More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0128 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0128  30S ribosomal protein S9  100 
 
 
130 aa  263  4e-70  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.000000606121  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0215  30S ribosomal protein S9  95.38 
 
 
130 aa  254  2e-67  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00249156  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2583  30S ribosomal protein S9  86.92 
 
 
130 aa  232  1.0000000000000001e-60  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.0000028456  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1450  SSU ribosomal protein S9P  75.78 
 
 
131 aa  206  9e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000000188818  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0231  SSU ribosomal protein S9P  78.57 
 
 
131 aa  203  6e-52  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  decreased coverage  0.0000192076  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0629  SSU ribosomal protein S9P  79.23 
 
 
130 aa  194  3e-49  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000391075  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0323  30S ribosomal protein S9  71.88 
 
 
131 aa  191  3e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000255899  hitchhiker  5.84326e-17 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1798  30S ribosomal protein S9  70.77 
 
 
130 aa  191  4e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2285  30S ribosomal protein S9  70.77 
 
 
130 aa  189  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000447741  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2244  30S ribosomal protein S9  70.77 
 
 
130 aa  189  1e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000238567  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0138  30S ribosomal protein S9  70 
 
 
130 aa  184  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000590069  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0144  30S ribosomal protein S9  69.23 
 
 
130 aa  184  5e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000361179  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0139  30S ribosomal protein S9  69.23 
 
 
130 aa  184  5e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.11946e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0157  30S ribosomal protein S9  69.23 
 
 
130 aa  184  5e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.4920599999999996e-31 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0137  30S ribosomal protein S9  69.23 
 
 
130 aa  184  5e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000359543  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0176  30S ribosomal protein S9  69.23 
 
 
130 aa  184  5e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000140848  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0166  30S ribosomal protein S9  69.23 
 
 
130 aa  184  5e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00347352  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5160  30S ribosomal protein S9  69.23 
 
 
130 aa  184  5e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000743375  hitchhiker  0.0000000912351 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0139  30S ribosomal protein S9  68.46 
 
 
130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000424807  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0144  30S ribosomal protein S9  68.46 
 
 
130 aa  181  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000133435  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0145  30S ribosomal protein S9  69.23 
 
 
130 aa  181  3e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000670079  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0144  30S ribosomal protein S9  68.46 
 
 
130 aa  181  3e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000533856  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2679  ribosomal protein S9  66.15 
 
 
130 aa  174  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0151101  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2678  30S ribosomal protein S9  63.08 
 
 
130 aa  170  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000125135  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2363  30S ribosomal protein S9  63.08 
 
 
130 aa  170  5.999999999999999e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000350135  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3627  30S ribosomal protein S9  62.31 
 
 
130 aa  168  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000023775  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2069  30S ribosomal protein S9  62.31 
 
 
130 aa  166  9e-41  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.0000000000831765  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1782  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  165  2e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000024243  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0141  30S ribosomal protein S9  71.54 
 
 
130 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0321  30S ribosomal protein S9  60.77 
 
 
130 aa  162  2.0000000000000002e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000288169  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02470  ribosomal protein S9  63.57 
 
 
131 aa  159  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000158686  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01520  ribosomal protein S9  63.57 
 
 
131 aa  159  9e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000216085  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0247  SSU ribosomal protein S9P  58.46 
 
 
130 aa  158  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00762963  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0795  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  158  3e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000718866  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2297  ribosomal protein S9  56.92 
 
 
130 aa  156  1e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000207473  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0331  ribosomal protein S9  59.23 
 
 
130 aa  155  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00016739  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0902  30S ribosomal protein S9  59.23 
 
 
130 aa  153  7e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000079624  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13050  30S ribosomal protein S9  56.15 
 
 
130 aa  151  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2151  30S ribosomal protein S9  58.14 
 
 
158 aa  151  2.9999999999999998e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.45731  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1394  ribosomal protein S9  58.2 
 
 
129 aa  151  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000135637  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0727  30S ribosomal protein S9  65.12 
 
 
131 aa  150  4e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000341683  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0230  SSU ribosomal protein S9P  58.46 
 
 
132 aa  150  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000443747  normal  0.670048 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01720  SSU ribosomal protein S9P  62.5 
 
 
130 aa  150  7e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  unclonable  0.0000000110111  hitchhiker  0.000000000473134 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0006  ribosomal protein S9  61.11 
 
 
133 aa  148  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.819912  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2613  30S ribosomal protein S9  61.29 
 
 
169 aa  149  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4348  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 
130 aa  148  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000012665  hitchhiker  0.00291766 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2608  30S ribosomal protein S9  57.69 
 
 
130 aa  147  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0410125  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3285  30S ribosomal protein S9  58.14 
 
 
180 aa  147  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4594  30S ribosomal protein S9  59.69 
 
 
188 aa  147  4e-35  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4345  30S ribosomal protein S9  57.38 
 
 
160 aa  147  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.59912  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0525  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 
130 aa  147  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000883336  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0461  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 
130 aa  147  6e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000140237  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0746  ribosomal protein S9  61.11 
 
 
134 aa  147  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1133  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 
130 aa  147  6e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000113025  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2663  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 
130 aa  146  7e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00134428  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1050  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 
130 aa  147  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000126027  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0890  30S ribosomal protein S9  62.6 
 
 
166 aa  146  9e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4425  ribosomal protein S9  53.85 
 
 
130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.146621  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4119  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 
130 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0300  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 
130 aa  146  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00212654  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5159  ribosomal protein S9  58.78 
 
 
169 aa  146  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.623801  normal  0.298446 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0600  30S ribosomal protein S9  60.48 
 
 
173 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.190844  normal  0.458366 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1233  30S ribosomal protein S9  55.38 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000147442  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21980  SSU ribosomal protein S9P  60.94 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000149562  hitchhiker  0.00529045 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3190  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000452354  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0244  30S ribosomal protein S9  59.38 
 
 
165 aa  145  2.0000000000000003e-34  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.411662 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2241  SSU ribosomal protein S9P  55.38 
 
 
130 aa  145  2.0000000000000003e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.201316  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3665  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 
130 aa  144  3e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0023412  normal  0.0755267 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2120  SSU ribosomal protein S9P  57.69 
 
 
130 aa  144  3e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.39803  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4693  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00380118  normal  0.0220476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0902  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 
130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03090  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 
130 aa  144  5e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.0000557445  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0476  ribosomal protein S9  52.31 
 
 
130 aa  144  5e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000601039  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3419  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 
130 aa  144  5e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000112038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3713  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 
130 aa  144  5e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000596943  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3546  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 
130 aa  144  5e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000104404  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3525  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 
130 aa  144  5e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000016286  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4547  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 
130 aa  144  5e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.000000371086  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03041  hypothetical protein  52.31 
 
 
130 aa  144  5e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.0000287646  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0476  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 
130 aa  144  5e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000111446  normal  0.163216 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0347  ribosomal protein S9  60.94 
 
 
130 aa  143  6e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000129825  normal  0.751178 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3796  ribosomal protein S9  51.54 
 
 
130 aa  144  6e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.000182281  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2938  ribosomal protein S9  55.74 
 
 
162 aa  143  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000844995 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3536  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 
130 aa  143  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000037617  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4442  ribosomal protein S9  53.85 
 
 
130 aa  143  8.000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3704  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 
130 aa  143  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.00817033  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004510  SSU ribosomal protein S9p (S16e)  53.85 
 
 
130 aa  143  8.000000000000001e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000229051  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3642  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 
130 aa  143  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.000331692  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3535  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 
130 aa  143  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000000799314  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1154  ribosomal protein S9  58.73 
 
 
132 aa  143  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.252489  normal  0.0143228 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3607  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 
130 aa  143  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000867127  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3702  ribosomal protein S9  53.85 
 
 
130 aa  143  9e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000244977  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0734  30S ribosomal protein S9  52.31 
 
 
130 aa  143  9e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000144699  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3638  ribosomal protein S9  51.54 
 
 
130 aa  142  1e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  decreased coverage  0.00994207  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4533  30S ribosomal protein S9  53.85 
 
 
130 aa  142  1e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.848049  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0212  ribosomal protein S9  54.96 
 
 
131 aa  142  1e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000467508  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2726  ribosomal protein S9  55.91 
 
 
132 aa  142  1e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000561308  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0056  SSU ribosomal protein S9P  56.1 
 
 
130 aa  142  1e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0128063  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0923  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 
130 aa  142  2e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00882  30S ribosomal protein S9  53.08 
 
 
130 aa  142  2e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>