42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1210 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1210  hypothetical protein  100 
 
 
179 aa  365  1e-100  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3223  hypothetical protein  35.44 
 
 
203 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32650  exopolysaccharide biosynthesis protein  38.93 
 
 
331 aa  96.3  2e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.190914  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2213  hypothetical protein  39.8 
 
 
346 aa  67.8  0.00000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3107  copper amine oxidase domain-containing protein  38.32 
 
 
480 aa  65.9  0.0000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000580148  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0378  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  30.14 
 
 
249 aa  64.3  0.0000000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0303009  normal  0.022945 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0776  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  37.98 
 
 
296 aa  63.5  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2497  hypothetical protein  31.25 
 
 
365 aa  62.8  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16520  SpoIID/LytB domain protein  37.86 
 
 
833 aa  61.6  0.000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000390469  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1967  hypothetical protein  41.84 
 
 
336 aa  61.2  0.000000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4308  hypothetical protein  34.82 
 
 
350 aa  61.2  0.000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143065  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2255  hypothetical protein  41.84 
 
 
336 aa  61.2  0.000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.473897  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0665  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  36.19 
 
 
352 aa  56.6  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2779  hypothetical protein  38.26 
 
 
322 aa  55.8  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000153302  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0002  hypothetical protein  29.41 
 
 
289 aa  55.1  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1397  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 
486 aa  54.7  0.0000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2287  copper amine oxidase domain protein  34.26 
 
 
718 aa  54.3  0.0000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.954621  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3710  exopolysaccharide biosynthesis protein-like  29.46 
 
 
420 aa  53.1  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0492868  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1603  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein exopolysaccharide biosynthesis protein  33.01 
 
 
338 aa  52  0.000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.530926  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3098  exopolysaccharide biosynthesis protein  31.73 
 
 
383 aa  51.6  0.000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000562756  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0889  hypothetical protein  29.37 
 
 
605 aa  50.8  0.00001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.914068  decreased coverage  0.000140666 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0445  N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase-like exopolysaccharide biosynthesis protein  30.4 
 
 
345 aa  50.4  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.809516  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5078  hypothetical protein  33.65 
 
 
304 aa  50.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.988054  normal  0.794905 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1118  hypothetical protein  32.35 
 
 
686 aa  50.1  0.00002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.699386  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1815  hypothetical protein  28.97 
 
 
259 aa  49.3  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.185976  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5794  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  38.24 
 
 
1138 aa  48.9  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0776912 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5835  metallophosphoesterase  44.62 
 
 
1421 aa  48.5  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0189418  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3827  hypothetical protein  30.84 
 
 
603 aa  48.1  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.739864 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2600  hypothetical protein  33.02 
 
 
877 aa  47.8  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00322139  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5836  Collagen triple helix repeat protein  35.06 
 
 
1426 aa  47.4  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.278516  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3267  hypothetical protein  37.84 
 
 
652 aa  46.6  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2399  hypothetical protein  32.29 
 
 
296 aa  44.7  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.735883 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1092  exopolysaccharide biosynthesis protein-like N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N-acetylglucosaminidase  38.37 
 
 
756 aa  44.7  0.0007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.830982 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3222  peptidase M56 BlaR1  30.7 
 
 
747 aa  44.7  0.0008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4427  Ig domain protein group 2 domain protein  29.03 
 
 
1174 aa  43.9  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.407706  normal  0.105272 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0655  hypothetical protein  29.9 
 
 
642 aa  42.7  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1065  metallophosphoesterase  32.32 
 
 
1327 aa  42.4  0.004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4413  hypothetical protein  40 
 
 
430 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1938  Exopolysaccharide biosynthesis protein related to N-acetylglucosamine-1-phosphodiester alpha-N- acetylglucosaminidase-like protein  28.83 
 
 
487 aa  42  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2182  Ig-like, group 2  32.32 
 
 
929 aa  41.6  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.951381  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1360  Exopolysaccharide biosynthesis protein  35.44 
 
 
303 aa  41.2  0.008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.372504  normal  0.614697 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4447  Ig-like, group 2  28.44 
 
 
913 aa  40.8  0.01  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.000000209553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>