More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1387 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1387  DNA-binding response regulator  100 
 
 		 214 aa  431  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00141106  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0322  DNA-binding response regulator  84.43 
 
 		 213 aa  362  2e-99  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1495  DNA-binding response regulator  62.5 
 
 		 210 aa  270  1e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000174821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1160  two component LuxR family transcriptional regulator  62.2 
 
 		 210 aa  270  1e-71  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1563  DNA-binding response regulator  61.54 
 
 		 210 aa  267  7e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000942452  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1348  DNA-binding response regulator  61.54 
 
 		 210 aa  267  7e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000440829  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1322  response regulator  61.54 
 
 		 210 aa  267  7e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.30192e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1457  DNA-binding response regulator  61.54 
 
 		 210 aa  267  7e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000538049  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1601  DNA-binding response regulator  61.54 
 
 		 210 aa  267  7e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000136266  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1363  two component LuxR family transcriptional regulator  61.54 
 
 		 210 aa  267  7e-71  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0039551  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3849  DNA-binding response regulator  61.06 
 
 		 210 aa  266  2e-70  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000308683  hitchhiker  0.000000000350245 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1531  DNA-binding response regulator  61.06 
 
 		 210 aa  265  2.9999999999999995e-70  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.64189e-24 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1321  response regulator  61.06 
 
 		 210 aa  265  5e-70  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000332221  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1316  two component transcriptional regulator, LuxR family  57.69 
 
 		 210 aa  249  2e-65  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0967  DNA-binding response regulator  58.17 
 
 		 209 aa  238  5e-62  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.598364  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1938  two component LuxR family transcriptional regulator  50.49 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1972  response regulator receiver  50.49 
 
 		 209 aa  219  3e-56  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2079  two component transcriptional regulator, LuxR family  54 
 
 		 212 aa  213  1.9999999999999998e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0340  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.3 
 
 		 217 aa  209  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00614189  hitchhiker  0.00317709 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 216 aa  203  1e-51  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3654  two component LuxR family transcriptional regulator  50.23 
 
 		 221 aa  201  6e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000210563  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2809  two component LuxR family transcriptional regulator  46.54 
 
 		 219 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1422  DNA-binding response regulator VraR  49.51 
 
 		 209 aa  196  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.871667  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.24 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5540  DNA-binding response regulator  46.26 
 
 		 215 aa  188  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5591  DNA-binding response regulator  46.26 
 
 		 215 aa  187  8e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5263  DNA-binding response regulator  45.79 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.24037  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5091  response regulator  45.79 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5108  response regulator  45.79 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00235048  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5661  DNA-binding response regulator  45.79 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5535  DNA-binding response regulator  45.79 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5506  DNA-binding response regulator  45.79 
 
 		 215 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5417  DNA-binding response regulator  45.79 
 
 		 215 aa  184  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  44.6 
 
 		 216 aa  184  8e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1708  two component LuxR family transcriptional regulator  44.93 
 
 		 221 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.685529 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.69 
 
 		 225 aa  183  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  46.67 
 
 		 213 aa  182  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5205  two component LuxR family transcriptional regulator  44.86 
 
 		 215 aa  181  6e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1104  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 218 aa  179  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.348687  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1984  two component LuxR family transcriptional regulator  43.72 
 
 		 220 aa  178  7e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.178457  normal  0.123783 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2848  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.58 
 
 		 212 aa  177  8e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.857037  normal  0.944506 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4778  two component LuxR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 208 aa  177  9e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000269792  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.31 
 
 		 216 aa  177  1e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1929  two component transcriptional regulator, LuxR family  46.19 
 
 		 209 aa  177  1e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.142226  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3331  response regulator receiver protein  45.02 
 
 		 227 aa  174  6e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.832029  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  41.86 
 
 		 232 aa  174  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.06 
 
 		 216 aa  173  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  43.48 
 
 		 207 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3262  two component LuxR family transcriptional regulator  42.65 
 
 		 222 aa  171  5.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.764026 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  41.89 
 
 		 223 aa  171  9e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4485  two component LuxR family transcriptional regulator  43 
 
 		 213 aa  170  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.310872  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38420  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  41.78 
 
 		 226 aa  170  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  41.59 
 
 		 219 aa  169  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  42.45 
 
 		 214 aa  170  2e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  42.51 
 
 		 212 aa  169  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.33 
 
 		 218 aa  169  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29940  two component transcriptional regulator, LuxR family  43 
 
 		 234 aa  169  4e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.683883 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2109  LuxR family DNA-binding response regulator  44.66 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2048  response regulator  44.66 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.102554  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2046  response regulator  44.66 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2265  LuxR family DNA-binding response regulator  44.66 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.201191  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  44.61 
 
 		 213 aa  168  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4258  two component LuxR family transcriptional regulator  40.67 
 
 		 216 aa  168  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2290  DNA-binding response regulator, LuxR family  44.66 
 
 		 209 aa  168  6e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000736213 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  43.4 
 
 		 218 aa  168  7e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3078  DNA-binding response regulator, LuxR family  41.74 
 
 		 213 aa  167  8e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000185138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1205  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.83 
 
 		 212 aa  167  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  41.71 
 
 		 222 aa  167  1e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2375  DNA-binding response regulator, LuxR family  44.66 
 
 		 209 aa  167  1e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.248491  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0409  two component LuxR family transcriptional regulator  39.63 
 
 		 232 aa  167  1e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.135269  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2511  two component LuxR family transcriptional regulator  41.31 
 
 		 229 aa  166  2e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2635  response regulator receiver  41.63 
 
 		 207 aa  166  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  43.81 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0358431  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1769  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.36 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.221401  normal  0.0578747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4217  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.04 
 
 		 225 aa  166  2e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.000816589  normal  0.757819 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_374  DNA-binding response regulator, LuxR family  39.63 
 
 		 232 aa  166  2e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000120759  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2245  DNA-binding response regulator, LuxR family  42.2 
 
 		 213 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  43 
 
 		 209 aa  166  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  40.45 
 
 		 222 aa  165  4e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  42.27 
 
 		 242 aa  165  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5375  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.37 
 
 		 218 aa  165  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0621  two component LuxR family transcriptional regulator  42.31 
 
 		 212 aa  165  5.9999999999999996e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.881689 
 
 
-
 
NC_002936  DET0432  LuxR family DNA-binding response regulator  39.63 
 
 		 232 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00543066  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33010  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  40.19 
 
 		 223 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.163463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.1 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.55 
 
 		 218 aa  163  1.0000000000000001e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1619  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.01 
 
 		 234 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1881  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0160211  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00210  response regulator containing a CheY-like receiver domain protein and an HTH DNA-binding domain protein  42.79 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.133182 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1966  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.81 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 237 aa  163  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0951  LuxR family two component transcriptional regulator  41.12 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.392411  normal  0.343359 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0116  two component LuxR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 209 aa  162  3e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  43.32 
 
 		 237 aa  162  3e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  44.29 
 
 		 212 aa  162  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1401  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.15 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.482316 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0335  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.33 
 
 		 220 aa  162  3e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3676  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.5 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0625047  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1198  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.36 
 
 		 225 aa  162  4.0000000000000004e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.109916  normal  0.0247339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>