242 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0152 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0152  transposase  100 
 
 
164 aa  335  1.9999999999999998e-91  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A03  transposase  94.7 
 
 
226 aa  296  8e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.136081  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A07  transposase  94.7 
 
 
226 aa  296  8e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00101418  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0541  transposase  94.7 
 
 
226 aa  296  8e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.509994  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1867  transposase  94.04 
 
 
226 aa  293  6e-79  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.823966  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C32  transposase  78.85 
 
 
226 aa  266  1e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0961  transposase  78.85 
 
 
226 aa  266  1e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000241394  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0139  transposase  79.49 
 
 
226 aa  265  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0148  transposase  78.85 
 
 
226 aa  265  2e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C51  transposase  78.85 
 
 
226 aa  263  5.999999999999999e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D29  transposase  80.39 
 
 
226 aa  263  8.999999999999999e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.0000656405  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D32  transposase  80.39 
 
 
226 aa  263  8.999999999999999e-70  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D13  transposase  75.95 
 
 
236 aa  261  4e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C41  transposase  77.56 
 
 
226 aa  259  8e-69  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C44  transposase  77.56 
 
 
226 aa  259  1e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C12  transposase  79.08 
 
 
226 aa  257  6e-68  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2739  integrase catalytic subunit  66.21 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2815  integrase catalytic region  66.21 
 
 
221 aa  199  1.9999999999999998e-50  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.411277  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0002  truncated IS431mec-like transposase  66.21 
 
 
214 aa  196  9e-50  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00153541  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2526  IS431mec-like transposase  65.52 
 
 
224 aa  196  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000275342  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2740  integrase catalytic subunit  65.52 
 
 
224 aa  196  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0929738  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0026  integrase catalytic subunit  65.52 
 
 
224 aa  196  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.159143  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2817  integrase catalytic region  65.52 
 
 
224 aa  196  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.264347  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0026  integrase catalytic region  65.52 
 
 
224 aa  196  1.0000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.509582  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0008  IS431mec-like transposase  65.52 
 
 
224 aa  195  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.297638  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2758  integrase catalytic subunit  65.52 
 
 
224 aa  195  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2763  integrase catalytic subunit  65.52 
 
 
224 aa  195  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.776965  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2803  integrase catalytic region  65.52 
 
 
224 aa  195  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2808  integrase catalytic region  65.52 
 
 
224 aa  195  2.0000000000000003e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0988586  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0020  IS431mec-like transposase  65.52 
 
 
224 aa  195  3e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1579  IS431mec-like transposase  65.52 
 
 
224 aa  194  6e-49  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0249  IS431mec-like transposase  62.76 
 
 
224 aa  191  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0021  truncated IS431mec-like transposase  66.4 
 
 
208 aa  171  3.9999999999999995e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1015  transposase  51.49 
 
 
134 aa  159  2e-38  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.653024  n/a   
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0160  IS26 transposase  42.95 
 
 
240 aa  144  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0100115  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0136  IS26 transposase  42.95 
 
 
240 aa  144  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0115  IS26 transposase  42.95 
 
 
240 aa  144  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.754112  normal  0.0114398 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0116  IS26 transposase  42.95 
 
 
240 aa  144  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0605578 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0149  IS26 transposase  42.95 
 
 
240 aa  144  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0119  IS26 transposase  42.95 
 
 
240 aa  144  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.16763 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0156  IS26 transposase  42.95 
 
 
240 aa  144  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.374184  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0132  IS26 transposase  42.95 
 
 
240 aa  144  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.667104  normal 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0122  IS26 transposase  42.95 
 
 
240 aa  144  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.559056 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0033  transposase InsB1 for insertion sequence IS26  42.95 
 
 
240 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.139125  normal  0.210279 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0035  transposase InsB2 for insertion sequence IS26  42.95 
 
 
240 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.401823  normal  0.39623 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0159  transposase InsB3 for insertion sequence IS26  42.95 
 
 
240 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.432493  normal 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0160  transposase InsB4 for insertion sequence IS26  42.95 
 
 
240 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0865619  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0078  IS26 transposase  43.51 
 
 
234 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.753409 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1578  IS26 transposase  43.51 
 
 
234 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0392285  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0055  IS26 transposase  43.51 
 
 
234 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.790344 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0048  IS26 transposase  43.51 
 
 
234 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.000229018  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1565  IS26 transposase  43.51 
 
 
234 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.106684  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1583  IS26 transposase  43.51 
 
 
234 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.736134  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0070  IS26 transposase  43.51 
 
 
234 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.321063 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0014  IS26 transposase  43.51 
 
 
234 aa  143  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.298746  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0040  IS26 transposase  43.51 
 
 
234 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.318026 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0076  IS26 transposase  43.51 
 
 
234 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.572199  normal  0.511731 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0096  IS26 transposase  43.51 
 
 
234 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0099  IS26 transposase  43.51 
 
 
234 aa  144  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.41105  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5621  integrase catalytic region  41.94 
 
 
235 aa  137  4.999999999999999e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1583  IS431mec-like transposase  69.31 
 
 
107 aa  136  1e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5663  integrase catalytic region  41.67 
 
 
235 aa  136  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00884972 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5614  integrase catalytic region  41.14 
 
 
235 aa  136  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5656  integrase catalytic region  41.94 
 
 
235 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.0204963 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5509  integrase catalytic region  41.94 
 
 
222 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.384257 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5211  integrase catalytic subunit  43.95 
 
 
264 aa  130  6e-30  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.12008  normal  0.236418 
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0085  ISSod8, transposase  43.06 
 
 
181 aa  129  1.0000000000000001e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.0953687  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5335  transposase  43.59 
 
 
254 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5344  transposase  43.59 
 
 
254 aa  129  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.781184  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0063  ISSod8, transposase  42.36 
 
 
185 aa  128  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.372655  n/a   
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3209  transposase  39.74 
 
 
218 aa  128  3e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.262352  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0105  ISSod8, transposase  41.67 
 
 
185 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009999  Sbal195_4664  integrase catalytic region  42.36 
 
 
230 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000673893  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4345  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.36 
 
 
230 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.177177  normal 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4341  Transposase and inactivated derivatives-like protein  42.36 
 
 
230 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000000209545  normal 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4406  integrase catalytic region  42.36 
 
 
230 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000104677  normal  0.339026 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2743  Integrase catalytic region  41.67 
 
 
238 aa  125  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0323374  normal  0.161234 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2883  ISSod8, transposase  40.28 
 
 
206 aa  124  8.000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7685  integrase catalytic region  36.48 
 
 
236 aa  123  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.686467 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4520  transposase  41.01 
 
 
228 aa  122  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.163983  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1747  hypothetical protein  41.51 
 
 
302 aa  121  5e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.2937 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0897  hypothetical protein  41.83 
 
 
235 aa  120  7e-27  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.116662 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4083  transposase  40.88 
 
 
236 aa  120  9e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4110  integrase  40.15 
 
 
236 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4167  putative transposase  41.79 
 
 
237 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0485  hypothetical protein  39.35 
 
 
235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8473  putative transposase  36.6 
 
 
233 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.396806  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0219  hypothetical protein  43.05 
 
 
235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.37343 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7114  transposase  38.03 
 
 
227 aa  118  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011311  VSAL_p840_52  transposase  39.74 
 
 
246 aa  118  3.9999999999999996e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00159101  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7500  transposase  39.1 
 
 
255 aa  118  3.9999999999999996e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.302467  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4081  putative transposase  40.15 
 
 
224 aa  117  4.9999999999999996e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5626  integrase catalytic region  36.23 
 
 
243 aa  117  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.880162  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1851  transposase, putative  40.29 
 
 
228 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1855  transposase, putative  40.29 
 
 
228 aa  116  9.999999999999999e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3408  integrase catalytic region  41.48 
 
 
262 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0175  transposase  36.42 
 
 
232 aa  116  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2850  transposase  39.71 
 
 
211 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2851  putative transposase  39.71 
 
 
237 aa  113  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.878699  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1785  putative transposase  39.57 
 
 
228 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.702349  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>