More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1050 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_1050  permease  100 
 
 		 378 aa  751    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000509244  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1102  hypothetical protein  52.14 
 
 		 377 aa  354  2e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0908719  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26240  predicted permease  36.49 
 
 		 400 aa  233  4.0000000000000004e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1755  hypothetical protein  32.69 
 
 		 372 aa  193  4e-48  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.00000000122074  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1423  hypothetical protein  35.84 
 
 		 368 aa  177  3e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00001195  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0522  hypothetical protein  32.84 
 
 		 377 aa  165  1.0000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.176917  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3257  hypothetical protein  35.57 
 
 		 540 aa  164  2.0000000000000002e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1463  protein of unknown function UPF0118  28.65 
 
 		 407 aa  162  9e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0707  permease, putative  31.23 
 
 		 391 aa  160  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0716  hypothetical protein  30.66 
 
 		 366 aa  160  5e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.073836  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0411  protein of unknown function UPF0118  29.61 
 
 		 402 aa  134  1.9999999999999998e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2169  hypothetical protein  28.25 
 
 		 368 aa  125  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.215488  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1880  hypothetical protein  26.39 
 
 		 372 aa  126  8.000000000000001e-28  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0162246  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3920  hypothetical protein  32.82 
 
 		 434 aa  125  1e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000253725  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0568  hypothetical protein  27.41 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0554  hypothetical protein  27.22 
 
 		 366 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3575  protein of unknown function UPF0118  25.91 
 
 		 344 aa  95.5  1e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00192559  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1330  protein of unknown function UPF0118  24.54 
 
 		 351 aa  91.7  2e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0558  hypothetical protein  26.4 
 
 		 362 aa  89.4  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0561744  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2001  permease  25 
 
 		 371 aa  89  1e-16  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2702  hypothetical protein  26.95 
 
 		 353 aa  84.7  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0593591 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09400  predicted permease  33.79 
 
 		 357 aa  84.7  0.000000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.291782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3031  protein of unknown function UPF0118  23.75 
 
 		 377 aa  84  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1860  permease  23.3 
 
 		 369 aa  84  0.000000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2027  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 354 aa  83.6  0.000000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.294883  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2732  hypothetical protein  26.43 
 
 		 345 aa  83.2  0.000000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2702  protein of unknown function UPF0118  25.97 
 
 		 358 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00631725  hitchhiker  0.0000000345193 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3225  hypothetical protein  28.57 
 
 		 390 aa  82  0.00000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1010  hypothetical protein  27.35 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.389096  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1029  hypothetical protein  27.35 
 
 		 361 aa  81.6  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.951774  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1647  hypothetical protein  23.96 
 
 		 345 aa  81.3  0.00000000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0171139 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3895  protein of unknown function UPF0118  25.57 
 
 		 529 aa  80.9  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.374859  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1509  hypothetical protein  25.09 
 
 		 365 aa  79.7  0.00000000000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3442  protein of unknown function UPF0118  28.91 
 
 		 397 aa  79.3  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.804701 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3286  protein of unknown function UPF0118  29 
 
 		 354 aa  78.6  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1351  permease  24.85 
 
 		 390 aa  79.3  0.0000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0749  protein of unknown function UPF0118  24.59 
 
 		 417 aa  78.6  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.104647 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1849  hypothetical protein  33.33 
 
 		 365 aa  78.6  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.326919  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1235  protein of unknown function UPF0118  24.16 
 
 		 354 aa  77.8  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0768  hypothetical protein  22.01 
 
 		 343 aa  76.6  0.0000000000006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.011294  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1196  protein of unknown function UPF0118  23.24 
 
 		 349 aa  76.6  0.0000000000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0956  hypothetical protein  22.34 
 
 		 367 aa  76.3  0.0000000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0478197  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2700  hypothetical protein  31.94 
 
 		 373 aa  75.9  0.000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.19448  normal  0.72788 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1793  hypothetical protein  23.78 
 
 		 387 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.116515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1198  protein of unknown function UPF0118  29 
 
 		 390 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2868  protein of unknown function UPF0118  22.68 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.579917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0409  hypothetical protein  26.55 
 
 		 387 aa  73.6  0.000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.196528 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1347  permease  23.34 
 
 		 393 aa  73.2  0.000000000007  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0428205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1713  hypothetical protein  24.62 
 
 		 371 aa  72.8  0.00000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.655848  normal  0.476202 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0159  hypothetical protein  24.03 
 
 		 381 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0479062 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1354  hypothetical protein  24.13 
 
 		 375 aa  72.4  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.00000000000360215  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2721  hypothetical protein  25.95 
 
 		 361 aa  72.4  0.00000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00186421  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1781  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 		 368 aa  71.6  0.00000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.836553  hitchhiker  0.00769603 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0907  protein of unknown function UPF0118  32.54 
 
 		 423 aa  71.6  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00600861  normal  0.0221352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7547  protein of unknown function UPF0118  27.02 
 
 		 392 aa  72  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43907  normal  0.494892 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2709  hypothetical protein  26.57 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000235293  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2916  hypothetical protein  26.57 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000469324 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2660  permease  26.57 
 
 		 361 aa  69.7  0.00000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00181766  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3393  protein of unknown function UPF0118  22.61 
 
 		 426 aa  70.1  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.334585  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4060  hypothetical protein  22.91 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1056  hypothetical protein  21.6 
 
 		 398 aa  69.7  0.00000000008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0492  hypothetical protein  28.09 
 
 		 374 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0961  protein of unknown function UPF0118  24.65 
 
 		 382 aa  69.3  0.00000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00685895 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2575  hypothetical protein  27.59 
 
 		 415 aa  69.7  0.00000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.41372  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2955  hypothetical protein  27.88 
 
 		 373 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0331656  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2961  hypothetical protein  27.88 
 
 		 361 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0186622  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2916  hypothetical protein  28.32 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0169  hypothetical protein  23.38 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0178  hypothetical protein  23.38 
 
 		 381 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0518  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 		 397 aa  68.2  0.0000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.318359  normal  0.0533128 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2637  permease  27.88 
 
 		 348 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.386693  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2316  hypothetical protein  26.87 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.582551  hitchhiker  0.00000126508 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2927  hypothetical protein  26.87 
 
 		 361 aa  68.6  0.0000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05740  predicted permease  24.06 
 
 		 351 aa  68.2  0.0000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0159553  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0467  hypothetical protein  26.17 
 
 		 339 aa  68.6  0.0000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000010449  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0938  protein of unknown function UPF0118  27.85 
 
 		 420 aa  68.6  0.0000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1998  transporter, putative  31.75 
 
 		 370 aa  67.8  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000649848  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3833  protein of unknown function UPF0118  26.76 
 
 		 364 aa  67.8  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3199  hypothetical protein  23.24 
 
 		 349 aa  68.2  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0020334  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2839  protein of unknown function UPF0118  25.49 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0111296  normal  0.2349 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2523  protein of unknown function UPF0118  30.66 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1731  protein of unknown function UPF0118  21.93 
 
 		 373 aa  67.4  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.90656  normal  0.570586 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0120  protein of unknown function UPF0118  22.3 
 
 		 436 aa  67.4  0.0000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0225  protein of unknown function UPF0118  22.54 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000651141  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3583  protein of unknown function UPF0118  30.66 
 
 		 360 aa  67.4  0.0000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.274831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1995  hypothetical protein  25.37 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0255666  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0457  hypothetical protein  24.01 
 
 		 383 aa  66.6  0.0000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.775898 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0503  protein of unknown function UPF0118  23.89 
 
 		 416 aa  66.2  0.0000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3795  protein of unknown function UPF0118  32.26 
 
 		 350 aa  66.6  0.0000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.625058 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0111  permease  22.47 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0779  Lipocalin-related protein and Bos/Can/Equ allergen  24.45 
 
 		 375 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.770407  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0703  putative permease  29.5 
 
 		 382 aa  65.5  0.000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1855  hypothetical protein  25.51 
 
 		 380 aa  65.5  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.631285 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1226  hypothetical protein  23.34 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1297  hypothetical protein  23.6 
 
 		 382 aa  66.2  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.675511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2435  hypothetical protein  24.45 
 
 		 358 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0853714  normal  0.0537169 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1243  hypothetical protein  23.34 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.597847 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0929  hypothetical protein  23.79 
 
 		 405 aa  65.1  0.000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0224  protein of unknown function UPF0118  21.51 
 
 		 345 aa  65.1  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000072412  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2291  hypothetical protein  24.57 
 
 		 424 aa  65.5  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>