More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0162 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0162  heat shock protein GrpE  100 
 
 
204 aa  402  1e-111  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0096  heat shock protein GrpE  81.94 
 
 
190 aa  240  1e-62  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1026  heat shock protein GrpE  73.68 
 
 
190 aa  234  8e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.000103235  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0705  GrpE protein  45.12 
 
 
190 aa  142  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0594473  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0821  heat shock protein GrpE  49.32 
 
 
192 aa  140  9.999999999999999e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.085613  normal  0.503339 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1310  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  50.35 
 
 
198 aa  139  3.9999999999999997e-32  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000765244  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2438  GrpE protein  43.24 
 
 
208 aa  128  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0240587  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1673  heat shock protein GrpE  42.58 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0666687  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1639  heat shock protein GrpE  42.58 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.980219  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4214  heat shock protein GrpE  42.71 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.121908  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4052  heat shock protein GrpE  42.71 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00116461  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4062  heat shock protein GrpE  42.71 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00424563  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4540  heat shock protein GrpE  42.71 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4337  heat shock protein GrpE  42.71 
 
 
188 aa  126  2.0000000000000002e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.21014e-34 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0802  heat shock protein GrpE  42.71 
 
 
188 aa  126  3e-28  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000114529  hitchhiker  2.29846e-19 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4434  heat shock protein GrpE  42.71 
 
 
188 aa  126  3e-28  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000213644  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  41.88 
 
 
189 aa  125  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1012  heat shock protein GrpE  43.48 
 
 
213 aa  125  5e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4166  heat shock protein GrpE  42.19 
 
 
188 aa  124  7e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0177219  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1149  heat shock protein GrpE  39.04 
 
 
210 aa  124  1e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.67207  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4448  heat shock protein GrpE  40.61 
 
 
192 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000207397  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3041  heat shock protein GrpE  39.29 
 
 
198 aa  114  8.999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.004999  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1405  GrpE protein  35.56 
 
 
190 aa  111  9e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4396  heat shock protein GrpE  40.69 
 
 
192 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0382773  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  37.58 
 
 
186 aa  107  2e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1167  GrpE protein  40.29 
 
 
178 aa  103  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2497  GrpE protein  38.1 
 
 
192 aa  103  2e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127852  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  39.73 
 
 
206 aa  102  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0454  GrpE protein  37.07 
 
 
186 aa  101  8e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  39.04 
 
 
206 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  39.04 
 
 
206 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  39.04 
 
 
206 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  39.04 
 
 
206 aa  100  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2291  heat shock protein GrpE  37.78 
 
 
208 aa  100  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2006  heat shock protein GrpE  37.04 
 
 
208 aa  100  2e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3363  GrpE protein  37.42 
 
 
245 aa  99.8  3e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00347236  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  39.04 
 
 
203 aa  99.4  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  36.92 
 
 
210 aa  98.6  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  38.36 
 
 
203 aa  99  5e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  38.36 
 
 
206 aa  99  5e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4300  GrpE protein  36.73 
 
 
213 aa  98.2  7e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000230249  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  36.99 
 
 
181 aa  98.2  7e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  37.67 
 
 
201 aa  97.4  1e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  37.67 
 
 
206 aa  96.7  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  43.24 
 
 
218 aa  97.1  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  34.54 
 
 
201 aa  96.7  2e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  35.9 
 
 
210 aa  96.7  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  37.67 
 
 
179 aa  95.9  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  33.72 
 
 
204 aa  96.3  3e-19  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0785  GrpE protein  33.84 
 
 
207 aa  96.3  3e-19  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0070  molecular chaperone, heat shock protein  35 
 
 
179 aa  96.3  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.120308 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12810  GrpE protein  40.91 
 
 
231 aa  95.9  4e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.239064  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  35.48 
 
 
208 aa  95.5  5e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  34.04 
 
 
200 aa  94.7  8e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3479  heat shock protein GrpE  37.84 
 
 
209 aa  94.7  9e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.0000435816  normal  0.0401789 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  34.72 
 
 
193 aa  94  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  38.36 
 
 
209 aa  94  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2497  putative heat shock protein  38.19 
 
 
182 aa  93.6  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.437332 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1799  GrpE protein  35 
 
 
197 aa  93.2  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.298805  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  34.04 
 
 
200 aa  93.6  2e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  36.42 
 
 
184 aa  92.8  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_3071  GrpE protein  35.19 
 
 
238 aa  92.8  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.215635  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  34.57 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  34.57 
 
 
210 aa  92.8  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  31.49 
 
 
178 aa  92.4  4e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0108  heat shock protein nucleotide exchange factor GrpE  39.55 
 
 
198 aa  92.4  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000378149  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0606  GrpE protein  37.24 
 
 
210 aa  92.4  4e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2830  GrpE protein  40.14 
 
 
181 aa  92  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.140779  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2635  heat shock protein GrpE  38.06 
 
 
181 aa  92  5e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3125  heat shock protein GrpE  35.8 
 
 
186 aa  92  6e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.00453853  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  35.17 
 
 
178 aa  91.7  7e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0736  heat shock protein GrpE  36.24 
 
 
194 aa  91.7  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.273487  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2924  GrpE protein  34.52 
 
 
173 aa  91.7  7e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  35.66 
 
 
217 aa  91.3  8e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  40.6 
 
 
194 aa  91.3  8e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4484  GrpE protein  35.94 
 
 
244 aa  91.3  9e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1857  GrpE protein  38.36 
 
 
185 aa  90.5  1e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  35.66 
 
 
230 aa  90.5  1e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2133  HSP70 family protein GrpE  37.3 
 
 
199 aa  90.5  1e-17  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0603928  normal  0.40294 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  35.66 
 
 
230 aa  90.9  1e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  34.97 
 
 
228 aa  90.9  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4974  GrpE protein  30.65 
 
 
211 aa  91.3  1e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0161859  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1537  molecular chaperone protein GrpE  38.35 
 
 
173 aa  90.1  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.818468  normal  0.071665 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3222  GrpE protein  35.1 
 
 
204 aa  90.5  2e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000198101  hitchhiker  0.000541845 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  36.18 
 
 
210 aa  90.1  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1306  heat shock protein GrpE  35.82 
 
 
178 aa  90.1  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3042  heat shock protein GrpE  37.24 
 
 
207 aa  90.5  2e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27806  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  34 
 
 
212 aa  89.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_14947  mitochondrial GrpE-like protein  31.68 
 
 
240 aa  90.1  2e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0088904  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3506  heat shock protein GrpE  36.91 
 
 
188 aa  90.1  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.175972  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  35 
 
 
205 aa  90.1  2e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2208  heat shock protein GrpE  35.82 
 
 
185 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  36.99 
 
 
192 aa  89.7  3e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2328  heat shock protein GrpE  35.82 
 
 
185 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1101  heat shock protein GrpE  35.82 
 
 
185 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.322152  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  36 
 
 
206 aa  89.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3575  heat shock protein GrpE  34.39 
 
 
186 aa  89.4  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0971  GrpE protein  37.84 
 
 
187 aa  89.7  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.314079  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3313  heat shock protein GrpE  35.82 
 
 
185 aa  89.7  3e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0498  heat shock protein GrpE  35.82 
 
 
185 aa  89.7  3e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.755488  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>