More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0794 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0794  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 
277 aa  564  1e-160  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1076  HemK family modification methylase  60.73 
 
 
276 aa  332  3e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.260993  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0614  methylase of polypeptide chain release factor  48.08 
 
 
271 aa  255  7e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0453  HemK family modification methylase  38.78 
 
 
288 aa  201  8e-51  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1783  methylase of polypeptide chain release factor  47.68 
 
 
330 aa  198  7e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0752  modification methylase, HemK family  42.32 
 
 
262 aa  187  2e-46  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000141124  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1783  modification methylase, HemK family  48.85 
 
 
281 aa  184  1.0000000000000001e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_5054  HemK family modification methylase  42.8 
 
 
284 aa  181  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.244317  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1581  methylase of polypeptide chain release factor  36.58 
 
 
275 aa  170  3e-41  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2176  modification methylase, HemK family  39.72 
 
 
288 aa  169  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.697869  normal  0.919129 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0413  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.26 
 
 
279 aa  168  7e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000613381  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5501  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.02 
 
 
283 aa  167  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000174977  unclonable  6.52131e-26 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5126  HemK family modification methylase  40.08 
 
 
283 aa  167  2e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0481456  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1383  HemK family modification methylase  38.71 
 
 
289 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5451  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.67 
 
 
283 aa  166  4e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00030744  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3849  HemK family modification methylase  38.84 
 
 
283 aa  163  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000350241  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2220  modification methylase, HemK family  41.28 
 
 
286 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.018393 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09408  putative protoporphyrinogen oxidase  43.78 
 
 
282 aa  162  5.0000000000000005e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.506099  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5028  HemK family modification methylase  38.84 
 
 
283 aa  162  7e-39  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.497663  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1724  HemK family modification methylase  36.43 
 
 
278 aa  162  8.000000000000001e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0688898  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3525  HemK family modification methylase  38.52 
 
 
285 aa  160  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.836843  normal  0.984536 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3373  modification methylase, HemK family  42.37 
 
 
285 aa  161  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.359412  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5177  HemK family modification methylase  38.43 
 
 
283 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.825959  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5012  HemK family modification methylase  38.43 
 
 
283 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000084912  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3434  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  36.88 
 
 
293 aa  160  2e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5571  HemK family modification methylase  38.43 
 
 
283 aa  160  2e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0023749  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5420  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.43 
 
 
283 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  9.97899e-62 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0202  protoporphyrinogen oxidase  39.08 
 
 
287 aa  160  2e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0093  HemK family modification methylase  41.79 
 
 
279 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.165478  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5506  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  38.02 
 
 
283 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000117496  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5455  HemK family modification methylase  38.02 
 
 
283 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00426366  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0020  HemK family modification methylase  42.6 
 
 
285 aa  157  2e-37  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3684  modification methylase HemK  46.04 
 
 
270 aa  156  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3005  HemK family modification methylase  42.66 
 
 
288 aa  156  3e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0616  modification methylase, HemK family  36.84 
 
 
359 aa  152  4e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0068  HemK family modification methylase  38.16 
 
 
283 aa  152  5e-36  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1279  HemK family modification methylase  40.25 
 
 
280 aa  150  2e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1432  modification methylase, HemK family  38.93 
 
 
283 aa  150  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3551  HemK family modification methylase  39.57 
 
 
285 aa  149  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.413637  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3321  modification methylase, HemK family  38.26 
 
 
288 aa  149  5e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000192098  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4207  modification methylase, HemK family  39.5 
 
 
283 aa  149  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2540  modification methylase, HemK family  42.99 
 
 
293 aa  148  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000199798  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1030  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  43.6 
 
 
286 aa  148  8e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.864294  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0774  HemK family modification methylase  42.92 
 
 
283 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0850729 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1808  modification methylase, HemK family  40.36 
 
 
304 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2153  HemK family modification methylase  36.36 
 
 
278 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.200302  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2191  HemK family modification methylase  36.36 
 
 
278 aa  146  3e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.961515  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3523  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  34.28 
 
 
286 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.116496  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3815  modification methylase, HemK family  33.92 
 
 
286 aa  144  2e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.374056  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2938  modification methylase, HemK family  37.67 
 
 
282 aa  143  3e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.557385  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3665  HemK family modification methylase  40.45 
 
 
311 aa  143  4e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.608635  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0388  HemK family modification methylase  43.85 
 
 
279 aa  143  4e-33  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2359  HemK family modification methylase  35.44 
 
 
285 aa  141  9.999999999999999e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4471  HemK family modification methylase  38.57 
 
 
280 aa  141  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.44182  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1694  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  45.21 
 
 
296 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.886603  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2152  HemK family modification methylase  38.89 
 
 
287 aa  140  1.9999999999999998e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0762  HemK family modification methylase  41.83 
 
 
276 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.53968  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0779  Methyltransferase type 12  44.86 
 
 
280 aa  140  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0455874  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0849  HemK family modification methylase  39.47 
 
 
287 aa  139  3.9999999999999997e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.604061  normal  0.576692 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1234  HemK family modification methylase  38.24 
 
 
305 aa  139  4.999999999999999e-32  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4319  modification methylase, HemK family  38.16 
 
 
286 aa  139  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.173015  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2285  hypothetical protein  40.09 
 
 
287 aa  138  7.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0734  methyl transferase  41.35 
 
 
276 aa  138  1e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2258  hypothetical protein  42.03 
 
 
287 aa  137  1e-31  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1114  HemK family modification methylase  39.13 
 
 
278 aa  137  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.026044 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1875  HemK family modification methylase  41.63 
 
 
301 aa  137  1e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.210428  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1157  HemK family modification methylase  39.08 
 
 
308 aa  138  1e-31  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.198451  normal  0.0970281 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004202  Polypeptide chain release factor methylase  41.04 
 
 
284 aa  138  1e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.19334  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17960  modification methylase, HemK family  41.1 
 
 
285 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000857444  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2501  HemK family modification methylase  34.4 
 
 
292 aa  137  2e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.132727 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0522  hemK protein  40 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.109355 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2073  modification methylase, HemK family  37.93 
 
 
283 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.317043  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0850  HemK family modification methylase  44.32 
 
 
280 aa  136  4e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1807  modification methylase, HemK family  38.6 
 
 
255 aa  136  4e-31  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.314516  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1045  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  37.39 
 
 
286 aa  135  5e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2396  peptide release factor-glutamine N5-methyltransferase  38.46 
 
 
282 aa  135  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000357803  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0775  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  41.75 
 
 
276 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5477  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  39.21 
 
 
289 aa  135  7.000000000000001e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3708  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.09 
 
 
285 aa  135  7.000000000000001e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.432001  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2562  HemK family modification methylase  40.58 
 
 
298 aa  135  8e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.429951  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4060  HemK family modification methylase  43.01 
 
 
284 aa  135  8e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.867838  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2790  modification methylase, HemK family  39.62 
 
 
280 aa  135  9.999999999999999e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0393  modification methylase HemK  42.55 
 
 
283 aa  134  9.999999999999999e-31  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.27942  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2448  modification methylase, HemK family  35.12 
 
 
361 aa  134  9.999999999999999e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4832  modification methylase, HemK family  34.15 
 
 
285 aa  134  1.9999999999999998e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000233725  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1857  modification methylase, HemK family  36.73 
 
 
279 aa  133  1.9999999999999998e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.283193  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2640  HemK family modification methylase  40.16 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.718768  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2459  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  39.42 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.106531  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0724  modification methylase, HemK family protein  39.82 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41460  Modification methylase HemK  37.99 
 
 
276 aa  134  1.9999999999999998e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.703407  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1991  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  41.4 
 
 
276 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.166968  decreased coverage  0.00176531 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1061  HemK family modification methylase  37.99 
 
 
294 aa  133  3e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0895  HemK family modification methylase  40.09 
 
 
275 aa  133  3e-30  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.272533  normal  0.496142 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2336  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  36.68 
 
 
276 aa  133  3e-30  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf296  protoporphyrinogen oxidase  41.15 
 
 
235 aa  133  3e-30  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.257266  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01251  hypothetical protein  41.51 
 
 
285 aa  133  3e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2178  N5-glutamine S-adenosyl-L-methionine-dependent methyltransferase  38.94 
 
 
276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.255664  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3103  HemK family modification methylase  41.63 
 
 
284 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5313  protein-(glutamine-N5) methyltransferase, release factor-specific  40.95 
 
 
276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0272  HemK family modification methylase  39.19 
 
 
295 aa  133  3.9999999999999996e-30  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>