More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0235 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0235  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  100 
 
 		 270 aa  519  1e-146  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000286144  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0156  zinc ABC transporter, permease protein  71.75 
 
 		 270 aa  375  1e-103  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.202162  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2417  zinc ABC transporter permease  61.8 
 
 		 269 aa  315  7e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0276  ABC-3 protein  39 
 
 		 264 aa  181  1e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.367177  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2647  ABC-3 protein  37.9 
 
 		 276 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0549  hypothetical protein  34.34 
 
 		 284 aa  163  3e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0152073  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4182  ABC-3 protein  37.8 
 
 		 285 aa  162  5.0000000000000005e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000173146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3816  ABC-3 protein  32.82 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.574844  normal  0.0511946 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3439  ABC-3 protein  32.06 
 
 		 291 aa  157  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.926504  normal  0.181185 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0044  ABC-3 protein  31.84 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000363337  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2341  hypothetical protein  33.73 
 
 		 277 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0389315  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0735  ABC-3 protein  32.84 
 
 		 300 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.933975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3229  ABC-3 protein  31.75 
 
 		 289 aa  151  1e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0676629  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4398  putative cation ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0373331  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0838  putative cation ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0184549  hitchhiker  0.000162112 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2402  ABC-3 protein  35 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4182  cation ABC transporter permease  33.46 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4020  zinc ABC transporter permease  33.46 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.143815  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4030  zinc ABC transporter permease  33.46 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.440136  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4504  cation ABC transporter permease protein  33.46 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.370908  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0463  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 264 aa  150  3e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.826396  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4302  putative cation ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 		 277 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.28596e-18 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2063  hypothetical protein  37.9 
 
 		 265 aa  149  4e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0131229  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4360  cation ABC transporter, permease protein, putative  33.08 
 
 		 277 aa  149  6e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.204429  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2192  ABC-3 protein  34.11 
 
 		 271 aa  148  9e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000361955  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0518  ABC-3 protein  31.82 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4414  putative cation ABC transporter, permease protein  32.69 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000329407  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3008  ABC-3 protein  31.92 
 
 		 277 aa  147  2.0000000000000003e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.576652  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1710  putative zinc ABC transporter, permease protein  34.66 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.223491  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1443  metal (zinc) transport protein (ABC transporter, permease protein) zurM  34.66 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.834179  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2432  ABC-3 protein  34.94 
 
 		 268 aa  147  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000347054  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4133  ABC-3 protein  32.69 
 
 		 277 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3532  ABC-3 protein  33.7 
 
 		 274 aa  145  6e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1056  ABC-3 protein  33.06 
 
 		 270 aa  145  8.000000000000001e-34  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0502  ABC-3 protein  32.93 
 
 		 266 aa  145  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.24311  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0169  ABC-3 protein  33.2 
 
 		 277 aa  142  8e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0048  ABC-3 protein  34.09 
 
 		 272 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3598  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 274 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1653  ATP-binding domain-containing protein  32.14 
 
 		 272 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1213  ABC-3 protein  31.33 
 
 		 268 aa  136  3.0000000000000003e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0857  ABC zinc/manganese transport system permease protein  33.07 
 
 		 297 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.405285  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1600  ABC-3 protein  33.6 
 
 		 339 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.311629  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1580  ABC-3 protein  33.33 
 
 		 280 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0493  hypothetical protein  31.94 
 
 		 272 aa  132  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1121  ABC transporter, permease protein  33.47 
 
 		 282 aa  131  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.44937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7036  ABC-3 protein  36.68 
 
 		 301 aa  131  1.0000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1935  ABC-3 protein  31.91 
 
 		 337 aa  130  2.0000000000000002e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739035  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2137  ABC-3 protein  31.54 
 
 		 277 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00135344  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17100  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  32.86 
 
 		 308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.478155  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1647  ABC-3 protein  32 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.115833  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1613  ABC-3 protein  32 
 
 		 290 aa  129  6e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.478598  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2562  cation ABC transporter, permease protein, putative  32.92 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2049  ABC-3 protein  28.63 
 
 		 283 aa  128  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.461992 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0596  ABC-3 protein  30.48 
 
 		 272 aa  127  3e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11810  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.65 
 
 		 330 aa  126  3e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00721282  normal  0.650554 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13660  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  28 
 
 		 310 aa  123  3e-27  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.550676 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3315  ABC-3 protein  31.62 
 
 		 336 aa  121  9.999999999999999e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.983791 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1835  ABC-3 protein  31.52 
 
 		 277 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.906803  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04290  ABC-type Mn2+/Zn2+ transport system, permease component  30.16 
 
 		 269 aa  119  6e-26  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1193  ABC-3 protein  30.56 
 
 		 326 aa  118  9.999999999999999e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000246923  hitchhiker  0.00000600855 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2984  ABC transporter, permease protein  33.46 
 
 		 272 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1535  ABC-3 protein  29.8 
 
 		 312 aa  115  7.999999999999999e-25  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.428275  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1773  ABC-3 protein  28.73 
 
 		 310 aa  114  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.153932  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18330  ABC-3 protein  30.86 
 
 		 277 aa  113  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000262372  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2568  ABC-3 protein  28.79 
 
 		 361 aa  112  8.000000000000001e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.343936  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3000  ABC-3 protein  31.75 
 
 		 285 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0223089  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0965  ABC-3 protein  28.35 
 
 		 357 aa  110  3e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  unclonable  0.00000935125  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1167  ABC-3 protein  30.08 
 
 		 293 aa  109  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1547  ABC-3 protein  26.34 
 
 		 279 aa  106  5e-22  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1889  ABC 3 transport family protein  27.95 
 
 		 266 aa  105  8e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1599  hypothetical protein  25.86 
 
 		 281 aa  104  2e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000345254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2421  ABC Mn2+/Zn2+ transporter,inner membrane subunit  29.27 
 
 		 276 aa  104  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1635  ABC-3 protein  27.48 
 
 		 337 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2170  ABC-3 protein  28.36 
 
 		 312 aa  104  2e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0264712  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4744  ABC-3 protein  25 
 
 		 285 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3180  ABC-3 protein  27.31 
 
 		 272 aa  103  2e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.131337  normal  0.114587 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1710  ABC-3 protein  30.71 
 
 		 273 aa  102  6e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.793327  normal  0.78687 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1009  ABC-3 protein  33.64 
 
 		 320 aa  102  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.864655  normal  0.660326 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0129  ABC-3 protein  23.02 
 
 		 269 aa  102  9e-21  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.765691  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2208  ABC-3 protein  26.79 
 
 		 285 aa  102  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.033424  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0841  ABC-3 protein  25.65 
 
 		 280 aa  102  9e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.522367  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2006  ABC-3 protein  28.46 
 
 		 371 aa  102  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.522018  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1017  ABC transporter, inner membrane subunit  27.17 
 
 		 275 aa  101  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2573  manganese transport system membrane protein MntB  28.51 
 
 		 276 aa  100  2e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.449069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2550  ABC-3 protein  26.62 
 
 		 300 aa  100  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1916  ABC-3 protein  27.34 
 
 		 285 aa  99.8  4e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0155805  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0294  ABC-3 protein  31.7 
 
 		 263 aa  99.4  5e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0853  ABC-3 protein  28.86 
 
 		 352 aa  98.2  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1812  ABC-3 protein  29.18 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0136745  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1702  chelated iron ABC transporter, permease protein YfeD  29.18 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2633  chelated iron transport system membrane protein  29.18 
 
 		 297 aa  98.2  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.754634  normal  0.711765 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0278  hypothetical protein  28.06 
 
 		 262 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007105  pE33L54_0037  manganese ABC transporter, permease  27.65 
 
 		 288 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000000275951  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1143  hypothetical protein  29.92 
 
 		 287 aa  97.4  2e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0987  ABC-3 protein  22.18 
 
 		 272 aa  97.4  2e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0136  cation ABC transporter, permease protein  27.07 
 
 		 267 aa  97.1  3e-19  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.032132  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0335  ABC-3 protein  30.43 
 
 		 283 aa  96.7  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0205271  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4571  ABC-3 protein  30.74 
 
 		 289 aa  96.7  4e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.222583  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2130  ABC-3 protein  27.47 
 
 		 286 aa  96.7  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0882717 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2066  metal ABC transporter, permease protein  27.65 
 
 		 288 aa  96.3  4e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>