14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1439 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1439  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  227  5e-59  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00180208  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1420  hypothetical protein  40.74 
 
 
117 aa  85.5  2e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.0000234918  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0572  hypothetical protein  37.84 
 
 
116 aa  62  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.767573  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2055  hypothetical protein  32.14 
 
 
126 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0998  hypothetical protein  26.72 
 
 
128 aa  57  0.00000009  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3051  hypothetical protein  29.17 
 
 
122 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08970  hypothetical protein  28 
 
 
134 aa  52  0.000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.197478 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1820  hypothetical protein  27.27 
 
 
142 aa  51.6  0.000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3098  hypothetical protein  30.77 
 
 
116 aa  49.7  0.00001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000402787  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2569  hypothetical protein  28.04 
 
 
146 aa  46.2  0.0002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3016  hypothetical protein  24.77 
 
 
122 aa  45.4  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0972901  hitchhiker  0.0000118668 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2227  hypothetical protein  23.81 
 
 
121 aa  43.5  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.886761  hitchhiker  0.00000158862 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2682  hypothetical protein  22.22 
 
 
147 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0836033  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0214  hypothetical protein  32.38 
 
 
117 aa  40.4  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>