250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0898 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0898  hypothetical protein  100 
 
 
335 aa  649    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000268128  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1125  hypothetical protein  59.7 
 
 
335 aa  385  1e-106  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0133757  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2518  hypothetical protein  55.71 
 
 
380 aa  367  1e-100  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0344  hypothetical protein  52.37 
 
 
344 aa  302  4.0000000000000003e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0629  hypothetical protein  42.14 
 
 
335 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0425471  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3872  hypothetical protein  41.08 
 
 
328 aa  230  3e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.151479  normal  0.91261 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1141  hypothetical protein  36.23 
 
 
337 aa  202  9e-51  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000695815  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1780  hypothetical protein  38.64 
 
 
344 aa  187  2e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0136409  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0523  hypothetical protein  37.58 
 
 
372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.339912  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0054  hypothetical protein  36.44 
 
 
341 aa  168  1e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000167469  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4081  hypothetical protein  35.97 
 
 
326 aa  155  8e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01436  hypothetical protein  36.21 
 
 
284 aa  149  8e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0104  hypothetical protein  36.84 
 
 
310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4968  hypothetical protein  30.91 
 
 
340 aa  146  5e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0141  hypothetical protein  35.39 
 
 
314 aa  145  7.0000000000000006e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5024  hypothetical protein  31.02 
 
 
352 aa  145  8.000000000000001e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004026  membrane protein  36.96 
 
 
305 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4854  hypothetical protein  30.72 
 
 
352 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5405  hypothetical protein  31.02 
 
 
340 aa  145  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5262  hypothetical protein  30.72 
 
 
340 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2089  hypothetical protein  28.83 
 
 
355 aa  144  2e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.121156 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5337  hypothetical protein  30.72 
 
 
340 aa  143  3e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4869  membrane spanning protein  30.42 
 
 
352 aa  143  4e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1680  hypothetical protein  30.42 
 
 
355 aa  141  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.543199  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5665  hypothetical protein  31.02 
 
 
340 aa  141  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2004  hypothetical protein  32.88 
 
 
330 aa  140  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.594252 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0341  membrane protein  34.77 
 
 
313 aa  139  4.999999999999999e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.00265216  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1682  hypothetical protein  31.6 
 
 
315 aa  137  2e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0952  hypothetical protein  34.96 
 
 
310 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.337499  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4708  hypothetical protein  33.66 
 
 
316 aa  136  5e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5279  hypothetical protein  30.42 
 
 
352 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0216  hypothetical protein  34.4 
 
 
315 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0268  hypothetical protein  35.49 
 
 
311 aa  135  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.706274  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3853  hypothetical protein  34.31 
 
 
316 aa  135  8e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3868  hypothetical protein  33.88 
 
 
316 aa  135  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1256  TPR repeat-containing protein  33.66 
 
 
573 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00857901  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4061  hypothetical protein  33.66 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4296  hypothetical protein  33.88 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0104  hypothetical protein  33.88 
 
 
316 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2818  hypothetical protein  34 
 
 
322 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1598  hypothetical protein  35.97 
 
 
310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5292  hypothetical protein  30.72 
 
 
340 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4370  hypothetical protein  28.88 
 
 
339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4241  hypothetical protein  33.55 
 
 
316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4436  hypothetical protein  33.55 
 
 
316 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3946  hypothetical protein  33.99 
 
 
316 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2179  hypothetical protein  37.23 
 
 
310 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000299596  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3668  hypothetical protein  34.63 
 
 
318 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1444  hypothetical protein  36.8 
 
 
331 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3594  hypothetical protein  30.71 
 
 
348 aa  129  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.641351 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0702  hypothetical protein  28.27 
 
 
340 aa  129  8.000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5003  hypothetical protein  33.77 
 
 
333 aa  129  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0262077  normal  0.0158793 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2884  hypothetical protein  34.31 
 
 
333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0969686  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4339  hypothetical protein  32.2 
 
 
319 aa  127  3e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.37076  normal  0.118932 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2028  hypothetical protein  29.29 
 
 
348 aa  124  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3715  hypothetical protein  30.16 
 
 
337 aa  124  2e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0265  hypothetical protein  28.52 
 
 
360 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.374713  normal  0.0240041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2660  hypothetical protein  28.52 
 
 
360 aa  124  2e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.130389  normal  0.451658 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6940  Uncharacterized protein family UPF0324  34.33 
 
 
334 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2274  hypothetical protein  31.42 
 
 
304 aa  120  3e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0409494  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05460  conserved hypothetical integral membrane protein TIGR00698  29.45 
 
 
326 aa  119  9e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000315595  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0263  hypothetical protein  29 
 
 
324 aa  119  9e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4698  hypothetical protein  31.06 
 
 
329 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5153  hypothetical protein  32.38 
 
 
341 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.021934  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1147  hypothetical protein  30.45 
 
 
345 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000396509  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1970  hypothetical protein  28.62 
 
 
354 aa  117  1.9999999999999998e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2578  hypothetical protein  30.47 
 
 
377 aa  116  6e-25  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0082  hypothetical protein  30.48 
 
 
338 aa  116  6e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000103691  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4213  hypothetical protein  29.15 
 
 
356 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.900146  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3719  hypothetical protein  29.81 
 
 
356 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2292  hypothetical protein  29.63 
 
 
356 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2159  hypothetical protein  29.63 
 
 
356 aa  112  9e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0957  hypothetical protein  29.63 
 
 
356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0285  Uncharacterized protein family UPF0324  27.4 
 
 
340 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1874  hypothetical protein  28.15 
 
 
352 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.393392 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0925  hypothetical protein  26.2 
 
 
343 aa  111  1.0000000000000001e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000804675  normal  0.16942 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1656  hypothetical protein  27.51 
 
 
357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0559162  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6343  hypothetical protein  29.53 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1736  hypothetical protein  29.53 
 
 
361 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2100  hypothetical protein  29.29 
 
 
356 aa  110  3e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.435669  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0115  hypothetical protein  28.76 
 
 
368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0187  hypothetical protein  33.47 
 
 
310 aa  109  6e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000719377  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6450  hypothetical protein  33.33 
 
 
348 aa  109  6e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.974477 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1749  hypothetical protein  28.9 
 
 
346 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0127  hypothetical protein  26.33 
 
 
339 aa  108  9.000000000000001e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.212611  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8665  hypothetical protein  28.12 
 
 
360 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0028  hypothetical protein  30.18 
 
 
336 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.47731  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00911  inner membrane protein YeiH  24.93 
 
 
355 aa  108  2e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0290892  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1490  hypothetical protein  28.4 
 
 
349 aa  108  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000179624  normal  0.0171626 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02087  conserved inner membrane protein  27.95 
 
 
349 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00658288  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1500  conserved hypothetical protein  27.95 
 
 
349 aa  107  3e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000452069  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2305  hypothetical protein  27.95 
 
 
349 aa  107  3e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00169786 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3294  hypothetical protein  27.95 
 
 
349 aa  107  3e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0422537  normal  0.35594 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0808  hypothetical protein  27.95 
 
 
349 aa  107  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02046  hypothetical protein  27.95 
 
 
349 aa  107  3e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00703548  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2294  hypothetical protein  27.95 
 
 
349 aa  107  3e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2455  hypothetical protein  27.95 
 
 
349 aa  107  3e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2496  hypothetical protein  28.47 
 
 
336 aa  106  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.819969 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0213  hypothetical protein  30.62 
 
 
350 aa  106  5e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0027  hypothetical protein  30.42 
 
 
346 aa  106  7e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>