257 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0465 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0465  MutT/nudix family protein  100 
 
 
250 aa  526  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000231456  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1043  NUDIX hydrolase  37.5 
 
 
229 aa  130  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.541609  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2566  NUDIX hydrolase  31.67 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000361944 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3138  NUDIX hydrolase  33.85 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0695  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
248 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0145  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
252 aa  122  5e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.658574  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0387  NUDIX hydrolase  32.9 
 
 
252 aa  121  9e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.231232 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4290  NUDIX hydrolase  31.78 
 
 
240 aa  120  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00680151  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2843  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
267 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7559  NUDIX hydrolase  34.19 
 
 
237 aa  117  1.9999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2119  NUDIX hydrolase  34 
 
 
229 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.461945 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3126  NUDIX hydrolase  29.12 
 
 
303 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.573169  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4133  NUDIX hydrolase  34.24 
 
 
226 aa  114  2.0000000000000002e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.877658  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3138  NUDIX hydrolase  33.78 
 
 
273 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0461727  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6368  NUDIX hydrolase  34 
 
 
229 aa  110  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1347  NUDIX hydrolase  31.4 
 
 
269 aa  108  6e-23  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000244652 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4031  NUDIX hydrolase  32.16 
 
 
286 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4337  NUDIX hydrolase  30.89 
 
 
259 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.953941  normal  0.291795 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01970  ADP-ribose pyrophosphatase  31.28 
 
 
232 aa  106  4e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6653  NUDIX hydrolase  29.39 
 
 
320 aa  105  8e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0154  NUDIX hydrolase  29.28 
 
 
238 aa  104  1e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5757  NUDIX hydrolase  32.8 
 
 
244 aa  104  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000165623  hitchhiker  0.000000000000529868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3969  NUDIX hydrolase  32.68 
 
 
255 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.00994363  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0306  NUDIX hydrolase  36.07 
 
 
229 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0602  NUDIX hydrolase  31.16 
 
 
228 aa  102  5e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.430612 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7395  NUDIX hydrolase  29.27 
 
 
260 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.23438  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0745  NUDIX hydrolase  31.9 
 
 
219 aa  100  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2862  NUDIX hydrolase  36.25 
 
 
186 aa  100  3e-20  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.200319  hitchhiker  0.00911064 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6281  NUDIX hydrolase  32.78 
 
 
244 aa  99.8  4e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  unclonable  0.000000760196  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5657  NUDIX hydrolase  31.5 
 
 
248 aa  99  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0861  NUDIX hydrolase  31.28 
 
 
231 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.314952  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0305  NUDIX hydrolase  32.55 
 
 
239 aa  97.1  3e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0910  ADP-ribose pyrophosphatase  30.49 
 
 
245 aa  96.3  4e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0799533  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0165  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
219 aa  94.7  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.27477  normal  0.587947 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5745  NUDIX hydrolase  30.95 
 
 
231 aa  94.7  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5160  NUDIX hydrolase  28.92 
 
 
243 aa  94  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5113  hypothetical protein  32.96 
 
 
252 aa  94.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.424596 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2421  NUDIX hydrolase  30.1 
 
 
233 aa  94.4  2e-18  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2328  NUDIX hydrolase  30.63 
 
 
237 aa  94  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0836  NUDIX hydrolase  30.97 
 
 
263 aa  93.6  3e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.550059  normal  0.10397 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0379  NUDIX hydrolase  29.67 
 
 
221 aa  93.6  3e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.467604  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1979  MutT/nudix family protein  30.49 
 
 
237 aa  93.2  4e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4449  NUDIX hydrolase  28.84 
 
 
255 aa  93.2  4e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.413572 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2060  NUDIX hydrolase  31.02 
 
 
242 aa  91.3  1e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217301 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25540  ADP-ribose pyrophosphatase  41.44 
 
 
224 aa  91.3  1e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.237744  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1510  NUDIX hydrolase  30.73 
 
 
225 aa  90.9  2e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  hitchhiker  0.00116155  normal  0.680564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8962  hydrolase, NUDIX family  33.15 
 
 
244 aa  89.7  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0345  NUDIX hydrolase  28.06 
 
 
252 aa  90.1  3e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0244735  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0756  NUDIX hydrolase  31.53 
 
 
230 aa  90.1  3e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.229185  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3218  NUDIX hydrolase  27.43 
 
 
251 aa  89.4  5e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0416  NUDIX hydrolase  29.07 
 
 
248 aa  88.6  8e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.255791  normal  0.0628486 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0022  NUDIX hydrolase  38.67 
 
 
267 aa  88.6  9e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0640861  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0189  NUDIX hydrolase  30.77 
 
 
223 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0269  NUDIX hydrolase  29.33 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2238  NUDIX hydrolase  28.88 
 
 
251 aa  88.2  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0269  NUDIX hydrolase  28.85 
 
 
233 aa  87  3e-16  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4370  NUDIX hydrolase  30.52 
 
 
246 aa  87  3e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3721  NUDIX hydrolase  29.67 
 
 
230 aa  85.5  7e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00000111164  decreased coverage  0.00513627 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0291  NUDIX hydrolase  29.95 
 
 
244 aa  84.7  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.78148 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0783  NUDIX hydrolase  28.57 
 
 
238 aa  84.7  0.000000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4824  NUDIX hydrolase  29.15 
 
 
662 aa  84  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0491634 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0073  NUDIX hydrolase  26.63 
 
 
225 aa  84  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1061  NUDIX hydrolase  34.01 
 
 
179 aa  83.2  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1099  NUDIX hydrolase  28.37 
 
 
249 aa  82.4  0.000000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3993  NUDIX hydrolase  29.77 
 
 
234 aa  82.4  0.000000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0629305  normal  0.556995 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3715  NUDIX hydrolase  25.85 
 
 
222 aa  79.7  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.619074  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03600  probable 8-oxo-dGTPase, MutT-like protein, NUDIX hydrolase family protein  32.67 
 
 
137 aa  77.8  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6951  NUDIX hydrolase  25.35 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.720155  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0877  MutT-like protein  36.11 
 
 
144 aa  77.4  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3292  NUDIX hydrolase  26.53 
 
 
229 aa  77.8  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.238683 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1240  NUDIX hydrolase  30.7 
 
 
233 aa  77.4  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.538948  normal  0.136467 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2728  NUDIX hydrolase  27.4 
 
 
236 aa  77.4  0.0000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.147262  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2399  NUDIX hydrolase  27.73 
 
 
234 aa  76.6  0.0000000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0784  NUDIX hydrolase  27.5 
 
 
245 aa  74.7  0.000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.793093  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2506  acetohydroxy acid isomeroreductase  26.36 
 
 
245 aa  74.3  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0206114  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10820  ADP-ribose pyrophosphatase  29.01 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.508627  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4021  NUDIX hydrolase  25 
 
 
242 aa  72  0.000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.952942 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  33.33 
 
 
236 aa  71.2  0.00000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5114  NUDIX hydrolase  26.25 
 
 
237 aa  71.2  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.32433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0350  NUDIX hydrolase  25.69 
 
 
233 aa  68.9  0.00000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2884  NUDIX hydrolase  26.81 
 
 
258 aa  68.6  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.94634  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2777  NUDIX hydrolase  26.34 
 
 
251 aa  68.2  0.0000000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.102505 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0385  NUDIX hydrolase  28.07 
 
 
238 aa  67.8  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2298  NUDIX hydrolase  25 
 
 
236 aa  66.6  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000778987 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1206  NUDIX hydrolase  35.37 
 
 
154 aa  66.2  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.483034 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2204  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.58 
 
 
349 aa  65.5  0.0000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.5504  decreased coverage  0.00753224 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5152  NUDIX hydrolase  35.07 
 
 
144 aa  65.5  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000000414992 
 
 
-
 
NC_003296  RS05360  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  31.03 
 
 
345 aa  64.7  0.000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.623868  normal  0.0249588 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0214  NUDIX hydrolase  34.23 
 
 
137 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.73961  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1823  NUDIX hydrolase  32.64 
 
 
143 aa  65.1  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.24885  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06576  hypothetical protein  28.28 
 
 
241 aa  64.7  0.000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2195  NUDIX hydrolase  32.9 
 
 
139 aa  64.7  0.000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0407249  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0320  NUDIX hydrolase  26.13 
 
 
202 aa  64.7  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2561  NUDIX hydrolase  25.96 
 
 
236 aa  65.1  0.000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.233284  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1913  bifunctional nicotinamide mononucleotide adenylyltransferase/ADP-ribose pyrophosphatase  30.92 
 
 
355 aa  63.9  0.000000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.680637  decreased coverage  0.0000316043 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0576  hypothetical protein  25.78 
 
 
243 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1413  NUDIX hydrolase  28.24 
 
 
229 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.191917  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1570  NUDIX hydrolase  24.32 
 
 
251 aa  64.3  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.905122  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3464  NUDIX hydrolase  35.65 
 
 
148 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815689  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1117  NUDIX hydrolase  26.37 
 
 
229 aa  63.5  0.000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>