127 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1189 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1189  homoserine O-succinyltransferase  100 
 
 
314 aa  652    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3331  homoserine O-succinyltransferase  56.91 
 
 
306 aa  375  1e-103  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00132184  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1845  homoserine O-succinyltransferase  54.1 
 
 
305 aa  367  1e-100  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000102531  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0733  homoserine O-succinyltransferase  54.1 
 
 
309 aa  363  1e-99  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0258153  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1956  homoserine O-succinyltransferase  53.49 
 
 
311 aa  360  2e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0294  homoserine O-succinyltransferase  53.29 
 
 
313 aa  354  8.999999999999999e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0046  homoserine O-succinyltransferase  54.28 
 
 
304 aa  350  3e-95  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0046  homoserine O-succinyltransferase  54.28 
 
 
304 aa  350  3e-95  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1078  Homoserine O-succinyltransferase  50.49 
 
 
314 aa  349  4e-95  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.1303  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2599  homoserine O-succinyltransferase  53.64 
 
 
302 aa  348  6e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5534  homoserine O-succinyltransferase  52.16 
 
 
301 aa  348  7e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.57848  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5103  homoserine O-succinyltransferase  52.16 
 
 
301 aa  347  1e-94  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.205196  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5198  homoserine O-succinyltransferase  52.16 
 
 
301 aa  347  2e-94  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5257  homoserine O-succinyltransferase  52.16 
 
 
301 aa  346  3e-94  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5500  homoserine O-succinyltransferase  52.16 
 
 
301 aa  346  3e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5584  homoserine O-succinyltransferase  51.83 
 
 
301 aa  346  3e-94  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.019403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5086  homoserine O-succinyltransferase  51.83 
 
 
301 aa  345  4e-94  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00854912  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5423  homoserine O-succinyltransferase  52.16 
 
 
301 aa  345  4e-94  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000619745  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1567  homoserine O-succinyltransferase  51.99 
 
 
302 aa  345  6e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3162  homoserine O-succinyltransferase  52.3 
 
 
312 aa  343  2.9999999999999997e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.630653 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2925  homoserine O-succinyltransferase  51.83 
 
 
301 aa  342  4e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5528  homoserine O-succinyltransferase  51.5 
 
 
301 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00950255  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4581  homoserine O-succinyltransferase  52.3 
 
 
307 aa  338  5.9999999999999996e-92  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000227967  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3924  homoserine O-succinyltransferase  50.5 
 
 
301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0654032  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3021  homoserine O-succinyltransferase  50.33 
 
 
308 aa  329  4e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2551  homoserine O-succinyltransferase  50 
 
 
321 aa  325  5e-88  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1374  homoserine O-succinyltransferase  48.68 
 
 
316 aa  325  6e-88  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.968831  normal  0.0257357 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1216  homoserine O-succinyltransferase  49.02 
 
 
319 aa  325  7e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.350697  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2772  homoserine O-succinyltransferase  48.68 
 
 
313 aa  323  3e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00163618 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3204  homoserine O-succinyltransferase  48.68 
 
 
314 aa  323  3e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0264716  unclonable  0.0000000200152 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2598  homoserine O-succinyltransferase  48.68 
 
 
313 aa  322  7e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00675576  hitchhiker  0.0000129585 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2665  homoserine O-succinyltransferase  48.68 
 
 
313 aa  322  7e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00279787  normal  0.638831 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02861  homoserine O-succinyltransferase  50 
 
 
312 aa  322  7e-87  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1336  homoserine O-succinyltransferase  48.68 
 
 
314 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.198455  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0292  homoserine O-succinyltransferase  49.34 
 
 
309 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.18082  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0637  homoserine O-succinyltransferase  49.34 
 
 
309 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.35705  normal  0.0503855 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0363  homoserine O-succinyltransferase  49.34 
 
 
309 aa  321  9.999999999999999e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.708442  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3984  Homoserine O-succinyltransferase  49.01 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5655  homoserine O-succinyltransferase  51.97 
 
 
279 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_15020  homoserine O-succinyltransferase  48.36 
 
 
304 aa  320  1.9999999999999998e-86  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00909944  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1395  homoserine O-succinyltransferase  48.68 
 
 
318 aa  319  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0631633  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03885  homoserine O-succinyltransferase  48.68 
 
 
309 aa  318  6e-86  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.393563  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03845  hypothetical protein  48.68 
 
 
309 aa  318  6e-86  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.400251  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4017  homoserine O-succinyltransferase  48.68 
 
 
309 aa  318  6e-86  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.149933 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4467  homoserine O-succinyltransferase  48.36 
 
 
309 aa  317  1e-85  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.214699  normal  0.0469066 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5483  homoserine O-succinyltransferase  48.36 
 
 
309 aa  317  1e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4507  homoserine O-succinyltransferase  48.36 
 
 
309 aa  317  2e-85  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.487887  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2499  homoserine O-succinyltransferase  48.04 
 
 
312 aa  317  2e-85  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4247  homoserine O-succinyltransferase  48.36 
 
 
309 aa  316  3e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4555  homoserine O-succinyltransferase  48.36 
 
 
309 aa  316  3e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.628604  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2588  homoserine O-succinyltransferase  48.03 
 
 
314 aa  315  4e-85  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0439713  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4518  homoserine O-succinyltransferase  48.68 
 
 
309 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.105129  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4515  homoserine O-succinyltransferase  48.68 
 
 
309 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.164795 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4393  homoserine O-succinyltransferase  48.68 
 
 
309 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.442234  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4428  homoserine O-succinyltransferase  48.68 
 
 
309 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4591  homoserine O-succinyltransferase  48.68 
 
 
309 aa  316  4e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1676  homoserine O-succinyltransferase  47.7 
 
 
313 aa  315  5e-85  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1493  homoserine O-succinyltransferase  47.7 
 
 
313 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.112065  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1488  homoserine O-succinyltransferase  47.7 
 
 
313 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.256727  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1524  homoserine O-succinyltransferase  47.7 
 
 
313 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.153444  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2858  homoserine O-succinyltransferase  47.7 
 
 
313 aa  315  5e-85  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  hitchhiker  0.000000000557635 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4504  homoserine O-succinyltransferase  49.34 
 
 
309 aa  315  7e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.295159  hitchhiker  0.00456401 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0112  homoserine O-succinyltransferase  48.36 
 
 
305 aa  315  9e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.9309  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0075  homoserine O-succinyltransferase  47.7 
 
 
327 aa  314  9.999999999999999e-85  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0449  homoserine O-succinyltransferase  48.68 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3959  homoserine O-succinyltransferase  48.36 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3780  homoserine O-succinyltransferase  48.03 
 
 
309 aa  314  9.999999999999999e-85  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2784  homoserine O-succinyltransferase  47.37 
 
 
314 aa  314  9.999999999999999e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0176984  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1472  homoserine O-succinyltransferase  46.71 
 
 
314 aa  308  5.9999999999999995e-83  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.244322  hitchhiker  0.000239725 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0364  homoserine O-succinyltransferase  46.71 
 
 
309 aa  306  3e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0217  homoserine O-succinyltransferase  46.71 
 
 
309 aa  305  7e-82  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0394319 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02491  homoserine O-succinyltransferase  49.19 
 
 
313 aa  304  1.0000000000000001e-81  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1130  homoserine O-succinyltransferase  45.57 
 
 
344 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0141  homoserine O-succinyltransferase  45.57 
 
 
343 aa  301  8.000000000000001e-81  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.711356 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003633  homoserine O-succinyltransferase  47.88 
 
 
313 aa  301  1e-80  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.579711  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0486  homoserine O-succinyltransferase  46.38 
 
 
306 aa  300  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.552753  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0424  homoserine O-succinyltransferase  46.38 
 
 
322 aa  298  6e-80  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1100  homoserine O-succinyltransferase  46.69 
 
 
315 aa  298  7e-80  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237834  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0371  homoserine O-succinyltransferase  47.12 
 
 
299 aa  298  1e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.473501 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3489  homoserine O-succinyltransferase  45.39 
 
 
306 aa  295  9e-79  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1379  homoserine O-succinyltransferase  45.39 
 
 
312 aa  290  2e-77  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3030  homoserine O-succinyltransferase  44.82 
 
 
323 aa  290  2e-77  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.436733 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0684  homoserine O-succinyltransferase  46.05 
 
 
301 aa  289  4e-77  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.965727  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3805  homoserine O-succinyltransferase  42.53 
 
 
307 aa  289  5.0000000000000004e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.849842 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4134  homoserine O-succinyltransferase  42.53 
 
 
307 aa  288  6e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.497722 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2166  homoserine O-succinyltransferase  45.39 
 
 
305 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3083  homoserine O-succinyltransferase  43.09 
 
 
312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0019  homoserine O-succinyltransferase  45.64 
 
 
306 aa  283  3.0000000000000004e-75  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0010  homoserine O-succinyltransferase  45.07 
 
 
305 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.48395  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2351  homoserine O-succinyltransferase  43.46 
 
 
313 aa  281  1e-74  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.412479  normal  0.146068 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1640  homoserine O-succinyltransferase  45.07 
 
 
305 aa  281  1e-74  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.35195 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0280  homoserine O-succinyltransferase  45.13 
 
 
306 aa  279  4e-74  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1593  homoserine O-succinyltransferase  44.41 
 
 
305 aa  279  5e-74  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.695076  normal  0.229155 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4253  homoserine O-succinyltransferase  43.09 
 
 
309 aa  278  6e-74  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4499  homoserine O-succinyltransferase  43.46 
 
 
308 aa  277  1e-73  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.697474  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0586  homoserine O-succinyltransferase  43.09 
 
 
317 aa  269  4e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.60384  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1894  homoserine O-succinyltransferase  42.43 
 
 
293 aa  248  9e-65  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0022  homoserine O-succinyltransferase  42.43 
 
 
293 aa  248  9e-65  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7783  homoserine O-succinyltransferase  37.24 
 
 
301 aa  230  3e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0285  homoserine O-succinyltransferase  41.09 
 
 
268 aa  209  6e-53  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>