53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0207 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0207  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
387 aa  757  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  decreased coverage  0.000553672  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1892  hypothetical protein  39.3 
 
 
358 aa  226  4e-58  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  6.60626e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0827  major facilitator superfamily permease  31.32 
 
 
392 aa  156  5e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0734  major facilitator superfamily permease  30.18 
 
 
401 aa  147  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00142824  normal  0.0126136 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0383  major facilitator superfamily permease  31.27 
 
 
396 aa  136  6e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000189832  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0874  major facilitator superfamily permease  28.05 
 
 
399 aa  134  2e-30  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1574  major facilitator superfamily permease  28.77 
 
 
403 aa  127  3e-28  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1543  major facilitator transporter  27.9 
 
 
405 aa  123  5e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  8.74493e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0803  major facilitator family protein  26.63 
 
 
383 aa  116  8e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.02025  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0134  major facilitator superfamily permease  33.5 
 
 
332 aa  113  7e-24  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0306  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 
384 aa  100  5e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1289  major facilitator superfamily permease  25.7 
 
 
398 aa  90.5  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.000157601  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1581  major facilitator superfamily MFS_1  23.2 
 
 
378 aa  80.9  4e-14  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2685  major facilitator superfamily MFS_1  24.52 
 
 
400 aa  76.6  6e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0160306  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0704  major facilitator superfamily MFS_1  26.4 
 
 
394 aa  76.6  6e-13  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2615  major facilitator superfamily MFS_1  25.13 
 
 
414 aa  75.1  2e-12  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.543529 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0297  hypothetical protein  23.48 
 
 
373 aa  72.4  1e-11  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0790  major facilitator superfamily MFS_1  22.51 
 
 
388 aa  67.4  4e-10  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.284205  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3218  major facilitator transporter  23.8 
 
 
385 aa  65.9  1e-09  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4214  major facilitator superfamily MFS_1  23.51 
 
 
414 aa  60.8  3e-08  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2112  major facilitator transporter  23.33 
 
 
408 aa  59.7  7e-08  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1662  major facilitator superfamily MFS_1  26.15 
 
 
381 aa  60.1  7e-08  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.127475 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0686  major facilitator superfamily MFS_1  25.17 
 
 
411 aa  58.2  2e-07  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.626773  normal 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0013  major facilitator superfamily MFS_1  27.74 
 
 
388 aa  57  6e-07  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1994  major facilitator transporter  23.16 
 
 
397 aa  55.5  2e-06  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0711  major facilitator transporter  26.97 
 
 
410 aa  53.5  6e-06  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1447  major facilitator superfamily MFS_1  24.72 
 
 
399 aa  51.6  3e-05  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.320461  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1855  major facilitator superfamily protein  25.75 
 
 
423 aa  51.2  3e-05  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.14226  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1679  major facilitator superfamily protein  25.15 
 
 
423 aa  50.8  4e-05  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2355  major facilitator superfamily MFS_1  25.36 
 
 
385 aa  50.8  4e-05  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3440  major facilitator transporter  23.08 
 
 
402 aa  50.1  6e-05  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2059  major facilitator superfamily protein  25.15 
 
 
423 aa  49.3  0.0001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2615  major facilitator transporter  27.63 
 
 
404 aa  48.9  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.164819 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0884  major facilitator transporter  23.42 
 
 
394 aa  47.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2371  major facilitator superfamily MFS_1  23.85 
 
 
425 aa  48.1  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0866  Bcr/CflA subfamily drug resistance transporter  27.71 
 
 
417 aa  47.8  0.0004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.527312  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5021  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.5 
 
 
478 aa  46.6  0.0007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.796578 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2219  major facilitator transporter  26.37 
 
 
384 aa  46.6  0.0007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0096  EmrB/QacA family drug resistance transporter  23.98 
 
 
477 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5599  MFS permease  21.22 
 
 
409 aa  45.8  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0103411  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0116  major facilitator transporter  25.93 
 
 
406 aa  46.2  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3924  major facilitator superfamily MFS_1  32.22 
 
 
400 aa  45.1  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3394  GGDEF  26.02 
 
 
421 aa  45.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.50121 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1860  major facilitator superfamily MFS_1  24.74 
 
 
407 aa  45.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.209124 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1153  major facilitator transporter  29.05 
 
 
367 aa  44.7  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0535  major facilitator superfamily MFS_1  25.19 
 
 
408 aa  44.3  0.003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2983  major facilitator superfamily MFS_1  28.35 
 
 
404 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1070  MFS transporter  23.11 
 
 
402 aa  44.3  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3204  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.89 
 
 
538 aa  44.3  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1899  major facilitator superfamily MFS_1  24.08 
 
 
408 aa  43.9  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0196  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  25.81 
 
 
532 aa  43.5  0.006  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.904476  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3203  major facilitator family transporter  22.02 
 
 
396 aa  43.1  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0914  major facilitator transporter  24.87 
 
 
396 aa  42.7  0.01  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>