28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0828 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0828  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 282 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1459  transcriptional regulator, XRE family  27.36 
 
 		 119 aa  49.3  0.00007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000265254 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0025  transcriptional regulator, XRE family  34.48 
 
 		 183 aa  47.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.401315  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 325 aa  45.8  0.0007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2889  DNA-binding protein  25.93 
 
 		 223 aa  45.1  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  40.38 
 
 		 128 aa  45.1  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2568  LacI family transcription regulator  25.93 
 
 		 223 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  45.1  0.002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 191 aa  45.1  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1476  XRE family transcriptional regulator  29.07 
 
 		 91 aa  43.9  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 161 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 182 aa  43.5  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 161 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 176 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 161 aa  43.5  0.004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1208  XRE family transcriptional regulator  31.94 
 
 		 106 aa  42.7  0.007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00990984  normal  0.388652 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3114  XRE family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 120 aa  42.7  0.007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  30.77 
 
 		 175 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 145 aa  42.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1585  transcriptional regulator, XRE family  32.69 
 
 		 124 aa  42.7  0.008  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.772364  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  44.44 
 
 		 223 aa  42.4  0.008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  30.91 
 
 		 165 aa  42.4  0.008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  30.77 
 
 		 140 aa  42.4  0.008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1457  XRE family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 116 aa  42.4  0.008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00956808  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  31.48 
 
 		 170 aa  42.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  39.58 
 
 		 128 aa  42.4  0.01  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 91 aa  42.4  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>