More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0127 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0127  50S ribosomal protein L13  100 
 
 
148 aa  305  2.0000000000000002e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000000749109  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0214  50S ribosomal protein L13  98.65 
 
 
148 aa  302  1.0000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000083935  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2584  50S ribosomal protein L13  85.81 
 
 
148 aa  270  5.000000000000001e-72  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1451  50S ribosomal protein L13  68.49 
 
 
147 aa  221  2e-57  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000158182  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0628  50S ribosomal protein L13  69.39 
 
 
148 aa  212  9.999999999999999e-55  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0115715  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0230  50S ribosomal protein L13  65.75 
 
 
147 aa  209  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00330553  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0322  50S ribosomal protein L13  66.44 
 
 
158 aa  202  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000362186  hitchhiker  1.16201e-17 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2245  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 
145 aa  192  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00000176479  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2286  50S ribosomal protein L13  62.5 
 
 
145 aa  192  1e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000101681  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5161  50S ribosomal protein L13  61.81 
 
 
145 aa  188  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000749627  hitchhiker  0.00000001137 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1799  50S ribosomal protein L13  60.42 
 
 
145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0143  50S ribosomal protein L13  61.11 
 
 
145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000000145264  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0143  50S ribosomal protein L13  61.11 
 
 
145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163354  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0138  50S ribosomal protein L13  61.11 
 
 
145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  7.36726e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0165  50S ribosomal protein L13  61.11 
 
 
145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000103793  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0143  50S ribosomal protein L13  61.11 
 
 
145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000175046  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0156  50S ribosomal protein L13  61.11 
 
 
145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.54845e-34 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0175  50S ribosomal protein L13  61.11 
 
 
145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000580183  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0138  50S ribosomal protein L13  61.81 
 
 
145 aa  187  2.9999999999999997e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000000668177  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0137  50S ribosomal protein L13  61.11 
 
 
145 aa  187  4e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000751399  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0140  50S ribosomal protein L13  60.42 
 
 
145 aa  185  2e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0794  50S ribosomal protein L13  61.7 
 
 
144 aa  185  2e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000346357  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0136  50S ribosomal protein L13  60.42 
 
 
145 aa  184  4e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000986136  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02460  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 
142 aa  183  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000118525  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01510  50S ribosomal protein L13  60.99 
 
 
142 aa  183  7e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  1.25739e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0144  50S ribosomal protein L13  57.64 
 
 
145 aa  182  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000514694  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03383  50S ribosomal protein L13  61.43 
 
 
142 aa  182  1.0000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000333795  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0661  ribosomal protein L13  60.28 
 
 
149 aa  181  2.0000000000000003e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.07785  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0229  50S ribosomal protein L13  63.04 
 
 
143 aa  180  5.0000000000000004e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356517  normal  0.82089 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21990  LSU ribosomal protein L13P  58.04 
 
 
145 aa  179  8.000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000237961  hitchhiker  0.00551635 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0256  50S ribosomal protein L13  60.56 
 
 
143 aa  179  1e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000758972  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2613  ribosomal protein L13  60.99 
 
 
147 aa  178  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.888861  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3106  ribosomal protein L13  58.04 
 
 
147 aa  178  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2077  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  176  1e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1783  50S ribosomal protein L13  58.62 
 
 
145 aa  176  1e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000118025  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3071  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  176  1e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000152627  normal  0.192156 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3703  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  175  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000271958  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2298  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
144 aa  175  2e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000160952  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6565  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
147 aa  175  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.870556  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3864  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
147 aa  174  3e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.545712 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4254  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
147 aa  174  3e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00510503 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2242  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
142 aa  174  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.140836  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3349  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 
142 aa  173  8e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.084598 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0971  50S ribosomal protein L13  58.16 
 
 
147 aa  173  9e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.704336  normal  0.0786185 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4349  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  172  9.999999999999999e-43  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000122799  hitchhiker  0.00298092 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0211  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 
142 aa  172  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  decreased coverage  0.0000131451  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2206  50S ribosomal protein L13  58.62 
 
 
151 aa  172  9.999999999999999e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1049  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
143 aa  172  9.999999999999999e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177368  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0506  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  172  9.999999999999999e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000158843  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2664  50S ribosomal protein L13  60 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  decreased coverage  0.000266621  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2680  ribosomal protein L13  58.39 
 
 
148 aa  171  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0154715  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2614  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 
149 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.784186  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0912  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 
142 aa  171  1.9999999999999998e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000000482809  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0744  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
142 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00000000518641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0747  50S ribosomal protein L13  59.15 
 
 
143 aa  172  1.9999999999999998e-42  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000197035  normal  0.0408198 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0246  50S ribosomal protein L13  56.74 
 
 
144 aa  172  1.9999999999999998e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0124742  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0341  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 
147 aa  172  1.9999999999999998e-42  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0522563  hitchhiker  0.00384234 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0617  ribosomal protein L13  55.94 
 
 
147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0346  ribosomal protein L13  54.93 
 
 
144 aa  171  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000157006  normal  0.759016 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4222  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
143 aa  171  2.9999999999999996e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000000936521  hitchhiker  0.00032903 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29360  LSU ribosomal protein L13P  58.87 
 
 
147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.220541  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23250  LSU ribosomal protein L13P  60 
 
 
147 aa  171  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5158  ribosomal protein L13  55.94 
 
 
149 aa  171  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.282835 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3940  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0732  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00000680495  hitchhiker  0.00347567 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3652  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000000055141  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3269  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000128707  hitchhiker  0.00000918521 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0678  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000445483  hitchhiker  0.000251831 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0692  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000556575  decreased coverage  0.00000194665 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0723  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 
142 aa  171  3.9999999999999995e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000205135  hitchhiker  0.00003559 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04440  50S ribosomal protein L13  56.64 
 
 
150 aa  171  3.9999999999999995e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.913726  normal  0.278676 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16870  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 
147 aa  170  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0904  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 
142 aa  170  5e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.222508  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4443  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  171  5e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3595  50S ribosomal protein L13  58.45 
 
 
143 aa  171  5e-42  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000249881  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13040  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 
142 aa  170  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2918  50S ribosomal protein L13  57.45 
 
 
147 aa  170  5e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1528  ribosomal protein L13  60.71 
 
 
145 aa  170  5.999999999999999e-42  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000350375  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4468  ribosomal protein L13  55 
 
 
147 aa  170  5.999999999999999e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3294  50S ribosomal protein L13  57.75 
 
 
143 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000000182384  hitchhiker  0.00115677 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3360  50S ribosomal protein L13  59.29 
 
 
142 aa  170  6.999999999999999e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000892865  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1125  50S ribosomal protein L13  55.94 
 
 
147 aa  169  7.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.849812 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0922  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  169  1e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16521  50S ribosomal protein L13  54.67 
 
 
170 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0797487  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3628  50S ribosomal protein L13  57.14 
 
 
144 aa  169  1e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000132589  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0702  50S ribosomal protein L13  57.86 
 
 
142 aa  169  1e-41  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111952  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0541  ribosomal protein L13  53.19 
 
 
142 aa  169  1e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0111293  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00881  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 
142 aa  169  1e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1315  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161959  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0735  ribosomal protein L13  56.43 
 
 
145 aa  168  2e-41  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  decreased coverage  0.000000000119852  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004511  LSU ribosomal protein L13p (L13Ae)  57.86 
 
 
142 aa  168  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000254571  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17141  50S ribosomal protein L13  61.07 
 
 
143 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0575985  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0922  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 
147 aa  169  2e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17241  50S ribosomal protein L13  60.31 
 
 
143 aa  168  2e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4534  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0752  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 
142 aa  168  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272076  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4409  50S ribosomal protein L13  55.71 
 
 
142 aa  168  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.867094  normal  0.414733 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2472  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 
142 aa  169  2e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00672084  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0524  50S ribosomal protein L13  58.57 
 
 
142 aa  167  3e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000026356  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1250  ribosomal protein L13  57.53 
 
 
146 aa  168  3e-41  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>