256 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0517 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0517  F0F1 ATP synthase subunit B  100 
 
 
165 aa  323  9e-88  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0641052  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0859  F0F1 ATP synthase subunit B  69.09 
 
 
165 aa  218  1.9999999999999999e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0732161  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1937  F0F1 ATP synthase subunit B  48.73 
 
 
168 aa  145  3e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.385177  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0463  ATP synthase F0, B subunit  37.58 
 
 
172 aa  114  7.999999999999999e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.018727  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4795  ATP synthase F0, B subunit  34.87 
 
 
164 aa  108  4.0000000000000004e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0163867  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3829  F0F1 ATP synthase subunit B  36.81 
 
 
168 aa  102  3e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.242608  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5431  F0F1 ATP synthase subunit B  37.42 
 
 
168 aa  101  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0030165  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5107  F0F1 ATP synthase subunit B  36.81 
 
 
168 aa  101  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.164846  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1873  F0F1-type ATP synthase, subunit b  36.36 
 
 
167 aa  101  5e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  38.26 
 
 
178 aa  100  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5434  F0F1 ATP synthase subunit B  36.2 
 
 
168 aa  100  1e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5159  F0F1 ATP synthase subunit B  36.81 
 
 
168 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4992  F0F1 ATP synthase subunit B  36.81 
 
 
168 aa  100  1e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.416511  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5009  F0F1 ATP synthase subunit B  36.81 
 
 
168 aa  100  1e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5551  F0F1 ATP synthase subunit B  36.81 
 
 
168 aa  100  1e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0100473  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5487  F0F1 ATP synthase subunit B  36.2 
 
 
168 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0115712  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5400  F0F1 ATP synthase subunit B  36.81 
 
 
168 aa  100  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.95382e-52 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1242  F0F1 ATP synthase subunit B  36.13 
 
 
166 aa  99  3e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5520  F0F1 ATP synthase subunit B  35.58 
 
 
168 aa  98.6  4e-20  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000205849  hitchhiker  2.15653e-17 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3307  F0F1 ATP synthase subunit B  36.96 
 
 
179 aa  96.7  1e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000544388  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2500  F0F1 ATP synthase subunit B  35.53 
 
 
175 aa  89.7  1e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2245  F0F1 ATP synthase subunit B  36.18 
 
 
175 aa  87.8  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.26161  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  31.25 
 
 
162 aa  87.4  8e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1713  F0F1 ATP synthase subunit B  31.17 
 
 
171 aa  86.3  2e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  34.03 
 
 
166 aa  86.3  2e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  31.17 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  31.17 
 
 
173 aa  85.1  4e-16  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2883  F0F1 ATP synthase subunit B  35.9 
 
 
175 aa  84.3  6e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000126633  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2096  F0F1 ATP synthase subunit B  33.33 
 
 
175 aa  83.2  0.000000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2761  ATP synthase F0, B subunit  30.97 
 
 
167 aa  82.4  0.000000000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0066  F0F1 ATP synthase subunit B  32.69 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.391852  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03050  ATP synthase F0, subunit B  37.21 
 
 
164 aa  82  0.000000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2489  F0F1 ATP synthase subunit B  33.97 
 
 
175 aa  82.4  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000305387  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4140  ATP synthase F0, B subunit  30.77 
 
 
195 aa  82  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2707  F0F1 ATP synthase subunit B  36.54 
 
 
175 aa  80.9  0.000000000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4622  ATP synthase F0, B subunit  33.55 
 
 
194 aa  79.3  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21440  ATP synthase, F0 subunit b  33.12 
 
 
203 aa  78.6  0.00000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4493  ATP synthase F0, B subunit  33.99 
 
 
179 aa  78.6  0.00000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4338  ATP synthase F0, B subunit  32.68 
 
 
179 aa  76.6  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.209021  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0661  F0F1-type ATP synthase, subunit b  30.92 
 
 
176 aa  76.3  0.0000000000002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.300947  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1041  ATP synthase F0, B subunit  29.22 
 
 
206 aa  74.7  0.0000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.0637468 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4474  ATP synthase F0, B subunit  32.89 
 
 
179 aa  74.3  0.0000000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  30.67 
 
 
165 aa  73.6  0.000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2604  ATP synthase F0, B subunit  28.48 
 
 
181 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.811029  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  32.12 
 
 
156 aa  72  0.000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  30.26 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  32.24 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  32.91 
 
 
156 aa  71.6  0.000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  32.24 
 
 
156 aa  71.2  0.000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  31.13 
 
 
164 aa  71.2  0.000000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  31.58 
 
 
156 aa  70.9  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2331  F0F1 ATP synthase subunit B  30.19 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000933375  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6360  F0F1 ATP synthase subunit B  30.32 
 
 
156 aa  69.3  0.00000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2028  F0F1 ATP synthase subunit B  30.19 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000104833  normal  0.0240886 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2169  F0F1 ATP synthase subunit B  30.57 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000388738  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  30.32 
 
 
156 aa  68.9  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2141  ATP synthase F0, B subunit  32.03 
 
 
163 aa  68.2  0.00000000005  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3970  F0F1 ATP synthase subunit B  29.75 
 
 
156 aa  67.8  0.00000000007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00376909  normal  0.28656 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12090  ATP synthase, F0 subunit b  30.13 
 
 
199 aa  67.4  0.00000000009  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  30.92 
 
 
156 aa  67.4  0.00000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  29.49 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  28.29 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5734  F0F1 ATP synthase subunit B  30.13 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0047382  normal  0.395212 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0394  ATP synthase F0, B subunit  32.68 
 
 
165 aa  65.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.501074 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  65.9  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1642  ATP synthase F0, B subunit  31.21 
 
 
174 aa  65.5  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1312  ATP synthase F0 subunit B  30.28 
 
 
181 aa  65.9  0.0000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.541533  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2382  ATP synthase F0, B subunit  30.77 
 
 
168 aa  64.7  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.0499925 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  31.48 
 
 
156 aa  65.1  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  27.63 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  29.61 
 
 
156 aa  64.7  0.0000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5204  F0F1 ATP synthase subunit B  28.85 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.228088  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  27.63 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5435  F0F1 ATP synthase subunit B  28.85 
 
 
156 aa  64.3  0.0000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3309  F0F1 ATP synthase subunit B  29.63 
 
 
156 aa  63.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.384998  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  27.81 
 
 
156 aa  63.2  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  32.32 
 
 
164 aa  63.9  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  63.5  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1975  ATP synthase F0, B subunit  29.41 
 
 
166 aa  63.5  0.000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0171213  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0058  ATP synthase F0, B subunit  30.25 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5603  ATP synthase F0, B subunit  28.85 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  29.03 
 
 
156 aa  63.2  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52200  F0 sector of membrane-bound ATP synthase, subunit B  30.56 
 
 
152 aa  63.2  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5299  F0F1 ATP synthase subunit B  28.21 
 
 
156 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.329705  normal  0.143004 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  27.63 
 
 
156 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5417  F0F1 ATP synthase subunit B  28.21 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.496413  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0018  ATP synthase F0, B subunit  30.92 
 
 
156 aa  62.4  0.000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000000004073  hitchhiker  0.000421111 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  28.4 
 
 
156 aa  62  0.000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2122  ATP synthase F0, B subunit  26.8 
 
 
181 aa  62  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00221721  hitchhiker  0.00491611 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>