More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0292 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0292  OxaA-like protein precursor  100 
 
 
305 aa  625  1e-178  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000376025  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1608  OxaA-like protein precursor  62.26 
 
 
310 aa  366  1e-100  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000470187  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0588  OxaA-like protein precursor  48.3 
 
 
320 aa  270  2e-71  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000375081  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1223  60 kDa inner membrane insertion protein  37.82 
 
 
316 aa  205  7e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.092902  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1396  preprotein translocase subunit YidC  34.69 
 
 
327 aa  195  8.000000000000001e-49  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000130434  hitchhiker  1.60248e-23 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1729  preprotein translocase subunit YidC  35.56 
 
 
307 aa  171  1e-41  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0758405  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0914  preprotein translocase subunit YidC  34.42 
 
 
344 aa  167  2e-40  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0085112  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1697  hypothetical protein  32.12 
 
 
290 aa  152  5e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2127  60 kDa inner membrane insertion protein  33.9 
 
 
290 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000805212  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2165  60 kDa inner membrane insertion protein  33.9 
 
 
290 aa  149  5e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.001129  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5637  OxaA-like protein precursor  35.23 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.951297  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5339  OxaA-like protein precursor  34.98 
 
 
255 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.131872  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5167  OxaA-like protein precursor  34.98 
 
 
255 aa  144  2e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000191232  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5183  OxaA-like protein precursor  34.98 
 
 
255 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000628839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5673  OxaA-like protein precursor  36.36 
 
 
255 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5736  OxaA-like protein precursor  34.98 
 
 
255 aa  144  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.557445  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5596  OxaA-like protein precursor  34.98 
 
 
255 aa  144  2e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5613  OxaA-like protein precursor  35.11 
 
 
258 aa  143  4e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.508196  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4026  OxaA-like protein precursor  34.88 
 
 
255 aa  142  9e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.677321  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5322  OxaA-like protein precursor  33.96 
 
 
255 aa  138  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.409244 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3431  OxaA-like protein precursor  34.13 
 
 
256 aa  138  1e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000222653  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5279  OxaA-like protein precursor  34.98 
 
 
255 aa  138  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127032  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2629  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  40.35 
 
 
249 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1536  60 kDa inner membrane insertion protein  35.55 
 
 
252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0046274  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5166  OxaA-like protein precursor  31.47 
 
 
260 aa  130  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4731  OxaA-like protein precursor  32.34 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.569831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4746  OxaA-like protein precursor  32.34 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4848  OxaA-like protein precursor  32.22 
 
 
260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5176  OxaA-like protein precursor  32.34 
 
 
260 aa  126  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2021  hypothetical protein  31.56 
 
 
278 aa  125  7e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0148683  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4889  OxaA-like protein precursor  31.91 
 
 
260 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5263  OxaA-like protein precursor  31.91 
 
 
260 aa  124  2e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000963165  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5131  OxaA-like protein precursor  31.91 
 
 
260 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0082  OxaA-like protein precursor  31.8 
 
 
260 aa  123  3e-27  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3560  OxaA-like protein precursor  35.43 
 
 
254 aa  123  5e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3610  OxaA-like protein precursor  31.82 
 
 
257 aa  121  9.999999999999999e-27  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5161  OxaA-like protein precursor  31.06 
 
 
260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1942  60 kDa inner membrane insertion protein  33.96 
 
 
263 aa  110  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000307817  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2063  preprotein translocase subunit YidC  28.52 
 
 
278 aa  99.4  8e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.79999  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  31.7 
 
 
344 aa  97.4  2e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.0000325406  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1862  preprotein translocase subunit YidC  27.82 
 
 
286 aa  97.4  3e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.232119  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1789  preprotein translocase subunit YidC  30.68 
 
 
268 aa  94  3e-18  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0000505185  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0130  preprotein translocase subunit YidC  29.2 
 
 
269 aa  92  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3143  inner-membrane protein  28.37 
 
 
542 aa  90.1  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000171877  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0119  60 kDa inner membrane insertion protein  30.66 
 
 
209 aa  89  9e-17  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1896  preprotein translocase subunit YidC  28.73 
 
 
291 aa  83.6  0.000000000000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000421909  hitchhiker  1.20858e-25 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2514  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.24 
 
 
541 aa  83.2  0.000000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000130871  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0448  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.86 
 
 
544 aa  82.8  0.000000000000006  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4182  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.22 
 
 
546 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.000000000773413  normal  0.0773458 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4246  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.22 
 
 
546 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000142375  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4157  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.22 
 
 
546 aa  82.4  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000113128  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0553  putative inner membrane protein translocase component YidC  25.74 
 
 
531 aa  82  0.00000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3326  60 kDa inner membrane insertion protein  29.9 
 
 
229 aa  81.6  0.00000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010032  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2760  60 kDa inner membrane insertion protein  26.94 
 
 
341 aa  82  0.00000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000644122  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03589  inner membrane protein translocase component YidC  31.02 
 
 
548 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.75257  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4261  YidC translocase/secretase  31.02 
 
 
548 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4072  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.02 
 
 
548 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.131417  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4220  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.02 
 
 
548 aa  81.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.118855  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4289  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.02 
 
 
548 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0759973  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3919  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.02 
 
 
548 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00313921  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5135  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.02 
 
 
548 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00207092  normal  0.0616185 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5947  membrane protein insertase, YidC/Oxa1 family  28.75 
 
 
309 aa  80.9  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03533  hypothetical protein  31.02 
 
 
548 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.534027  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0133  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.14 
 
 
541 aa  81.3  0.00000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0580569  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4215  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.02 
 
 
548 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000897196  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00436  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.7 
 
 
540 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4233  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.7 
 
 
548 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.11489  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4176  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.7 
 
 
548 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1623  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.29 
 
 
517 aa  80.9  0.00000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002016  OxaI/YidC membrane insertion protein  29.41 
 
 
540 aa  80.9  0.00000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000829805  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4069  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.7 
 
 
548 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00340238  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4035  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.56 
 
 
543 aa  80.9  0.00000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.247258  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4126  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.7 
 
 
548 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.222064  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2331  60 kDa inner membrane insertion protein  31.67 
 
 
552 aa  80.9  0.00000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4054  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.7 
 
 
548 aa  80.5  0.00000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0899835  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1422  60 kDa inner membrane insertion protein  33.75 
 
 
342 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4135  60 kDa inner membrane insertion protein  26.76 
 
 
219 aa  80.5  0.00000000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.251596  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3316  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.83 
 
 
575 aa  80.1  0.00000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.783784  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4149  putative inner membrane protein translocase component YidC  31.16 
 
 
548 aa  80.1  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000105437  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23580  60 kDa inner membrane insertion protein  28.57 
 
 
217 aa  80.1  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00201404  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1831  putative inner membrane protein translocase component YidC  26.5 
 
 
518 aa  79.3  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0028  putative inner membrane protein translocase component YidC  29.44 
 
 
545 aa  79.3  0.00000000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.15409  normal  0.0935166 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0006  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.51 
 
 
560 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000387778 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5309  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.51 
 
 
560 aa  79  0.00000000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.910149  normal  0.0868042 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0881  60 kDa inner membrane insertion protein  28.44 
 
 
514 aa  78.6  0.0000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5444  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.3 
 
 
560 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5743  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.23 
 
 
560 aa  78.2  0.0000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00528765  normal  0.582095 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2030  Oxa1/60 kDa IMP family protein  29.96 
 
 
584 aa  78.6  0.0000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.728079  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0003  putative inner membrane protein translocase component YidC  27.6 
 
 
541 aa  79  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0110357  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3611  60 kDa inner membrane insertion protein  28.45 
 
 
566 aa  78.2  0.0000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5213  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.3 
 
 
560 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4293  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.04 
 
 
544 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.016276  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4616  putative inner membrane protein translocase component YidC  28.04 
 
 
543 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.159313  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3940  protein translocase subunit yidC  29.82 
 
 
541 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000301662  unclonable  0.0000000000640431 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3466  hypothetical protein  30.7 
 
 
531 aa  77.4  0.0000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.562042  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4264  putative inner membrane protein translocase component YidC  30.09 
 
 
543 aa  77.4  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00254597  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0006  protein translocase subunit yidC  29.36 
 
 
541 aa  77  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101193  unclonable  0.0000000000873101 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4032  protein translocase subunit yidC  28.9 
 
 
541 aa  77.4  0.0000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.0000158142  hitchhiker  0.000218645 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0004  inner membrane protein, 60 kDa  28.9 
 
 
541 aa  77  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0888  60 kDa inner membrane insertion protein  26.58 
 
 
539 aa  77  0.0000000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00675947 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>