137  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3451  aminotransferase class I and II  26.43 
 
 
380 aa  135  9.999999999999999e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00028237 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1417  aspartate aminotransferase  29.51 
 
 
400 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.557805 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1377  aspartate aminotransferase  29.84 
 
 
400 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.489913  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1471  aspartate aminotransferase  29.22 
 
 
400 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.219389  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1760  aspartate aminotransferase  28.66 
 
 
402 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.801832  normal  0.0251287 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1326  aminotransferase AlaT  32.49 
 
 
413 aa  127  3e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0763036  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1201  aminotransferase AlaT  33.12 
 
 
413 aa  126  7e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.895209  normal  0.0291272 
 
 
-
 
NC_003296  RS01913  aspartate aminotransferase  27.36 
 
 
395 aa  125  2e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0779024 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0255  aminotransferase, class I and II  26.8 
 
 
411 aa  124  2e-27  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1627  aspartate aminotransferase  28.7 
 
 
408 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0411376 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1262  aminotransferase AlaT  32.49 
 
 
429 aa  124  4e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.30879  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1516  aminotransferase, class I and II  30.43 
 
 
377 aa  123  5e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1565  aminotransferase class I and II  30.43 
 
 
377 aa  123  5e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4249  aminotransferase, class I and II  25.27 
 
 
360 aa  122  8e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1014  aspartate aminotransferase  28.57 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1495  aspartate aminotransferase  28.57 
 
 
400 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0405  aspartate aminotransferase  26.75 
 
 
403 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.152588  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2403  aminotransferase class I and II  28.57 
 
 
387 aa  120  3e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0215397  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1479  aminotransferase  25.86 
 
 
397 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1734  aspartate aminotransferase  28.39 
 
 
410 aa  119  6e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  26.65 
 
 
456 aa  119  7e-26  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0254  aspartate aminotransferase  27.03 
 
 
388 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.144129  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1967  aminotransferase AlaT  33.54 
 
 
409 aa  118  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000390932  normal  0.209887 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0624  aspartate aminotransferase  26.39 
 
 
395 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.68726  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0293  aspartate aminotransferase  26.09 
 
 
390 aa  118  1.9999999999999998e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.422454 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5220  aminotransferase AlaT  31.75 
 
 
411 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0739506  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3516  aspartate aminotransferase  26.24 
 
 
385 aa  117  3e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1257  aspartate aminotransferase  25 
 
 
390 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.823666  normal  0.0561409 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2662  aminotransferase AlaT  32.17 
 
 
409 aa  117  3.9999999999999997e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1338  aminotransferase class I and II  25.27 
 
 
377 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2825  aspartate aminotransferase  27.95 
 
 
408 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0376  aminotransferase, class I and II  25.63 
 
 
373 aa  115  8.999999999999998e-25  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.276364  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0346  aspartate aminotransferase  26.86 
 
 
399 aa  115  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.550604  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2197  aminotransferase AlaT  31.95 
 
 
412 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141545  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2664  aminotransferase class I and II  27.01 
 
 
393 aa  113  4.0000000000000004e-24  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0937488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1874  aspartate aminotransferase  26.96 
 
 
380 aa  113  5e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0842  aminotransferase AlaT  30.41 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.387526  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1911  aminotransferase AlaT  31.33 
 
 
426 aa  112  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2163  aminotransferase, classes I and II  27.25 
 
 
380 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1495  aspartate aminotransferase  25.85 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00201329 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3098  aminotransferase class I and II  27.44 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00347911  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0226  aspartate aminotransferase  24.77 
 
 
388 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0081  aminotransferase, class I and II  26.18 
 
 
398 aa  111  2.0000000000000002e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1108  aminotransferase, class I and II  26.78 
 
 
384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00053469  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1994  aminotransferase AlaT  32.69 
 
 
427 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1131  aminotransferase class I and II  26.78 
 
 
384 aa  110  4.0000000000000004e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000220252  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4784  aspartate aminotransferase  22.81 
 
 
387 aa  110  4.0000000000000004e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0127  aminotransferase class I and II  27.7 
 
 
399 aa  110  4.0000000000000004e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0585  aminotransferase class I and II  25.36 
 
 
375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0437  aminotransferase AlaT  30.7 
 
 
418 aa  109  7.000000000000001e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2819  aspartate aminotransferase  25.31 
 
 
385 aa  109  9.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.437854 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0167  aminotransferase AlaT  27.53 
 
 
404 aa  109  9.000000000000001e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3740  aminotransferase class I and II  25.64 
 
 
397 aa  108  1e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0346922  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2408  aminotransferase class I and II  27.05 
 
 
383 aa  108  2e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.987173  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1540  aminotransferase AlaT  29.62 
 
 
409 aa  107  3e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.790745 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1973  aminotransferase, class I and II  26.63 
 
 
429 aa  107  3e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.238227  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0437  bifunctional HTH-domain containing protein/aminotransferase  26.53 
 
 
518 aa  107  3e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2127  aspartate aminotransferase  23.62 
 
 
388 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0111  putative aspartate transaminase  28.53 
 
 
401 aa  107  5e-22  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1935  aminotransferase AlaT  28.85 
 
 
404 aa  106  5e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00236574  normal  0.0314212 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2213  aminotransferase, class I and II  25.52 
 
 
408 aa  107  5e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2419  aminotransferase  24.6 
 
 
396 aa  107  5e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.181004  normal  0.0698642 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1621  aspartate aminotransferase  25.42 
 
 
395 aa  106  6e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.624357  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1458  aminotransferase  28.72 
 
 
404 aa  106  8e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0513  aminotransferase class I and II  27.33 
 
 
383 aa  105  9e-22  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00548158 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2026  aminotransferase AlaT  27.44 
 
 
409 aa  105  1e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4061  aspartate aminotransferase  23.59 
 
 
389 aa  105  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.257184 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1817  aminotransferase class I and II  26.95 
 
 
385 aa  105  1e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1642  aspartate aminotransferase  25.74 
 
 
397 aa  105  1e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2861  hypothetical protein  28.29 
 
 
390 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2387  aminotransferase AlaT  29.62 
 
 
414 aa  104  2e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2232  aminotransferase AlaT  29.87 
 
 
407 aa  105  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0248058  hitchhiker  0.00000226565 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1993  aminotransferase AlaT  27.24 
 
 
404 aa  105  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000000340923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0701  aspartate aminotransferase  28.99 
 
 
392 aa  104  2e-21  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1274  aspartate aminotransferase  27.52 
 
 
392 aa  104  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.175604  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>