More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0531 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0531  ammonia permease  100 
 
 		 411 aa  820    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000144186  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1699  ammonia permease  64.41 
 
 		 413 aa  518  1e-146  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000279978  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2862  ammonium transporter  51.12 
 
 		 457 aa  392  1e-108  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.33659  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1061  ammonium transporter  49.64 
 
 		 461 aa  375  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.379928  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0192  ammonium transporter  49.14 
 
 		 467 aa  372  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2526  ammonium transporter  49.17 
 
 		 424 aa  368  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1059  ammonium transporter  48.16 
 
 		 410 aa  360  2e-98  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000580155  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1889  ammonium transporter  49.01 
 
 		 434 aa  359  5e-98  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.39856  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1313  ammonium transporter  47.91 
 
 		 410 aa  355  1e-96  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000021179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1269  ammonium transporter  47.78 
 
 		 411 aa  353  2.9999999999999997e-96  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.0000000200287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4131  ammonium transporter  47.42 
 
 		 410 aa  351  1e-95  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000588768  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1210  ammonium transporter  47.42 
 
 		 410 aa  351  1e-95  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000809734  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1056  ammonium transporter  47.42 
 
 		 410 aa  350  2e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.000000003226  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0776  ammonia permease  48.01 
 
 		 398 aa  351  2e-95  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.358895  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1078  ammonium transporter  47.42 
 
 		 410 aa  350  3e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000106824  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1059  ammonium transporter  47.42 
 
 		 410 aa  350  4e-95  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  6.498340000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1019  ammonium transporter  48.16 
 
 		 451 aa  348  8e-95  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.197623  normal  0.642415 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1237  ammonium transporter  47.17 
 
 		 410 aa  348  1e-94  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2054  ammonium transporter  47.98 
 
 		 431 aa  344  2e-93  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0727  ammonium transporter  47.04 
 
 		 449 aa  342  7e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.379173  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1679  ammonia permease  45.81 
 
 		 448 aa  341  1e-92  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3048  ammonium transporter  46.31 
 
 		 405 aa  340  2e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0565  ammonium transporter  47.06 
 
 		 428 aa  338  9.999999999999999e-92  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000907445  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0032  ammonium transporter  47.8 
 
 		 462 aa  336  3.9999999999999995e-91  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0046  ammonium transporter  44.74 
 
 		 429 aa  335  9e-91  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000652471  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2529  ammonium transporter  46.4 
 
 		 454 aa  333  3e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.537146  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0157  ammonium transporter  42.12 
 
 		 405 aa  330  2e-89  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0294  ammonium transporter  43.03 
 
 		 436 aa  330  3e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.509038 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0114  ammonium transporter  44.33 
 
 		 453 aa  329  5.0000000000000004e-89  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00188634  normal  0.233192 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0741  ammonium transporter  46.65 
 
 		 397 aa  327  3e-88  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0796039  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6204  ammonium transporter  46.17 
 
 		 427 aa  326  4.0000000000000003e-88  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.442016  normal  0.0532211 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0598  ammonium transporter  42.93 
 
 		 463 aa  326  5e-88  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00419594 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1493  ammonium transporter  44.94 
 
 		 438 aa  325  6e-88  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0776  ammonium transporter  43.52 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000446987  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2504  ammonium transporter  43.92 
 
 		 397 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.465742 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0142  ammonium transporter  44.58 
 
 		 464 aa  320  3e-86  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000211671  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0936  ammonium transporter  40.49 
 
 		 433 aa  320  3.9999999999999996e-86  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000377465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2068  ammonium transporter  43 
 
 		 406 aa  319  6e-86  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000438744  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1129  ammonium transporter  43.78 
 
 		 431 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2468  ammonium transporter  46.19 
 
 		 470 aa  318  1e-85  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.47689  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1006  ammonium transporter  45.81 
 
 		 453 aa  318  1e-85  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.732511  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0422  ammonium transporter  45.19 
 
 		 429 aa  317  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2267  ammonium transporter  44.94 
 
 		 405 aa  317  2e-85  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.828522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1490  ammonium transporter  44.6 
 
 		 472 aa  316  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_943  ammonium transporter  46.31 
 
 		 408 aa  316  4e-85  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1831  ammonium transporter  47.29 
 
 		 402 aa  315  7e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1125  ammonium transporter  46.31 
 
 		 408 aa  314  1.9999999999999998e-84  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0335009  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1956  ammonium transporter  41.47 
 
 		 494 aa  313  3.9999999999999997e-84  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0954  ammonium transporter  46.68 
 
 		 408 aa  312  4.999999999999999e-84  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1305  ammonium transporter  42.86 
 
 		 444 aa  312  6.999999999999999e-84  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179882 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0695  ammonium transporter  42.59 
 
 		 488 aa  312  7.999999999999999e-84  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.7335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0377  ammonium transporter  44.28 
 
 		 433 aa  311  1e-83  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.182782  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4237  ammonium transporter  41.4 
 
 		 452 aa  311  1e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3769  ammonium transporter  42.76 
 
 		 477 aa  311  2e-83  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.63779 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1686  ammonium transporter  43.56 
 
 		 402 aa  311  2e-83  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.531823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1303  ammonium transporter  43.41 
 
 		 459 aa  310  2e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2356  ammonium transporter  43.32 
 
 		 435 aa  310  2.9999999999999997e-83  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0849  ammonium transporter  43.36 
 
 		 474 aa  310  2.9999999999999997e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3941  ammonium transporter  40.23 
 
 		 504 aa  308  1.0000000000000001e-82  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0541  ammonium transporter  46.02 
 
 		 462 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2311  ammonium transporter  48.89 
 
 		 401 aa  308  1.0000000000000001e-82  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.191525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0014  ammonium transporter  46.45 
 
 		 455 aa  308  1.0000000000000001e-82  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.138738 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3995  ammonium transporter  43.14 
 
 		 445 aa  307  2.0000000000000002e-82  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.121366  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31514  Amt family transporter: ammonium  43.49 
 
 		 418 aa  307  2.0000000000000002e-82  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0158  ammonium transporter  46.9 
 
 		 397 aa  307  2.0000000000000002e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0084  ammonium transporter  41.58 
 
 		 402 aa  306  3e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0940  ammonium transporter  41.45 
 
 		 489 aa  306  5.0000000000000004e-82  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0989  hypothetical protein  43.25 
 
 		 398 aa  306  6e-82  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.754506 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0434  ammonium transporter  40.84 
 
 		 434 aa  305  7e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0771346  normal  0.5124 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1147  ammonium transporter  45.3 
 
 		 401 aa  303  3.0000000000000004e-81  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1608  ammonium transporter  42.24 
 
 		 442 aa  303  3.0000000000000004e-81  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.263179  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2911  ammonium transporter  43.35 
 
 		 438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4093  ammonium transporter  41.82 
 
 		 476 aa  303  3.0000000000000004e-81  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2526  ammonium transporter  43.35 
 
 		 438 aa  303  3.0000000000000004e-81  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0659  ammonium transporter  43.88 
 
 		 439 aa  302  6.000000000000001e-81  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2708  ammonium transporter  41.55 
 
 		 515 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000035421 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3365  ammonium transporter  41.31 
 
 		 485 aa  302  7.000000000000001e-81  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2956  ammonium transporter  46.84 
 
 		 470 aa  301  1e-80  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.328394  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0292  ammonium transporter  40.65 
 
 		 513 aa  301  2e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0276  ammonium transporter  40.3 
 
 		 443 aa  301  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1508  ammonium transporter  41.55 
 
 		 515 aa  301  2e-80  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0221  ammonium transporter  43.75 
 
 		 446 aa  300  3e-80  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2786  ammonium transporter  41.9 
 
 		 398 aa  300  4e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.879755  normal  0.191146 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0487  ammonium transporter  42.33 
 
 		 507 aa  299  7e-80  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0054  ammonium transporter  40.84 
 
 		 499 aa  298  8e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0265828  normal  0.286755 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0749  ammonium transporter  41.87 
 
 		 405 aa  298  8e-80  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.0000261873  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0408  ammonium transporter  41.85 
 
 		 469 aa  298  1e-79  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.737141  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1270  ammonium transporter  47.28 
 
 		 461 aa  298  1e-79  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0471  ammonium transporter  41.76 
 
 		 496 aa  298  1e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.122427  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0192  ammonium transporter  41.85 
 
 		 466 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0469  ammonium transporter  41.85 
 
 		 500 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.929058  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3217  ammonium transporter  41.61 
 
 		 444 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0653  ammonium transporter  41.61 
 
 		 478 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1401  ammonium transporter  41.85 
 
 		 466 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2828  ammonium transporter  41.85 
 
 		 466 aa  298  2e-79  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0488  ammonium transporter  41.85 
 
 		 500 aa  298  2e-79  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.256418  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1498  ammonium transporter family protein  42.51 
 
 		 416 aa  297  3e-79  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.943229  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2514  ammonium transporter  40.1 
 
 		 461 aa  297  3e-79  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0323636  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1566  ammonium transporter  44.36 
 
 		 432 aa  296  3e-79  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.436096  normal  0.0257715 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2178  ammonium transporter  41.8 
 
 		 450 aa  297  3e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0850706  normal  0.724176 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>