222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1146 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1146  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  183  6e-46  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0377196  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2509  hypothetical protein  47.67 
 
 		 90 aa  78.6  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0540  hypothetical protein  41.38 
 
 		 91 aa  73.2  0.000000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000524259  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10160  monofunctional chorismate mutase, clade 2  39.08 
 
 		 403 aa  62  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000617885  hitchhiker  0.000000765088 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1589  transcription termination factor NusA  43.37 
 
 		 359 aa  61.6  0.000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3022  chorismate mutase  44.16 
 
 		 360 aa  62  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.123559  normal  0.97386 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0269  chorismate mutase/prephenate dehydratase  39.74 
 
 		 358 aa  60.5  0.000000008  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2375  chorismate mutase  40.23 
 
 		 378 aa  60.5  0.000000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1323  chorismate mutase  33.75 
 
 		 90 aa  60.1  0.000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0361  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0216  chorismate mutase  41.98 
 
 		 355 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0338  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40 
 
 		 357 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  35.9 
 
 		 370 aa  59.3  0.00000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1647  chorismate mutase/prephenate dehydratase  38.75 
 
 		 357 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000136907  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2767  chorismate mutase  34.94 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.642402 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2566  chorismate mutase  38.37 
 
 		 357 aa  56.2  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0470  chorismate mutase, gamma, beta and epsilon  38.1 
 
 		 363 aa  55.5  0.0000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1666  P-protein  37.21 
 
 		 359 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  38.64 
 
 		 379 aa  55.8  0.0000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0287  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  50 
 
 		 375 aa  55.1  0.0000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0568  chorismate mutase  34.52 
 
 		 362 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  32.95 
 
 		 374 aa  54.7  0.0000004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  34.18 
 
 		 387 aa  54.7  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1336  chorismate mutase  38.46 
 
 		 413 aa  54.7  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  32.91 
 
 		 382 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1132  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  50.98 
 
 		 373 aa  53.5  0.0000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0692  chorismate mutase  34.83 
 
 		 97 aa  53.5  0.0000009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0459162  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3147  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  50.98 
 
 		 373 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1299  chorismate mutase/prephenate dehydratase  34.52 
 
 		 359 aa  53.5  0.000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1955  chorismate mutase  30.12 
 
 		 98 aa  52.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00612945  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2335  Chorismate mutase  32.5 
 
 		 91 aa  53.5  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1618  bifunctional 3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase/chorismate mutase  31.71 
 
 		 350 aa  53.1  0.000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1360  chorismate mutase/prephenate dehydratase  40.74 
 
 		 357 aa  52.8  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1875  Chorismate mutase  31.33 
 
 		 91 aa  52.8  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.890024  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0227  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  48.08 
 
 		 375 aa  52.4  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1828  chorismate mutase domain-containing protein  31.25 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215612  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1244  prephenate dehydratase / chorismate mutase  43.4 
 
 		 371 aa  51.6  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0482068  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0961  chorismate mutase  30.77 
 
 		 374 aa  51.6  0.000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0691  chorismate mutase  34.09 
 
 		 97 aa  51.6  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0120727  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0116  chorismate mutase  32.53 
 
 		 377 aa  50.8  0.000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  28.05 
 
 		 356 aa  50.4  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1418  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.77 
 
 		 362 aa  50.4  0.000008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  44.23 
 
 		 375 aa  50.4  0.000008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0990  chorismate mutase  33.77 
 
 		 359 aa  50.4  0.000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2513  Chorismate mutase  32.93 
 
 		 107 aa  50.1  0.000009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.514651  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3260  chorismate mutase  33.77 
 
 		 359 aa  49.7  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  44.23 
 
 		 375 aa  49.7  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3121  chorismate mutase  30.26 
 
 		 365 aa  49.7  0.00001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2488  chorismate mutase  27.71 
 
 		 91 aa  50.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1259  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  43.4 
 
 		 379 aa  48.9  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00675448  hitchhiker  0.000301963 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0774  chorismate mutase  31.08 
 
 		 371 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.561025  hitchhiker  0.00484876 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2904  Chorismate mutase  29.27 
 
 		 109 aa  48.9  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0845  chorismate mutase  31.08 
 
 		 371 aa  48.9  0.00002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0602148 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  43.4 
 
 		 375 aa  48.9  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3282  chorismate mutase  31.58 
 
 		 366 aa  48.9  0.00002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0668525  normal  0.62913 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  28.95 
 
 		 360 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  41.51 
 
 		 384 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2121  chorismate mutase, putative  31.71 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0926  chorismate mutase / prephenate dehydratase  35.06 
 
 		 367 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1269  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase  30.68 
 
 		 358 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  45.1 
 
 		 373 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.28721 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  42.31 
 
 		 377 aa  48.1  0.00004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1647  Chorismate mutase  30 
 
 		 95 aa  48.1  0.00004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0046  chorismate mutase, putative  28.05 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.52978  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2882  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  45.1 
 
 		 373 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0721758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2813  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  45.1 
 
 		 373 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2996  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  45.1 
 
 		 373 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2274  Chorismate mutase  29.27 
 
 		 108 aa  48.1  0.00004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2863  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  45.1 
 
 		 373 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0273979 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0894  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  41.51 
 
 		 379 aa  47.8  0.00005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.121322  normal  0.591266 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1164  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  41.51 
 
 		 379 aa  47.8  0.00006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00398091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  29.27 
 
 		 381 aa  47.4  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0365  chorismate mutase / prephenate dehydratase  36.56 
 
 		 385 aa  47.4  0.00007  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0036667  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02489  fused chorismate mutase T/prephenate dehydrogenase  45.1 
 
 		 373 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.555514  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1074  chorismate mutase  45.1 
 
 		 373 aa  47  0.00008  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.134673  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2757  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  45.1 
 
 		 373 aa  47  0.00008  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176639  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.77 
 
 		 360 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.77 
 
 		 360 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2267  Chorismate mutase  30.59 
 
 		 121 aa  47  0.00008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.577678  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.77 
 
 		 360 aa  47  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2884  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  45.1 
 
 		 373 aa  47  0.00008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0271953  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1083  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  45.1 
 
 		 373 aa  47  0.00008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.676844  hitchhiker  0.000106918 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2987  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  45.1 
 
 		 373 aa  47  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000572711  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2752  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  45.1 
 
 		 373 aa  47  0.00008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000708785  normal  0.0483395 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02453  hypothetical protein  45.1 
 
 		 373 aa  47  0.00008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.58394  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.77 
 
 		 360 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.77 
 
 		 360 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.77 
 
 		 360 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.77 
 
 		 360 aa  47  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.77 
 
 		 360 aa  47  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1173  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  41.51 
 
 		 383 aa  47  0.00008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00322769  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3839  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  45.1 
 
 		 373 aa  47  0.00009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00182808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3098  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  41.51 
 
 		 379 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000040953  normal  0.11712 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1362  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  41.51 
 
 		 379 aa  46.6  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3219  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  37.5 
 
 		 373 aa  46.6  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1887  chorismate mutase-P and prephenate dehydratase  32.47 
 
 		 360 aa  46.6  0.0001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000192693  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2833  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  41.51 
 
 		 379 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00724041  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  41.51 
 
 		 379 aa  46.6  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0333151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2915  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  42.31 
 
 		 383 aa  46.6  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.449795  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1292  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  41.51 
 
 		 383 aa  46.6  0.0001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0548711  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>