More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1283 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1283  L-serine dehydratase alpha subunit  100 
 
 
289 aa  577  1.0000000000000001e-163  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.199144  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2146  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  78.2 
 
 
290 aa  437  1e-121  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.284202  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0888  L-serine ammonia-lyase / 2-hydroxymethylglutarate dehydratase  65.05 
 
 
287 aa  350  2e-95  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00304555  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1076  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  59.86 
 
 
297 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.036098  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1966  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  58.82 
 
 
294 aa  318  7e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2834  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  59.17 
 
 
290 aa  313  9.999999999999999e-85  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4247  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  59.17 
 
 
292 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4208  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  58.82 
 
 
292 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3892  L-serine dehydratase, alpha subunit  58.82 
 
 
292 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4271  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  58.82 
 
 
292 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4046  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit alpha  58.82 
 
 
292 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3884  L-serine dehydratase, alpha subunit  58.82 
 
 
292 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4360  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit alpha  58.82 
 
 
292 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4161  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  58.82 
 
 
292 aa  312  4.999999999999999e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0989  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  58.82 
 
 
292 aa  311  1e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3970  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  57.79 
 
 
292 aa  308  8e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1073  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  53.26 
 
 
293 aa  272  4.0000000000000004e-72  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000230696  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2094  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  49.15 
 
 
299 aa  268  1e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2554  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  50.17 
 
 
299 aa  267  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2606  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  50.17 
 
 
299 aa  267  1e-70  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1253  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  51.39 
 
 
294 aa  266  2.9999999999999995e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.987373  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3067  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit alpha  49.14 
 
 
296 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.589265  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3307  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit alpha  49.14 
 
 
296 aa  261  6.999999999999999e-69  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.340076  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1506  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  50.52 
 
 
296 aa  249  4e-65  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0178055  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2483  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  50.17 
 
 
296 aa  248  7e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3287  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  50.17 
 
 
296 aa  247  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1421  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  50.17 
 
 
297 aa  242  6e-63  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0316402  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1058  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  48.9 
 
 
292 aa  239  5e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5570  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  49.83 
 
 
295 aa  233  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.260199 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2960  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  47.29 
 
 
293 aa  233  2.0000000000000002e-60  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2643  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  46.93 
 
 
293 aa  232  5e-60  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2854  L-serine ammonia-lyase  44.25 
 
 
304 aa  227  2e-58  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0174652 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3835  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  51.12 
 
 
287 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.338413  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1246  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  49.08 
 
 
292 aa  223  4e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0490782  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16330  L-serine ammonia-lyase, alpha subunit  44.6 
 
 
288 aa  210  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.59813e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1459  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  44.44 
 
 
292 aa  202  4e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000185683  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1946  L-serine ammonia-lyase  47.39 
 
 
313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.426247  hitchhiker  0.000000256832 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1331  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  44.56 
 
 
296 aa  195  8.000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.742186  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1759  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  45.17 
 
 
291 aa  194  1e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0267  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  45.39 
 
 
290 aa  194  1e-48  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16320  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit/L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  50.21 
 
 
552 aa  193  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  hitchhiker  0.00195001 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1474  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  37.59 
 
 
290 aa  192  4e-48  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2065  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  42.51 
 
 
293 aa  192  4e-48  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000167711  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10070  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit/L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  45.49 
 
 
541 aa  190  2e-47  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000332749  hitchhiker  0.0000000458611 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0503  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  44.11 
 
 
549 aa  189  5.999999999999999e-47  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.742023 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0098  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  42.55 
 
 
291 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000117533  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0952  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  48.78 
 
 
536 aa  180  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235834 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0198  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  37.5 
 
 
283 aa  173  2.9999999999999996e-42  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00000000157551  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0337  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  38.29 
 
 
286 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.794758  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6183  L-serine dehydratase 1  40.36 
 
 
457 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2892  L-serine dehydratase 1  39.08 
 
 
458 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.14665  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  40.82 
 
 
463 aa  162  6e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2603  L-serine dehydratase 1  41.67 
 
 
473 aa  162  7e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0485  L-serine ammonia-lyase  40.49 
 
 
461 aa  160  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0917  serine dehydratase alpha chain  43.75 
 
 
406 aa  160  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.365161  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3503  L-serine dehydratase 1  40.49 
 
 
461 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4369  L-serine ammonia-lyase  39.58 
 
 
464 aa  159  4e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0215032  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10673  L-serine dehydratase  36.84 
 
 
477 aa  159  5e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.436502  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5070  L-serine dehydratase 1  39.44 
 
 
461 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4547  L-serine dehydratase 1  39.44 
 
 
461 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3047  L-serine dehydratase 1  38.75 
 
 
460 aa  159  7e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0679  L-serine dehydratase 1  40.75 
 
 
460 aa  158  8e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5127  L-serine dehydratase 1  40.14 
 
 
461 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5152  L-serine dehydratase 1  40.14 
 
 
461 aa  158  8e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3215  L-serine dehydratase 1  40.14 
 
 
529 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16840  L-serine ammonia-lyase  39.92 
 
 
458 aa  158  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.128912  normal  0.527215 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  40.07 
 
 
463 aa  158  1e-37  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4709  L-serine dehydratase 1  34.13 
 
 
475 aa  157  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0518  L-serine dehydratase 1  39.79 
 
 
457 aa  157  2e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.244314  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3700  L-serine ammonia-lyase  37.93 
 
 
457 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3617  L-serine ammonia-lyase  37.81 
 
 
458 aa  156  3e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0736152  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6246  L-serine dehydratase 1  39.16 
 
 
455 aa  156  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.187309  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1084  L-serine dehydratase 1  40.28 
 
 
472 aa  156  3e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0112  L-serine dehydratase 1  48.62 
 
 
462 aa  156  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2874  L-serine dehydratase 1  39.64 
 
 
457 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.30844  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0095  L-serine ammonia-lyase  48.62 
 
 
462 aa  156  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3334  L-serine dehydratase 1  49.18 
 
 
462 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2109  L-serine dehydratase 1  45.36 
 
 
472 aa  156  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3256  L-serine dehydratase 1  39.02 
 
 
456 aa  156  5.0000000000000005e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6540  L-serine dehydratase 1  38.6 
 
 
459 aa  156  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  hitchhiker  0.00743621  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26040  L-serine dehydratase  42.02 
 
 
458 aa  155  7e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3144  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  41.2 
 
 
458 aa  155  9e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3296  L-serine dehydratase  41.51 
 
 
458 aa  155  9e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2570  L-serine dehydratase 1  40.6 
 
 
458 aa  154  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0045  L-serine dehydratase  39.44 
 
 
461 aa  154  1e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.388959 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01684  L-serine ammonia-lyase  37.63 
 
 
468 aa  155  1e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.737007  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_12590  L-serine ammonia-lyase  38.01 
 
 
464 aa  154  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.82368  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3483  L-serine ammonia-lyase  41.51 
 
 
458 aa  155  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4547  L-serine ammonia-lyase  48.07 
 
 
462 aa  155  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2711  L-serine dehydratase 1  40.82 
 
 
458 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.468733 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1962  L-serine ammonia-lyase / 2-hydroxymethylglutarate dehydratase  45.61 
 
 
457 aa  154  2e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.447397 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2900  L-serine dehydratase 1  39.34 
 
 
458 aa  154  2e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0995  L-serine ammonia-lyase  48.63 
 
 
490 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3490  L-serine dehydratase 1  40.75 
 
 
458 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1024  L-serine dehydratase 1  39.25 
 
 
458 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.846352 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0992  L-serine dehydratase 1  39.36 
 
 
458 aa  153  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4265  L-serine ammonia-lyase  41.89 
 
 
460 aa  152  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0569  L-serine ammonia-lyase  35.25 
 
 
525 aa  152  4e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0531592 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1955  L-serine ammonia-lyase  48.63 
 
 
504 aa  153  4e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0423  L-serine dehydratase 1  38.99 
 
 
470 aa  152  5e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.149927  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>