19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1048 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1048  hypothetical protein  100 
 
 
92 aa  177  4e-44  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.487326  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2538  hypothetical protein  43.9 
 
 
112 aa  69.3  0.00000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2853  hypothetical protein  44.87 
 
 
112 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1229  hypothetical protein  53.85 
 
 
95 aa  52.8  0.000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.508002  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1649  hypothetical protein  34.07 
 
 
128 aa  50.1  0.00001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10850  hypothetical protein  48.98 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2459  hypothetical protein  40.38 
 
 
126 aa  47.8  0.00005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4899  ATP synthase B chain [imported], putative  34.41 
 
 
100 aa  47.4  0.00008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2562  hypothetical protein  33.67 
 
 
99 aa  46.2  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1893  hypothetical protein  32.58 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.546257  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12240  hypothetical protein  28.24 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00576975  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1208  hypothetical protein  30.59 
 
 
100 aa  42.7  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0697544  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3248  hypothetical protein  32.97 
 
 
98 aa  42.7  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000561356  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0868  hypothetical protein  39.62 
 
 
118 aa  42  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.775127  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1592  hypothetical protein  41.67 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.371318  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1611  hypothetical protein  30.68 
 
 
100 aa  40.8  0.006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.300137  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0741  hypothetical protein  35.42 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.386527  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4398  hypothetical protein  34 
 
 
129 aa  40.8  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0244  hypothetical protein  36.21 
 
 
113 aa  40  0.01  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.691917 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>