More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0556 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0556  uracil permease  100 
 
 		 425 aa  829    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1711  xanthine/uracil permease  63.36 
 
 		 430 aa  526  1e-148  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.10659  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0460  uracil-xanthine permease  58.25 
 
 		 423 aa  462  1e-129  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  0.000000000162343  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0376  xanthine/uracil permease  54.59 
 
 		 423 aa  459  9.999999999999999e-129  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0490  xanthine/uracil permease  59.95 
 
 		 443 aa  441  9.999999999999999e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0186546  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1876  xanthine/uracil permease  54.12 
 
 		 423 aa  429  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.355169  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2539  uracil-xanthine permease  49.64 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.467539  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3717  uracil-xanthine permease  49.17 
 
 		 430 aa  390  1e-107  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.000736051  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1913  uracil-xanthine permease  50.59 
 
 		 432 aa  389  1e-107  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3940  uracil permease  49.64 
 
 		 427 aa  389  1e-107  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000267046  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3935  uracil permease  49.16 
 
 		 427 aa  386  1e-106  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00303419  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3989  uracil permease  49.4 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000553719  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1252  uracil permease  49.4 
 
 		 427 aa  388  1e-106  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00606945  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3741  uracil permease  49.4 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000779766  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3632  uracil permease  49.4 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00702826  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3904  uracil permease  49.4 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000015728 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3649  uracil permease  49.4 
 
 		 438 aa  387  1e-106  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000513504  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4029  uracil permease  49.4 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000132234  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1283  uracil permease  46.71 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.296835  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0765  uracil permease  47.04 
 
 		 430 aa  378  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1258  uracil permease  46.71 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1043  uracil-xanthine permease  50.59 
 
 		 434 aa  376  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000103466  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0058  uracil-xanthine permease  48.07 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0070  uracil-xanthine permease  48.07 
 
 		 432 aa  354  2e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0054  uracil-xanthine permease  48.79 
 
 		 432 aa  353  2.9999999999999997e-96  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.446888  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1374  uracil-xanthine permease  44.22 
 
 		 457 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1144  uracil permease  46.05 
 
 		 441 aa  332  7.000000000000001e-90  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00015053  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0056  uracil-xanthine permease  48.9 
 
 		 434 aa  329  5.0000000000000004e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.21167 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1756  uracil transporter  44.2 
 
 		 432 aa  329  6e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.000000176806  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1486  uracil transporter  43.95 
 
 		 432 aa  328  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.013253  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1236  uracil transporter  41.94 
 
 		 428 aa  323  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000876173  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1353  uracil transporter  41.94 
 
 		 428 aa  323  4e-87  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000806442  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0910  uracil-xanthine permease  43.13 
 
 		 428 aa  320  3e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00327811 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1115  uracil-xanthine permease  44.2 
 
 		 433 aa  318  9e-86  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3522  uracil transporter  41.65 
 
 		 429 aa  318  1e-85  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00027981  normal  0.971535 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1066  uracil transporter  42.86 
 
 		 429 aa  318  2e-85  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.853606  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1317  uracil transporter  42.63 
 
 		 422 aa  317  2e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.980977  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2734  uracil transporter  41.87 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2644  uracil transporter  41.87 
 
 		 429 aa  315  9.999999999999999e-85  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00659887  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3185  uracil transporter  40.77 
 
 		 429 aa  314  1.9999999999999998e-84  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.394021  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2692  uracil transporter  42.07 
 
 		 429 aa  313  2.9999999999999996e-84  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.312639  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2371  uracil-xanthine permease  43.94 
 
 		 409 aa  313  2.9999999999999996e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000154937  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2985  uracil transporter  41.97 
 
 		 429 aa  313  3.9999999999999997e-84  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.680205  normal  0.0741995 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_09360  uracil-xanthine permease  44.5 
 
 		 433 aa  313  4.999999999999999e-84  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1131  uracil transporter  40.53 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2756  uracil transporter  41.83 
 
 		 429 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.895321  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2865  uracil transporter  41.83 
 
 		 429 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.583395  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2644  uracil transporter  40.92 
 
 		 429 aa  310  4e-83  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.232047  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2871  uracil transporter  40.92 
 
 		 429 aa  310  4e-83  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.930138  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0485  uracil-xanthine permease  39.86 
 
 		 458 aa  309  5e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000141352  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02389  uracil transporter  40.92 
 
 		 429 aa  309  5e-83  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0411834  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1172  uracil-xanthine permease  40.92 
 
 		 429 aa  309  5e-83  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0250381  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02351  hypothetical protein  40.92 
 
 		 429 aa  309  5e-83  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0648684  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2632  uracil transporter  40.92 
 
 		 429 aa  309  5e-83  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0764486  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1179  uracil transporter  40.92 
 
 		 429 aa  309  5e-83  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0295094 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2780  uracil transporter  40.92 
 
 		 429 aa  309  5e-83  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.11067  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3719  uracil transporter  40.92 
 
 		 429 aa  309  5e-83  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.237871  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2990  uracil transporter  40.32 
 
 		 429 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1126  uracil permease  44.11 
 
 		 395 aa  307  3e-82  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.930887 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0419  permease subfamily protein  40.45 
 
 		 411 aa  296  4e-79  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1629  uracil-xanthine permease  41.94 
 
 		 427 aa  296  4e-79  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.0348661 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1091  uracil-xanthine permease  41.61 
 
 		 415 aa  295  7e-79  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.977585  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1416  uracil-xanthine permease  40.91 
 
 		 391 aa  295  8e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00824377  normal  0.439597 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0932  uracil permease  42.44 
 
 		 416 aa  294  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.87035  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1749  uracil-xanthine permease  40.89 
 
 		 409 aa  292  7e-78  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000246667  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2388  uracil permease  41.63 
 
 		 416 aa  290  4e-77  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0262  uracil transporter  40.59 
 
 		 421 aa  289  6e-77  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000145951  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1077  uracil-xanthine permease  41.28 
 
 		 425 aa  289  6e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4444  uracil-xanthine permease  41.26 
 
 		 421 aa  289  7e-77  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.586178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0212  uracil permease  40.15 
 
 		 417 aa  289  7e-77  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0745  uracil-xanthine permease  41.63 
 
 		 421 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237956  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0786  uracil-xanthine permease  41.75 
 
 		 424 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0773  uracil-xanthine permease  41.63 
 
 		 421 aa  288  1e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0066  uracil-xanthine permease  41.9 
 
 		 403 aa  288  2e-76  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00626483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3856  uracil-xanthine permease  41.88 
 
 		 414 aa  286  4e-76  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000401696  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1129  uracil transporter  41.22 
 
 		 406 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0766553  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002783  uracil permease  40.25 
 
 		 417 aa  285  1.0000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1449  uracil-xanthine permease  40.93 
 
 		 414 aa  285  1.0000000000000001e-75  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0968  xanthine/uracil permease family protein  41.75 
 
 		 425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1749  uracil permease  40.3 
 
 		 417 aa  284  2.0000000000000002e-75  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.425461  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03198  hypothetical protein  39.85 
 
 		 417 aa  283  4.0000000000000003e-75  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04600  uracil-xanthine permease  38.34 
 
 		 467 aa  282  6.000000000000001e-75  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.0641313  hitchhiker  0.000000425239 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5296  uracil permease  40.53 
 
 		 427 aa  282  8.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.891662  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0481  uracil-xanthine permease  40.55 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000026216 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1089  uracil-xanthine permease  42.38 
 
 		 430 aa  281  1e-74  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000000355646  hitchhiker  0.00900914 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61480  uracil permease  40.53 
 
 		 427 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.202144 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0606  uracil-xanthine permease  38.77 
 
 		 403 aa  281  1e-74  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000016937  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0464  uracil-xanthine permease  40.8 
 
 		 425 aa  281  1e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.774472  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0996  uracil-xanthine permease  40.59 
 
 		 411 aa  281  2e-74  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.594707  hitchhiker  0.00519474 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0593  uracil permease (Uracil transporter)  38.1 
 
 		 412 aa  279  7e-74  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0341896  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2088  uracil-xanthine permease  40 
 
 		 412 aa  278  9e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4729  xanthine/uracil permease  41.58 
 
 		 424 aa  277  3e-73  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.667812  normal  0.810589 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2251  uracil transporter  37.14 
 
 		 420 aa  276  4e-73  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.447196  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0981  uracil-xanthine permease  38.7 
 
 		 423 aa  276  5e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06450  uracil-xanthine permease  37.44 
 
 		 469 aa  276  7e-73  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.285171  normal  0.461399 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4298  uracil-xanthine permease  39.21 
 
 		 411 aa  275  1.0000000000000001e-72  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0402809 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2188  uracil-xanthine permease  41.54 
 
 		 387 aa  274  2.0000000000000002e-72  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1967  uracil-xanthine permease  37.9 
 
 		 419 aa  275  2.0000000000000002e-72  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.522211  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4318  uracil permease  40.74 
 
 		 441 aa  273  4.0000000000000004e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0429  uracil-xanthine permease  39.91 
 
 		 447 aa  271  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000136785  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>