More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0428 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0428  MarR family transcriptional regulator  100 
 
 		 144 aa  290  4e-78  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00534212  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0343  MarR family transcriptional regulator  69.23 
 
 		 144 aa  205  2e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0287479  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0992  MarR family transcriptional regulator  48.23 
 
 		 148 aa  142  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0028906  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1594  MarR family transcriptional regulator  40.15 
 
 		 156 aa  129  9e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000549688  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0308  MarR family transcriptional regulator  42.96 
 
 		 152 aa  129  1.0000000000000001e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.120552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1135  MarR family transcriptional regulator  47.29 
 
 		 154 aa  120  5e-27  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.46809  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1323  MarR family transcriptional regulator  50.46 
 
 		 154 aa  114  3e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0843  transcriptional regulator, MarR family  38.57 
 
 		 157 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.917467  normal  0.0772614 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11170  transcriptional regulator  41.09 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1991  transcriptional regulator, MarR family  38.41 
 
 		 156 aa  98.6  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.505264  normal  0.471645 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2555  MarR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000242477  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0820  MarR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.275641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04050  transcriptional regulator, MarR family  34.58 
 
 		 141 aa  74.3  0.0000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1206  transcriptional regulator, MarR family  31.06 
 
 		 220 aa  71.2  0.000000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2042  transcriptional regulator, MarR family  35.34 
 
 		 220 aa  70.5  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.612375  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2533  MarR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 139 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.491693  normal  0.727231 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1451  MarR family transcriptional regulator  32.41 
 
 		 161 aa  67.4  0.00000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2327  MarR family transcriptional regulator  26.23 
 
 		 139 aa  65.5  0.0000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2042  MarR family transcriptional regulator  26.36 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0690708 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2076  MarR family transcriptional regulator  28.69 
 
 		 139 aa  63.9  0.0000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0841252 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1959  transcriptional regulator, MarR family  32.58 
 
 		 156 aa  63.5  0.0000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06409  hypothetical protein  25.93 
 
 		 138 aa  62  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2518  transcriptional regulator, MarR family protein  25.95 
 
 		 135 aa  62.4  0.000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.319242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2977  MarR family transcriptional regulator  24.22 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.704241  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1543  MarR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 171 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2676  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0699601  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3504  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0234  MarR family protein  36.25 
 
 		 177 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1876  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0022  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0022  MarR family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 165 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.278494  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2373  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000204338  normal  0.22854 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2101  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 168 aa  58.2  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3332  transcriptional regulator, MarR family  27.27 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.610644  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3004  repressor of mar (multiple antibiotic resistance) operon  32.08 
 
 		 139 aa  57.8  0.00000005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2256  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000254584  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2089  transcriptional regulator, MarR family  25 
 
 		 159 aa  57.8  0.00000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000354665  normal  0.0829013 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2046  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 153 aa  57.4  0.00000006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2099  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 149 aa  57.8  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00262035  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0452  transcriptional regulator, MarR family  28.89 
 
 		 139 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.110741 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5895  putative transcriptional regulator  31.31 
 
 		 156 aa  57  0.00000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2230  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00353505  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1295  putative transcription regulator protein  31.37 
 
 		 147 aa  56.2  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.260048  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2771  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 163 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2105  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.81628  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1869  MarR family transcriptional regulator  25 
 
 		 153 aa  56.6  0.0000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0125341  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0997  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1769  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238439  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1746  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0867491  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0136  MarR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 151 aa  55.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.500624  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1501  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.340787  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1055  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.283145  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0169  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00968003  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0111  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 142 aa  55.8  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.238503  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1922  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.236753  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1076  MarR family transcriptional regulator  28.87 
 
 		 168 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.359856  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0082  MarR family transcriptional regulator  28.7 
 
 		 174 aa  55.1  0.0000003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0515  MarR family transcriptional regulator  26.32 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0136032 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3749  multiple antibiotic resistance protein MarR, putative  30.39 
 
 		 162 aa  55.1  0.0000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.17828  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003644  transcriptional regulator  55.1 
 
 		 160 aa  54.7  0.0000004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.989469  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1749  MarR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 164 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0321002 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1437  transcriptional regulator, MarR family  22.63 
 
 		 138 aa  54.7  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1150  MarR family transcriptional regulator  29.46 
 
 		 153 aa  55.1  0.0000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.838815  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1729  regulatory protein, MarR  34.78 
 
 		 162 aa  54.3  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0295  MarR family transcriptional regulator  28.07 
 
 		 145 aa  54.7  0.0000005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.117133  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2438  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 		 159 aa  54.7  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0021  MarR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 181 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.487256  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2558  MarR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 165 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0048  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.407046  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4487  MarR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 180 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000975501  hitchhiker  0.000429514 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0022  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0694337  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0110  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 		 142 aa  53.9  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0067  MarR family transcriptional regulator  28.04 
 
 		 162 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1943  transcriptional regulator, MarR family protein  52.17 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0012648  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1756  MarR family transcriptional regulator  24.6 
 
 		 142 aa  53.5  0.0000009  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00763992 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68110  putative transcriptional regulator  29.29 
 
 		 156 aa  53.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000624146  normal  0.0136344 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2045  MarR family transcriptional regulator  35 
 
 		 190 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3950  transcriptional regulator, MarR family  27.83 
 
 		 180 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.703331 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1584  MarR family transcriptional regulator  28.16 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000327576  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0264  MarR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 171 aa  53.1  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000861696 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6203  regulatory protein, MarR  35.42 
 
 		 150 aa  52.8  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.187647  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1623  MarR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 136 aa  53.1  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2461  transcriptional regulator, MarR family  23.85 
 
 		 157 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  6.6439e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1832  MarR family transcriptional regulator  24.76 
 
 		 141 aa  53.1  0.000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1502  MarR family transcriptional regulator  28.71 
 
 		 157 aa  52.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0389  MarR family transcriptional regulator  27.12 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.502293  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0508  transcriptional regulator, MarR family  28.85 
 
 		 155 aa  52.4  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.314336  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4023  MarR family transcriptional regulator  48.15 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.709779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0049  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 162 aa  52.8  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0324  MarR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 164 aa  52.4  0.000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.191341 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1245  MarR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 158 aa  52.4  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0310  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 		 135 aa  52.4  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0118  transcriptional regulator, MarR family  25.62 
 
 		 164 aa  52.8  0.000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.466512  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0259  transcriptional regulator, MarR family  35.23 
 
 		 171 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.623858  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1294  MarR family transcriptional regulator  31.31 
 
 		 151 aa  51.6  0.000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.110043  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2859  MarR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 197 aa  51.6  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.195549 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3645  MarR family transcriptional regulator  44 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.610446  normal  0.0262882 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3230  MarR family transcriptional regulator  26.17 
 
 		 163 aa  51.6  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.9526  normal  0.272965 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1772  MarR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 160 aa  52  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1004  MarR family transcriptional regulator  40.26 
 
 		 157 aa  52  0.000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.324282  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>