More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_1027 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_1027  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  100 
 
 
322 aa  635    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00946746  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0360  transport system permease protein  36.36 
 
 
323 aa  184  1.0000000000000001e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.166825  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06133  hypothetical protein  36.4 
 
 
316 aa  178  1e-43  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000330  iron(III) ABC transporter permease protein  33.85 
 
 
316 aa  167  2e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.000000000947678  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4093  iron chelate ABC transporter, permease protein  38.87 
 
 
335 aa  164  2.0000000000000002e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.842143  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4145  iron chelate ABC transporter permease  38.87 
 
 
335 aa  163  4.0000000000000004e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.116139  normal  0.0126806 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3704  transport system permease protein  35.92 
 
 
350 aa  162  5.0000000000000005e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.287102  normal  0.653673 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0069  transport system permease protein  38.87 
 
 
335 aa  163  5.0000000000000005e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2368  transport system permease protein  33.22 
 
 
335 aa  160  3e-38  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0419043 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0636  transport system permease protein  34.88 
 
 
333 aa  160  3e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0103144  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0634  iron compound ABC transporter, permease protein  33.79 
 
 
317 aa  158  1e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0677  iron compound ABC transporter, permease protein  33.79 
 
 
317 aa  158  2e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0999  vibriobactin and enterobactin ABC transporter, permease protein  32.86 
 
 
316 aa  155  7e-37  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000308675  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3799  transport system permease protein  33.1 
 
 
317 aa  155  9e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1542  enterochelin ABC transporter, permease protein  35.5 
 
 
312 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1352  enterochelin ABC transporter, permease protein  35.5 
 
 
312 aa  154  2e-36  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4266  hypothetical protein  34.11 
 
 
314 aa  150  2e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16580  ABC-type enterochelin transport system, permease component  34.86 
 
 
362 aa  150  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1009  iron compound ABC transporter, permease protein  33.1 
 
 
324 aa  144  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0108445  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34420  ABC-type enterochelin transport system, permease component  31.03 
 
 
331 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30520  ABC-type enterochelin transport system, permease component  31.94 
 
 
415 aa  142  8e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2402  transport system permease protein  33.44 
 
 
333 aa  142  8e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0334561  hitchhiker  0.00465255 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0732  transport system permease protein  33.33 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0398177  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2661  transport system permease protein  33.23 
 
 
352 aa  140  3e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3785  transport system permease protein  35.31 
 
 
345 aa  140  3e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1007  transport system permease protein  31.69 
 
 
332 aa  139  4.999999999999999e-32  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0401  iron compound ABC transporter, permease protein  33.1 
 
 
317 aa  139  7.999999999999999e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1909  transport system permease protein  33 
 
 
355 aa  139  8.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.318272  normal  0.0548852 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0019  transport system permease protein  31.01 
 
 
344 aa  138  1e-31  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4398  transport system permease protein  34.02 
 
 
316 aa  135  6.0000000000000005e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.210595 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2665  transport system permease protein  31.91 
 
 
344 aa  135  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1930  transport system permease protein  31.78 
 
 
336 aa  135  8e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.276463  normal  0.0688299 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1765  transport system permease protein  34.39 
 
 
335 aa  135  8e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0506654  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5224  iron compound ABC transporter, permease protein  29.51 
 
 
354 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2625  transport system permease protein  33.22 
 
 
316 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.544933  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4951  iron compound ABC transporter permease  29.93 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.489666  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4793  iron compound ABC transporter, permease  29.93 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000230814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4813  iron compound ABC transporter, permease  29.93 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.436223  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5232  iron compound ABC transporter, permease protein  29.93 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5328  iron compound ABC transporter permease protein  29.93 
 
 
354 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5195  iron compound ABC transporter, permease protein  29.93 
 
 
354 aa  134  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2914  transport system permease protein  30.63 
 
 
354 aa  133  3.9999999999999996e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000603005  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0009  iron compound ABC transporter, permease protein  29.93 
 
 
354 aa  132  6e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5245  iron compound ABC transporter, permease protein  29.97 
 
 
354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1113  iron chelate ABC transporter, permease protein  30.17 
 
 
316 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2037  transport system permease protein  34.62 
 
 
335 aa  129  6e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0298  transport system permease protein  34.47 
 
 
319 aa  129  8.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1628  transport system permease protein  29.15 
 
 
316 aa  128  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.453837  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1395  transport system permease protein  32.9 
 
 
346 aa  127  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.587032  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0659  transport system permease protein  30.42 
 
 
369 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25330  ABC-type enterochelin transport system, permease component  32.98 
 
 
366 aa  126  6e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0758  transport system permease protein  32.52 
 
 
318 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0775  transport system permease protein  32.52 
 
 
318 aa  123  4e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.800341  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4916  transport system permease protein  30.11 
 
 
354 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3342  transport system permease protein  29.63 
 
 
316 aa  117  3e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00135825  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3668  transport system permease protein  29.63 
 
 
301 aa  116  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02107  hypothetical protein  25.46 
 
 
317 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3960  transport system permease protein  31.27 
 
 
314 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3469  transport system permease protein  29.29 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0102454 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3221  ABC ferric siderophore transporter, inner membrane subunit  31.46 
 
 
314 aa  113  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_04600  ABC-type enterochelin transport system, permease component  33.45 
 
 
356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.28276  normal  0.299561 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2593  ferric siderophore ABC transporter, permease protein  27.85 
 
 
313 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.510431  normal  0.118224 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5026  transport system permease protein  29.9 
 
 
326 aa  93.2  6e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.337084  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  23.34 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01537  ABC-type hemin transport system, pemease component  29.77 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4407  transport system permease protein  26.17 
 
 
376 aa  69.3  0.00000000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.257397  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0809  putative ferrichrome ABC transporter, permease protein FhuG  23.24 
 
 
337 aa  68.9  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0901321  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0796  ferrichrome transport system, permease protein  23.24 
 
 
337 aa  68.6  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.228796  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1094  ABC Fe3+-siderophore transporter, inner membrane subunit  23.49 
 
 
373 aa  67  0.0000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0044816  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  29.52 
 
 
358 aa  67  0.0000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0731  transport system permease protein  27.34 
 
 
320 aa  66.6  0.0000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000021523  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1748  transport system permease protein  21.53 
 
 
347 aa  66.2  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  28.22 
 
 
354 aa  65.5  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3903  transport system permease protein  26.49 
 
 
338 aa  65.5  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1008  iron-hydroxamate transporter permease subunit  25.96 
 
 
639 aa  65.1  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1205  transport system permease protein  22.34 
 
 
327 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000150198 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1490  ABC transporter, permease protein, FecCD family  22.34 
 
 
327 aa  65.1  0.000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1389  iron (III) ABC transporter, permease  25.89 
 
 
332 aa  64.7  0.000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.953687  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4263  transport system permease protein  23.34 
 
 
337 aa  63.9  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000122038  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1565  transport system permease protein  25.93 
 
 
355 aa  63.9  0.000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435862  normal  0.696259 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5511  iron compound ABC transporter, permease protein  22.34 
 
 
338 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0672  transport system permease protein  21.37 
 
 
338 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3481  iron compound ABC transporter, permease  20.82 
 
 
340 aa  63.5  0.000000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  32.23 
 
 
367 aa  63.5  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1720  hypothetical protein  24.16 
 
 
350 aa  63.9  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0687  transport system permease protein  21.37 
 
 
338 aa  63.9  0.000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.418253  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5505  iron compound ABC transporter, permease protein  22.34 
 
 
338 aa  63.9  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5560  iron compound ABC transporter, permease protein  22.34 
 
 
338 aa  63.5  0.000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5446  iron compound ABC transporter, permease protein  22.34 
 
 
338 aa  63.2  0.000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5474  iron compound ABC transporter, permease protein  22.34 
 
 
338 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5231  iron compound ABC transporter permease  22.34 
 
 
338 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5062  iron compound ABC transporter, permease  22.34 
 
 
338 aa  63.5  0.000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5079  iron compound ABC transporter, permease  22.34 
 
 
338 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2407  transport system permease protein  20.28 
 
 
340 aa  63.5  0.000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00125347  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5630  iron compound ABC transporter permease protein  22.34 
 
 
338 aa  63.5  0.000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0691  iron-dicitrate transporter subunit FecD  26.57 
 
 
318 aa  63.2  0.000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5175  transport system permease protein  25.41 
 
 
338 aa  63.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3769  iron compound ABC transporter, permease protein  21.07 
 
 
340 aa  63.2  0.000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3504  transport system permease protein  21.4 
 
 
340 aa  63.2  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24720  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  21.23 
 
 
362 aa  63.2  0.000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>