More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0249 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0249  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  100 
 
 
584 aa  1163  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2078  protein of unknown function/lipoprotein, putative  64.78 
 
 
320 aa  417  1e-115  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  3.17435e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2077  ABC transporter, permease protein  72.88 
 
 
298 aa  345  2e-93  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.251592  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2828  protein of unknown function DUF534  46.51 
 
 
341 aa  268  2e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  6.7856e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2840  hypothetical protein  40.88 
 
 
329 aa  260  6e-68  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00146979  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1712  hypothetical protein  41.12 
 
 
343 aa  256  9e-67  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2584  protein of unknown function DUF534  44.19 
 
 
322 aa  252  1e-65  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  3.78214e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19990  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  42.67 
 
 
325 aa  248  2e-64  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  9.09791e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0747  protein of unknown function DUF534  46.83 
 
 
319 aa  237  4e-61  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  2.99763e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1461  protein of unknown function DUF534  43.77 
 
 
326 aa  230  6e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.655823  hitchhiker  7.85059e-07 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1502  protein of unknown function DUF534  43.42 
 
 
326 aa  229  8e-59  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0497356  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0325  hypothetical protein  42.7 
 
 
337 aa  228  2e-58  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  9.3059e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1599  hypothetical protein  38.59 
 
 
341 aa  228  2e-58  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.164938  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2038  hypothetical protein  38.97 
 
 
324 aa  228  2e-58  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0401201 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0867  hypothetical protein  39.86 
 
 
317 aa  228  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14390  putative ABC-type transport protein, periplasmic c  39.42 
 
 
325 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1277  ABC transporter periplasmic protein  39.42 
 
 
325 aa  226  6e-58  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3141  hypothetical protein  41.28 
 
 
344 aa  226  8e-58  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.774643 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1569  hypothetical protein  45.15 
 
 
270 aa  224  2e-57  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1435  ABC transporter, substrate-binding protein  38.26 
 
 
341 aa  224  3e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.457922 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1740  putative signal peptide protein  42.7 
 
 
329 aa  224  4e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.324025  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1089  hypothetical protein  34.06 
 
 
324 aa  224  5e-57  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.623165  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1949  protein of unknown function DUF534  42.45 
 
 
323 aa  224  5e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.325569  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1974  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  39.79 
 
 
321 aa  223  6e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.350596  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1315  hypothetical protein  41.31 
 
 
322 aa  223  9e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.710416  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4311  hypothetical protein  40.83 
 
 
323 aa  222  1e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1949  hypothetical protein  40.93 
 
 
322 aa  221  3e-56  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.521982  normal  0.530099 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0522  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.78 
 
 
323 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2842  hypothetical protein  43.77 
 
 
321 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.838657  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2831  hypothetical protein  43.77 
 
 
321 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2218  hypothetical protein  43.77 
 
 
321 aa  220  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.792913  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0687  hypothetical protein  40.78 
 
 
323 aa  220  5e-56  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.695936  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0109  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.78 
 
 
323 aa  220  6e-56  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1479  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.78 
 
 
323 aa  220  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2907  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.78 
 
 
323 aa  220  6e-56  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0505  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  40.78 
 
 
323 aa  220  6e-56  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0440  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  40.12 
 
 
323 aa  220  7e-56  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.173038  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2856  protein of unknown function DUF534  39.67 
 
 
337 aa  220  7e-56  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1211  hypothetical protein  42.35 
 
 
323 aa  219  9e-56  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0959108 
 
 
-
 
NC_004310  BR2053  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  39.44 
 
 
321 aa  219  9e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4553  protein of unknown function DUF534  40.99 
 
 
329 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3067  hypothetical protein  36.69 
 
 
317 aa  219  1e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1750  protein of unknown function DUF534  40.93 
 
 
322 aa  219  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6161  hypothetical protein  43.06 
 
 
321 aa  218  3e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.432237 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1155  ABC transporter substrate-binding protein  39.68 
 
 
333 aa  217  4e-55  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  1.38162e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0268  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  47.88 
 
 
297 aa  217  5e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.603653  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0078  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  47.03 
 
 
299 aa  217  5e-55  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0472  hypothetical protein  43.06 
 
 
321 aa  217  5e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.997143 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3140  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  40.45 
 
 
323 aa  217  6e-55  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.226285  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0619  hypothetical protein  37.58 
 
 
321 aa  214  4e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002970  ABC transporter substrate-binding protein  38.85 
 
 
321 aa  214  4e-54  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1817  hypothetical protein  37.26 
 
 
331 aa  214  5e-54  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00011469  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1189  hypothetical protein  38.82 
 
 
334 aa  213  7e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.00418408  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03810  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  41.55 
 
 
336 aa  213  9e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2227  hypothetical protein  39.65 
 
 
338 aa  213  9e-54  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00471107  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4046  protein of unknown function DUF534  37.94 
 
 
317 aa  213  9e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3723  protein of unknown function DUF534  37.94 
 
 
317 aa  212  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0821  ABC transporter substrate binding inner membrane protein  39.22 
 
 
319 aa  211  2e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0105624 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02940  hypothetical protein  39.64 
 
 
322 aa  211  2e-53  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1473  protein of unknown function DUF534  39.86 
 
 
335 aa  211  3e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0258  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  39.1 
 
 
347 aa  210  6e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  1.82856e-10  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0047  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  36.72 
 
 
327 aa  209  2e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2867  hypothetical protein  36.52 
 
 
316 aa  207  6e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2106  hypothetical protein  35.99 
 
 
323 aa  206  1e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.363313  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0079  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  37.43 
 
 
334 aa  205  2e-51  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.0035536  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0511  protein of unknown function DUF534  39.52 
 
 
329 aa  204  3e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0267  ABC-type uncharacterized transport system, periplasmic component  40.82 
 
 
359 aa  201  4e-50  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0239321  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0251  protein of unknown function DUF534  34.15 
 
 
320 aa  197  4e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00303449  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03820  ABC-type uncharacterized transport system, permease component  48.66 
 
 
329 aa  196  8e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19980  inner-membrane translocator  43.88 
 
 
306 aa  196  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.56701e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0657  protein of unknown function DUF534  36.39 
 
 
330 aa  194  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.342868  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1818  inner-membrane translocator  50.47 
 
 
299 aa  192  1e-47  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  decreased coverage  2.19565e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1434  ABC transporter, substrate-binding protein  35.71 
 
 
349 aa  191  3e-47  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.681297 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0723  protein of unknown function DUF534  36.93 
 
 
332 aa  189  9e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000763859  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2585  inner-membrane translocator  47.06 
 
 
302 aa  189  1e-46  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  1.14262e-12  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0736  protein of unknown function DUF534  36.01 
 
 
332 aa  187  5e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.04583e-09 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2161  protein of unknown function DUF534  35.12 
 
 
324 aa  187  5e-46  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.321904 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2365  protein of unknown function DUF534  36.17 
 
 
331 aa  187  6e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00100062  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1598  hypothetical protein  34.47 
 
 
349 aa  183  7e-45  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108913  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2829  inner-membrane translocator  45.3 
 
 
309 aa  181  3e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.127019  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1711  hypothetical protein  32.93 
 
 
370 aa  181  5e-44  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0026  hypothetical protein  34.95 
 
 
328 aa  180  6e-44  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.35198  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0210  hypothetical protein  36.84 
 
 
320 aa  179  1e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0259  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  50.47 
 
 
308 aa  177  3e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0510641  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2364  protein of unknown function DUF534  36.3 
 
 
328 aa  177  4e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000124724  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2646  protein of unknown function DUF534  35.8 
 
 
329 aa  176  8e-43  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0042  protein of unknown function DUF534  36.81 
 
 
322 aa  176  1e-42  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.920382  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1570  inner-membrane translocator  43.46 
 
 
307 aa  174  3e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0205  protein of unknown function DUF534  37.14 
 
 
298 aa  173  7e-42  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0631  inner-membrane translocator  43.56 
 
 
315 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0289508  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0076  inner-membrane translocator  42.13 
 
 
306 aa  172  1e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2162  inner-membrane translocator  42.86 
 
 
295 aa  171  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.596984 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1600  inner-membrane translocator  43.24 
 
 
299 aa  172  2e-41  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.852679 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1436  ABC transporter, inner membrane subunit  43.69 
 
 
299 aa  172  2e-41  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.641737 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1119  ABC transporter, inner membrane subunit  41.99 
 
 
305 aa  171  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1188  ABC transporter, permease protein  46.22 
 
 
287 aa  171  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0658  inner-membrane translocator  39.18 
 
 
325 aa  171  5e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.812733  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1110  ABC transporter, inner membrane subunit  41.56 
 
 
305 aa  170  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1947  protein of unknown function DUF534  28.62 
 
 
327 aa  169  2e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.734312  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1154  ribose/xylose/arabinose/galactoside ABC-type transporter permease  45.37 
 
 
289 aa  168  3e-40  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  4.9546e-06  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>