45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0515 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0515  F0F1 ATP synthase subunit C  100 
 
 
65 aa  125  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.0000303287  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0857  F0F1 ATP synthase subunit C  87.69 
 
 
66 aa  113  6.9999999999999995e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00162341  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_19180  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  52.94 
 
 
75 aa  55.5  0.0000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1128  F0F1-type ATP synthase subunit C  47.06 
 
 
75 aa  53.5  0.0000009  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1939  F0F1 ATP synthase subunit C  47.83 
 
 
71 aa  53.1  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000147682  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1067  ATP synthase F0, C subunit  47.06 
 
 
81 aa  52  0.000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1779  ATP synthase F0, C subunit  45.1 
 
 
77 aa  51.2  0.000004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09980  ATP synthase F0 subcomplex C subunit  47.06 
 
 
78 aa  51.6  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.697576  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1302  ATP synthase F0, C subunit  49.02 
 
 
74 aa  50.8  0.000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.331137  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5488  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00106382  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5432  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00220616  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5519  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000362288  hitchhiker  1.48616e-17 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5401  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.20479e-54 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5108  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0242215  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3830  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000199099  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2453  ATP synthase F0, C subunit  47.06 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5552  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00178771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5010  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.222646  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4993  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00191297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5160  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.254588  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5435  F0F1 ATP synthase subunit C  38.33 
 
 
72 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0143  putative F0F1 ATP synthase subunit C  43.14 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0660  F0F1-type ATP synthase, subunit c  34.33 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.307082  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2673  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 
92 aa  44.3  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6141  ATP synthase F0, C subunit  43.14 
 
 
73 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0393  ATP synthase F0, C subunit  43.55 
 
 
70 aa  43.9  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.444139 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2490  ATP synthase F0, C subunit  45.83 
 
 
73 aa  43.5  0.0009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000000013986  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf042  ATP synthase C chain  34.85 
 
 
90 aa  43.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0331  ATP synthase F0, C subunit  38.71 
 
 
76 aa  42.4  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.245673 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2246  ATP synthase F0, C subunit  43.75 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.548731  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2412  ATP synthase F0, C subunit  38.71 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0322  F0F1 ATP synthase subunit C  42 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.199474  normal  0.594453 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4170  ATP synthase F0, C subunit  42.86 
 
 
79 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0991234  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0192  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 
82 aa  42  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.869605 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4623  ATP synthase F0, C subunit  37.04 
 
 
92 aa  42  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3155  ATP synthase F0, C subunit  34.43 
 
 
77 aa  42  0.003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2144  F0F1 ATP synthase subunit C  38.89 
 
 
70 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.277737  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2182  F0F1 ATP synthase subunit C  38.89 
 
 
70 aa  42  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.383564  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1714  F0F1 ATP synthase subunit C  38.89 
 
 
70 aa  42  0.003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2884  ATP synthase F0, C subunit  43.75 
 
 
73 aa  41.6  0.004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000318758  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0475  F0F1 ATP synthase subunit C  38 
 
 
89 aa  40.8  0.006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0683379  normal  0.590226 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4875  ATP synthase F0, C subunit  40 
 
 
87 aa  40.8  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0210  F0F1 ATP synthase subunit C  40 
 
 
81 aa  40.8  0.006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2708  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 
75 aa  40  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00577662  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0065  ATP synthase F0, C subunit  44.44 
 
 
75 aa  40  0.01  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.475844  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>