289 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0126 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0126  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
318 aa  662    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00267865  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0349  2-dehydropantoate 2-reductase  71.47 
 
 
321 aa  483  1e-135  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1333  2-dehydropantoate 2-reductase  55.95 
 
 
322 aa  379  1e-104  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.782684 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1867  2-dehydropantoate 2-reductase  51.42 
 
 
318 aa  351  7e-96  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0258  ketopantoate reductase  48.9 
 
 
331 aa  304  1.0000000000000001e-81  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.466283  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2951  2-dehydropantoate 2-reductase  32.26 
 
 
305 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2839  2-dehydropantoate 2-reductase  32.26 
 
 
305 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.748115 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2776  2-dehydropantoate 2-reductase  32.26 
 
 
305 aa  169  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2735  2-dehydropantoate 2-reductase  32.26 
 
 
305 aa  169  7e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2816  2-dehydropantoate 2-reductase  31.94 
 
 
305 aa  167  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0771  2-dehydropantoate 2-reductase  30.79 
 
 
309 aa  152  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.794348  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  30.48 
 
 
309 aa  150  4e-35  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000509369  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1285  2-dehydropantoate 2-reductase  28.66 
 
 
311 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1477  ketopantoate reductase  27.99 
 
 
337 aa  139  7.999999999999999e-32  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1445  2-dehydropantoate 2-reductase  30.7 
 
 
312 aa  138  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.219462  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6159  2-dehydropantoate 2-reductase  30.65 
 
 
314 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.33113  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0105  2-dehydropantoate 2-reductase  26.45 
 
 
307 aa  133  3e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000116334  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2022  2-dehydropantoate 2-reductase  28.25 
 
 
310 aa  130  3e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.29792  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1997  2-dehydropantoate 2-reductase  27.01 
 
 
315 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515886 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1351  2-dehydropantoate 2-reductase  26.27 
 
 
307 aa  118  9.999999999999999e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0716  2-dehydropantoate 2-reductase  26.87 
 
 
310 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.379767 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2518  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 
311 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.254196  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2470  2-dehydropantoate 2-reductase  28.62 
 
 
311 aa  107  3e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5912  2-dehydropantoate 2-reductase  26.27 
 
 
314 aa  103  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.579455  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0375  hypothetical protein  26.71 
 
 
302 aa  102  7e-21  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0095  2-dehydropantoate 2-reductase  26.6 
 
 
318 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0453394  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2500  2-dehydropantoate 2-reductase  26.1 
 
 
314 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.637616 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0889  2-dehydropantoate 2-reductase  26.6 
 
 
318 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.298016  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2605  2-dehydropantoate 2-reductase  26.1 
 
 
314 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2482  2-dehydropantoate 2-reductase  26.6 
 
 
318 aa  102  1e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386001  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0348  2-dehydropantoate 2-reductase  26.6 
 
 
313 aa  100  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4507  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 
335 aa  100  4e-20  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.28047  normal  0.622175 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  26.96 
 
 
318 aa  99.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0647  2-dehydropantoate 2-reductase  26.26 
 
 
318 aa  100  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00836625  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1051  2-dehydropantoate 2-reductase  26.01 
 
 
310 aa  99  9e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2629  2-dehydropantoate 2-reductase  25.39 
 
 
314 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1970  2-dehydropantoate 2-reductase  26.1 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.181266  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2581  2-dehydropantoate 2-reductase  26.1 
 
 
314 aa  95.1  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.331281  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0707  2-dehydropantoate 2-reductase  25 
 
 
310 aa  94.4  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.102156  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6020  2-dehydropantoate 2-reductase  25.77 
 
 
316 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.217101  normal  0.377898 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5528  2-dehydropantoate 2-reductase  25.25 
 
 
316 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5892  2-dehydropantoate 2-reductase  25.25 
 
 
316 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.700658  normal  0.998449 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1891  2-dehydropantoate 2-reductase  25.24 
 
 
313 aa  92  1e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.417292  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6528  2-dehydropantoate 2-reductase  23.76 
 
 
316 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  26.35 
 
 
309 aa  92  1e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6243  2-dehydropantoate 2-reductase  23.4 
 
 
316 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3920  2-dehydropantoate 2-reductase  25.24 
 
 
295 aa  91.7  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1893  2-dehydropantoate 2-reductase  26.19 
 
 
310 aa  90.5  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00746651  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4530  2-dehydropantoate 2-reductase  24.49 
 
 
355 aa  90.1  5e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.247613 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  30.59 
 
 
306 aa  89  1e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5508  2-dehydropantoate 2-reductase  25.33 
 
 
323 aa  87.4  3e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.723336  normal  0.36356 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1104  2-dehydropantoate 2-reductase  26.73 
 
 
307 aa  87.4  3e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000227981 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1964  2-dehydropantoate 2-reductase  25.11 
 
 
314 aa  87  4e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00305796  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  22.61 
 
 
312 aa  86.3  6e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6401  2-dehydropantoate 2-reductase  25.93 
 
 
316 aa  85.9  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.246941 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1877  2-dehydropantoate 2-reductase  25.53 
 
 
314 aa  85.9  9e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0355332  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1991  2-dehydropantoate 2-reductase  24.68 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000310773  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2695  2-dehydropantoate 2-reductase  24.67 
 
 
315 aa  85.5  0.000000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.120286  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2998  2-dehydropantoate 2-reductase, putative  25.33 
 
 
315 aa  84.7  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.0207469 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3467  2-dehydropantoate 2-reductase  25.53 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000905297  hitchhiker  8.32908e-18 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1918  2-dehydropantoate 2-reductase  24.68 
 
 
314 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000931177 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1405  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 
307 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0603  2-dehydropantoate 2-reductase  22.68 
 
 
299 aa  83.6  0.000000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1698  2-dehydropantoate 2-reductase  22.51 
 
 
306 aa  83.2  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.656315  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6167  2-dehydropantoate 2-reductase  25.25 
 
 
314 aa  83.2  0.000000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1696  2-dehydropantoate 2-reductase  24.26 
 
 
314 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.231571  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5729  2-dehydropantoate 2-reductase  21.84 
 
 
301 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.807147  normal  0.396858 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1323  2-dehydropantoate 2-reductase  22.96 
 
 
316 aa  80.9  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.684769  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1688  2-dehydropantoate 2-reductase  23.08 
 
 
351 aa  81.3  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.754321  normal  0.201139 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1855  2-dehydropantoate 2-reductase  22.76 
 
 
316 aa  81.3  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1746  2-dehydropantoate 2-reductase  23.83 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6131  2-dehydropantoate 2-reductase  23.97 
 
 
341 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1884  2-dehydropantoate 2-reductase  23.83 
 
 
314 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  25.42 
 
 
311 aa  80.1  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5042  2-dehydropantoate 2-reductase  22.04 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6482  2-dehydropantoate 2-reductase  21.52 
 
 
301 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.201709  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0600  2-dehydropantoate 2-reductase  25.08 
 
 
314 aa  79  0.0000000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000137771  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  22.36 
 
 
300 aa  78.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0791  2-dehydropantoate 2-reductase  22.08 
 
 
303 aa  77.8  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1738  2-dehydropantoate 2-reductase  24.68 
 
 
314 aa  78.2  0.0000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0314725  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1677  2-dehydropantoate 2-reductase  24.84 
 
 
319 aa  78.2  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1115  2-dehydropantoate 2-reductase  22.8 
 
 
309 aa  78.2  0.0000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.275273  normal  0.917906 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1551  2-dehydropantoate 2-reductase  24.43 
 
 
312 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.257766  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0377  2-dehydropantoate 2-reductase  21.61 
 
 
316 aa  77.4  0.0000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4956  2-dehydropantoate 2-reductase  21.66 
 
 
298 aa  77  0.0000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6687  2-dehydropantoate 2-reductase  24.64 
 
 
312 aa  75.5  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  30.49 
 
 
310 aa  74.3  0.000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2929  2-dehydropantoate 2-reductase  22.44 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  25.71 
 
 
307 aa  74.3  0.000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1713  2-dehydropantoate 2-reductase  23.1 
 
 
306 aa  74.3  0.000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  22.51 
 
 
318 aa  74.7  0.000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0743  ketopantoate reductase ApbA/PanE  24.83 
 
 
311 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.786977  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0186  2-dehydropantoate 2-reductase  24.91 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  26.89 
 
 
302 aa  73.6  0.000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4116  2-dehydropantoate 2-reductase  24.56 
 
 
308 aa  73.2  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.605632 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2382  2-dehydropantoate 2-reductase  26.21 
 
 
314 aa  72.8  0.000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  24.11 
 
 
312 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4967  ketopantoate reductase ApbA/PanE  28.36 
 
 
299 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  22.7 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1400  2-dehydropantoate 2-reductase  24.53 
 
 
345 aa  70.5  0.00000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>