More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1416 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1416  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
401 aa  798  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00145831  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0769  oxalate:formate antiporter  64.64 
 
 
406 aa  463  1e-129  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00153428  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1606  major facilitator transporter  55.81 
 
 
412 aa  456  1e-127  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C10  major facilitator superfamily permease  55.21 
 
 
413 aa  437  1e-121  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1036  major facilitator superfamily MFS_1  45.41 
 
 
433 aa  332  1e-89  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1344  major facilitator superfamily MFS_1  46.62 
 
 
421 aa  325  1e-87  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1890  major facilitator superfamily transporter  45.48 
 
 
424 aa  323  2e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00250834  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0467  major facilitator superfamily MFS_1  46.62 
 
 
424 aa  317  2e-85  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000451235  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3923  major facilitator transporter  37.41 
 
 
418 aa  285  7e-76  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.768461  normal  0.191124 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3728  major facilitator transporter  37.56 
 
 
411 aa  279  8e-74  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3733  major facilitator transporter  35.32 
 
 
397 aa  263  4e-69  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0256  major facilitator transporter  36.88 
 
 
424 aa  257  2e-67  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.146977  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1307  major facilitator superfamily MFS_1  33.83 
 
 
538 aa  247  3e-64  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4689  major facilitator transporter  36.43 
 
 
467 aa  238  9e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.436057  normal  0.0558767 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6036  major facilitator superfamily MFS_1  36.89 
 
 
467 aa  238  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.475953 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4078  major facilitator superfamily oxalate/formate antiporter  37.67 
 
 
475 aa  236  6e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.801255  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2270  major facilitator superfamily (MFS)oxalate/formate antiporter  36.19 
 
 
467 aa  234  2e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.248871  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13430  nitrate/nitrite transporter  36.86 
 
 
507 aa  226  6e-58  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.0010455  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2008  major facilitator transporter  36.19 
 
 
467 aa  224  2e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1169  major facilitator superfamily MFS_1  37.17 
 
 
455 aa  218  2e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.968326  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2808  major facilitator superfamily MFS_1  36.82 
 
 
456 aa  216  5e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.018941 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4006  major facilitator transporter  30.88 
 
 
550 aa  216  5e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.456883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4762  major facilitator superfamily MFS_1  37.82 
 
 
471 aa  214  2e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0868  major facilitator superfamily MFS_1  29.59 
 
 
453 aa  213  4e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0872  major facilitator superfamily MFS_1  30.05 
 
 
453 aa  212  8e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0593371  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0961  major facilitator transporter  35.68 
 
 
463 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3185  major facilitator superfamily MFS_1  36.73 
 
 
464 aa  210  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.88619 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0620  major facilitator transporter  34.37 
 
 
549 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0808  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 
549 aa  209  1e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4281  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 
575 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4391  major facilitator superfamily MFS_1  33.98 
 
 
575 aa  208  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.344697  normal  0.796533 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1045  major facilitator superfamily MFS_1  35.68 
 
 
464 aa  207  3e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0858  major facilitator transporter  29.18 
 
 
442 aa  207  4e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.326759  normal  0.152741 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4642  major facilitator transporter  34.36 
 
 
548 aa  206  5e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3578  major facilitator transporter  33.49 
 
 
553 aa  206  5e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3633  major facilitator superfamily MFS_1  34.13 
 
 
552 aa  204  3e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.364379 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0490  major facilitator transporter  33.82 
 
 
537 aa  204  3e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.685431  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0111  major facilitator superfamily MFS_1  34.37 
 
 
546 aa  203  5e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS02384  transporter transmembrane protein  34.2 
 
 
549 aa  202  1e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.458603 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3922  major facilitator superfamily MFS_1  33.17 
 
 
552 aa  198  2e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.92025  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0986  major facilitator transporter  30.89 
 
 
556 aa  195  1e-48  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1405  putative permease  33.58 
 
 
428 aa  194  2e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1158  major facilitator superfamily MFS_1  34.72 
 
 
448 aa  194  2e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.791207  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4093  MFS permease  31.32 
 
 
552 aa  194  3e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.979947  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5340  MFS permease-like protein  33.49 
 
 
553 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2301  major facilitator superfamily MFS_1  34.74 
 
 
518 aa  192  1e-47  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.298617  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6345  major facilitator superfamily permease  30.52 
 
 
551 aa  191  3e-47  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0404816  normal  0.0784492 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4899  major facilitator transporter  33.01 
 
 
553 aa  190  3e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3829  major facilitator superfamily transporter  29.68 
 
 
547 aa  189  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.257719  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00470  integral membrane transporter  29.6 
 
 
558 aa  188  1e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0394066  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0434  major facilitator transporter  33.24 
 
 
391 aa  188  2e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  4.43521e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4920  major facilitator transporter  30.89 
 
 
552 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0958503  hitchhiker  0.000474897 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1334  major facilitator transporter  29.27 
 
 
545 aa  187  3e-46  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2386  major facilitator transporter  32.13 
 
 
556 aa  186  5e-46  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0322  major facilitator transporter  32.77 
 
 
554 aa  186  8e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.41241  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0313  major facilitator transporter  30.82 
 
 
553 aa  184  2e-45  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0288  major facilitator superfamily MFS_1  30.64 
 
 
553 aa  184  2e-45  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000241924 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0308  major facilitator transporter  30.64 
 
 
553 aa  184  3e-45  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00531015 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5500  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 
545 aa  183  4e-45  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3696  major facilitator superfamily MFS_1  30.45 
 
 
545 aa  183  4e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.662162  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1179  major facilitator superfamily MFS_1  33.24 
 
 
408 aa  183  5e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1744  major facilitator superfamily MFS_1  32.33 
 
 
425 aa  181  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.799326  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1880  major facilitator superfamily MFS_1  32.23 
 
 
407 aa  181  2e-44  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0103294  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2172  major facilitator superfamily MFS_1  32.96 
 
 
407 aa  179  8e-44  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00749383  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1293  major facilitator transporter  32.3 
 
 
566 aa  179  1e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2922  major facilitator superfamily MFS_1  31.47 
 
 
416 aa  176  8e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3406  major facilitator transporter  30.85 
 
 
408 aa  176  9e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.913918  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0515  major facilitator transporter  31.94 
 
 
418 aa  176  9e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3191  major facilitator superfamily MFS_1  29.37 
 
 
545 aa  176  1e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2459  major facilitator transporter  31.33 
 
 
402 aa  174  3e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0169362  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2958  major facilitator transporter  29.1 
 
 
421 aa  173  4e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.175452  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3046  major facilitator superfamily MFS_1  29.29 
 
 
421 aa  173  6e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.548752  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3154  major facilitator superfamily MFS_1  29.04 
 
 
421 aa  172  7e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.328617  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2680  oxalate:formate antiporter  30.5 
 
 
402 aa  172  8e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2495  oxalate:formate antiporter  30.5 
 
 
402 aa  172  8e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.116022  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0466  major facilitator superfamily MFS_1  31.61 
 
 
415 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2456  oxalate/formate antiporter (permease)  30.94 
 
 
402 aa  171  2e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001991  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2428  oxalate:formate antiporter (permease)  33.24 
 
 
402 aa  171  2e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.739048  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2746  putative oxalate:formate antiporter  30.94 
 
 
402 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  3.11684e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2718  oxalate:formate antiporter, putative  30.98 
 
 
402 aa  170  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.00584048  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2695  putative oxalate:formate antiporter  30.94 
 
 
402 aa  169  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.83174e-08 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2703  putative oxalate:formate antiporter  30.94 
 
 
402 aa  169  6e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1705  major facilitator transporter  29.74 
 
 
442 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0038  major facilitator transporter  31.17 
 
 
432 aa  169  9e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2607  putative oxalate:formate antiporter  30.94 
 
 
402 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  1.21238e-05 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1720  major facilitator transporter  29.88 
 
 
419 aa  167  2e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.127263  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0444  major facilitator transporter  30.56 
 
 
422 aa  164  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.17352  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1858  major facilitator transporter  31.06 
 
 
402 aa  162  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.633531  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2356  major facilitator superfamily MFS_1  29.11 
 
 
405 aa  159  9e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0356  major facilitator superfamily MFS_1  28.31 
 
 
411 aa  152  1e-35  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2174  major facilitator transporter  29.53 
 
 
400 aa  151  2e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0165144  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2736  major facilitator family transporter  27.14 
 
 
398 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.601142  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2952  major facilitator family transporter  27.14 
 
 
398 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1247  major facilitator transporter  30.47 
 
 
431 aa  150  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.131802 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2817  major facilitator family transporter  26.97 
 
 
398 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0448046  normal  0.764982 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2777  major facilitator family transporter  27.14 
 
 
398 aa  150  3e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2840  major facilitator family transporter  26.88 
 
 
398 aa  150  4e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.638107  normal  0.599456 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2332  putative oxalate:formate antiporter  29.37 
 
 
400 aa  148  2e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0134794  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2396  oxalate:formate antiporter, putative  29.25 
 
 
400 aa  147  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.429266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2993  putative oxalate:formate antiporter  28.86 
 
 
400 aa  146  6e-34  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0223405  normal  0.0497096 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>