More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0234 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0234  ABC-type Mn/Zn transport system, ATPase component  100 
 
 
235 aa  494  1e-139  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.000000539035  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0155  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  79.57 
 
 
236 aa  394  1e-109  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0247418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2418  zinc ABC transporter ATP-binding protein  69.78 
 
 
245 aa  345  4e-94  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2646  ABC transporter related  40.09 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4183  cation ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.420645  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4303  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.9910000000000006e-20 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4021  cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.67 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0100127  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4505  cation ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 
256 aa  173  1.9999999999999998e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.345764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4415  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
256 aa  171  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00132022  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4361  cation ABC transporter, ATP-binding protein, putative  41.18 
 
 
256 aa  171  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.129987  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4031  cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
256 aa  171  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00593261  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0837  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
256 aa  170  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00154907  hitchhiker  0.00000902148 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4399  putative cation ABC transporter, ATP-binding protein  41.18 
 
 
256 aa  170  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0939704  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4134  ABC transporter related  41.67 
 
 
256 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3009  ABC transporter-related protein  41.18 
 
 
257 aa  167  1e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.12216  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0277  ABC transporter related  37.55 
 
 
254 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.210378  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0043  ABC transporter related  39.62 
 
 
247 aa  158  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000016055  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1579  ABC transporter related protein  37.98 
 
 
255 aa  156  3e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0223  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
236 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1103  ABC transporter related  35.94 
 
 
250 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.813503  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2403  ABC transporter related  38.78 
 
 
252 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1834  ABC transporter related  34.76 
 
 
249 aa  149  3e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.269804  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1122  ABC transporter, ATP-binding protein  36.49 
 
 
260 aa  148  7e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.570761  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0548  ABC transporter related protein  37.98 
 
 
259 aa  148  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.324241  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0329  ABC transporter-like protein  36.97 
 
 
256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3314  ABC transporter related  40.19 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3554  ABC transporter related  39.41 
 
 
259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0438538  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0031  ABC transporter related  39.51 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0702  ABC transporter related  38.94 
 
 
236 aa  144  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000000834751  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0047  ABC transporter related  36.19 
 
 
250 aa  144  1e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3599  ABC transporter related  34.43 
 
 
250 aa  143  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1225  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  37.68 
 
 
255 aa  144  2e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0533  ABC transporter related  37.09 
 
 
255 aa  143  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.622469  normal  0.988853 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3533  ABC transporter related protein  34.43 
 
 
250 aa  143  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0168  ABC transporter related protein  38.35 
 
 
255 aa  142  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1277  ABC transporter related protein  36.06 
 
 
247 aa  142  4e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3069  ABC transporter related  37.09 
 
 
262 aa  142  4e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000627789  hitchhiker  0.00392606 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3283  ABC transporter related protein  35.47 
 
 
249 aa  139  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4183  ABC transporter related  35.71 
 
 
250 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00136273  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1590  ABC transporter related  37.95 
 
 
262 aa  138  7e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0492  ABC transporter-related protein  33.81 
 
 
256 aa  138  7.999999999999999e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0964  ABC transporter related protein  39.13 
 
 
250 aa  138  8.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.0000527176  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2569  ABC transporter related  34 
 
 
311 aa  137  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.630319  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0597  ABC transporter related protein  33.65 
 
 
230 aa  137  1e-31  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3726  ABC transporter related  37.74 
 
 
255 aa  137  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1994  ABC transporter related protein  34.62 
 
 
262 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5757  ABC transporter related protein  37.02 
 
 
263 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.329137  normal  0.47815 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2191  ABC transporter related  33.81 
 
 
249 aa  137  2e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000419302  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18340  ABC transporter related  38.53 
 
 
239 aa  136  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000733695  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2985  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2064  ABC transporter-related protein  35.68 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.443264  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3622  ABC transporter related protein  37.26 
 
 
255 aa  136  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2138  ABC transporter related  33.81 
 
 
250 aa  135  4e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000174943  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1399  ABC transporter related  35.44 
 
 
246 aa  135  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.765734  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0689  ABC transporter related protein  35.96 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.010451  normal  0.0371148 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1723  ABC transporter related  36.74 
 
 
263 aa  134  9e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2475  ABC transporter related  33.97 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.322042  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2015  ABC transporter related protein  34.55 
 
 
278 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00270172  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02040  zinc ABC transporter, ATP-binding protein  38.05 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1033  hypothetical protein  35.1 
 
 
264 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0517  ABC transporter related  33.33 
 
 
221 aa  134  9.999999999999999e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0099  ABC transporter related  35.05 
 
 
268 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0624  ABC transporter-like protein  35.47 
 
 
259 aa  134  1.9999999999999998e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0130824  normal  0.079579 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2434  ABC transporter related protein  37.14 
 
 
246 aa  134  1.9999999999999998e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000150378  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0723  AfeB  35.71 
 
 
280 aa  134  1.9999999999999998e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0402622  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3172  chelated iron transport system membrane protein YfeB  36.97 
 
 
273 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.513641  normal  0.970851 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3015  chelated iron transport system membrane protein YfeB  36.97 
 
 
273 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.105627 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3261  ABC transporter related  36.45 
 
 
257 aa  132  6e-30  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.000189494  normal  0.195184 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3067  chelated iron transport system membrane protein YfeB  36.97 
 
 
273 aa  132  6e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.381864  normal  0.0646347 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1257  ABC transporter related  36.41 
 
 
271 aa  131  9e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0480594  hitchhiker  0.000898687 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3025  ABC-type transport system, ATP binding component  33.92 
 
 
257 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1682  ABC transporter related  35.55 
 
 
247 aa  131  1.0000000000000001e-29  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2984  chelated iron transport system membrane protein YfeB  36.97 
 
 
273 aa  130  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1016  ABC transporter, ATPase subunit  34.31 
 
 
249 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03380  ATPase component of Mn/Zn ABC-type transporter  36.63 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.379323  normal  0.939533 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2615  ABC transporter related  31.92 
 
 
258 aa  130  3e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0155  cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 
284 aa  129  3e-29  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2081  ABC transporter related  35.96 
 
 
265 aa  129  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.872103  normal  0.240301 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3051  chelated iron transport system membrane protein YfeB  36.49 
 
 
273 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0128316 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0137  cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 
284 aa  129  4.0000000000000003e-29  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2966  ABC transporter ATP-binding protein  33.81 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00148861  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0196  ABC transporter-related protein  33.18 
 
 
243 aa  129  4.0000000000000003e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.440327  normal  0.450863 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3191  ABC transporter ATP-binding protein  33.81 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.540176  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2026  Mn/Zn ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 
261 aa  129  4.0000000000000003e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.237224  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3636  ABC transporter-related protein  34.13 
 
 
249 aa  129  4.0000000000000003e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0655  ABC transporter related  35.1 
 
 
239 aa  129  5.0000000000000004e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2035  ABC transporter related  36.49 
 
 
247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  0.523327 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3084  ABC transporter related  33.33 
 
 
269 aa  129  5.0000000000000004e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.41824  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0797  ferrichrome ABC transporter ATP-binding protein  35.19 
 
 
260 aa  129  5.0000000000000004e-29  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.274021  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4770  ABC transporter related  36.32 
 
 
250 aa  128  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.285332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55040  putative ATP-binding component of ferric enterobactin transport  35.78 
 
 
285 aa  129  6e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000063411  unclonable  1.8990000000000002e-21 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2734  ABC transporter related  34.86 
 
 
258 aa  128  6e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2342  ABC transporter related protein  35.27 
 
 
259 aa  128  7.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104836  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0178  cation ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 
284 aa  128  7.000000000000001e-29  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2618  ABC transporter related  37.38 
 
 
247 aa  128  8.000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.314848  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0462  ABC transporter related  35.35 
 
 
220 aa  128  8.000000000000001e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3037  ABC transporter related  32.86 
 
 
269 aa  128  9.000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1614  ABC transporter related  34.68 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.507834  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3045  ABC transporter related  34.58 
 
 
286 aa  127  1.0000000000000001e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155685  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1648  ABC transporter related  34.68 
 
 
261 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.168951  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>