43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1188 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1188  DNA replication protein dnaD  100 
 
 		 232 aa  477  1e-134  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.130151  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1204  DNA replication protein DnaD, putative  45.89 
 
 		 226 aa  221  4.9999999999999996e-57  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1171  DNA replication protein DnaD  35.06 
 
 		 222 aa  152  4e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.293784  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1096  DNA replication protein DnaD  23.9 
 
 		 242 aa  58.2  0.0000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2110  primosome, DnaD subunit  24.42 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0104842  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1269  primosome, DnaD subunit  26.24 
 
 		 235 aa  55.8  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.551895  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2103  primosome, DnaD subunit  24.43 
 
 		 280 aa  53.1  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.897597  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1640  DNA replication protein DnaD  26.42 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00450904 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1380  DNA replication protein DnaD  23.86 
 
 		 211 aa  52.8  0.000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1455  DNA replication protein DnaD  26.42 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1427  DNA replication protein  26.42 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.726752  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1428  DNA replication protein  26.42 
 
 		 235 aa  52.4  0.000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.588673  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1569  DNA replication protein DnaD  26.42 
 
 		 235 aa  52.8  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.719562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1471  primosome, DnaD subunit  25.38 
 
 		 235 aa  52.4  0.000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1027  putative primosome component related protein  23.13 
 
 		 214 aa  52  0.000008  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0152207  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1023  DNA replication protein DnaD, putative  25 
 
 		 228 aa  51.6  0.00001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1602  DNA replication protein DnaD  25.38 
 
 		 235 aa  51.2  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3743  DNA replication protein DnaD  25.38 
 
 		 235 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.737814  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_480  primosome component  28.4 
 
 		 236 aa  51.2  0.00001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1703  primosome, DnaD subunit  25.76 
 
 		 263 aa  50.4  0.00002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1675  DNA replication protein DnaD  25.94 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1713  DNA replication protein DnaD  25.94 
 
 		 235 aa  50.8  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0499649  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0539  DnaD and phage-associated domain-containing protein  28.31 
 
 		 236 aa  50.4  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.245634  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0515  primosome, DnaD subunit  28.24 
 
 		 236 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0509  primosome, DnaD subunit  33.33 
 
 		 233 aa  46.6  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1148  primosome, DnaD subunit  29.35 
 
 		 239 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  unclonable  0.0000000149796  decreased coverage  0.00111014 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1507  phage replication protein  37.7 
 
 		 295 aa  46.2  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0584377 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3989  primosome, DnaD subunit  28.26 
 
 		 239 aa  44.7  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000533541 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1185  DNA replication protein DnaD  22.81 
 
 		 249 aa  43.9  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.913732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1541  primosome, DnaD subunit  21.99 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4331  DnaD domain protein  37.88 
 
 		 288 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0351037 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1023  DnaD domain protein  37.88 
 
 		 286 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.81342e-28 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1637  primosome, DnaD subunit  24.18 
 
 		 251 aa  43.1  0.004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1512  primosome, DnaD subunit  21.99 
 
 		 228 aa  42.7  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.762034  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0839  phage replication protein  37.88 
 
 		 286 aa  43.1  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0982  DnaD domain protein  36.36 
 
 		 286 aa  42.4  0.006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1109  DnaD domain protein  34.85 
 
 		 158 aa  42  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0256887  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0848  phage replication protein  36.36 
 
 		 286 aa  42  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0879  DnaD domain-containing protein  37.88 
 
 		 286 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0933  DnaD domain-containing protein  37.88 
 
 		 286 aa  42  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4024  putative prophage LambdaBa04, DnaD replication protein  32.89 
 
 		 290 aa  42  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1027  DnaD domain-containing protein  37.88 
 
 		 286 aa  42  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1288  primosome, DnaD subunit  32.11 
 
 		 272 aa  42  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.360467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>