More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0112 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008532  STER_0546  transposase  100 
 
 		 289 aa  608  1e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0841  transposase  100 
 
 		 289 aa  608  1e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0112  transposase  100 
 
 		 289 aa  608  1e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0848  transposase  91.7 
 
 		 289 aa  561  1.0000000000000001e-159  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.556417  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2172  integrase catalytic region  44.03 
 
 		 300 aa  229  4e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1194  integrase catalytic region  42.76 
 
 		 293 aa  226  4e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0470498  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3175  integrase catalytic region  43.66 
 
 		 300 aa  225  7e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0277511  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2397  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.861552 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1458  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.31397  normal  0.395934 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3346  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0096806 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2727  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.74831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1740  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.344934  hitchhiker  0.000236948 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2938  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4456  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3912  integrase catalytic region  41.95 
 
 		 248 aa  184  1.0000000000000001e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0553017  normal  0.660901 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1436  isrso11-transposase orfb protein  38.41 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3089  isrso11-transposase orfb protein  38.41 
 
 		 278 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2265  isrso11-transposase orfb protein  38.24 
 
 		 269 aa  181  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.654109  normal  0.311626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2408  isrso11-transposase orfb protein  38.04 
 
 		 278 aa  180  2.9999999999999997e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.915903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2164  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  41.67 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2533  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  41.67 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.208347  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2250  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  41.67 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3041  transposase InsF for insertion sequence IS3A/B/C/D/E/fA  41.67 
 
 		 239 aa  177  1e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2654  integrase catalytic subunit  39.34 
 
 		 268 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.596052  normal  0.523017 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3317  integrase catalytic subunit  39.34 
 
 		 268 aa  178  1e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.817536  normal  0.265115 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1564  integrase catalytic subunit  38.52 
 
 		 278 aa  177  2e-43  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.403634  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0124  ISPsy8, transposase OrfB  38.78 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0450  ISPsy8, transposase OrfB  38.78 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0516  ISPsy8, transposase OrfB  38.78 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.390784  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5018  ISPsy9, transposase OrfB  38.97 
 
 		 278 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5509  ISPsy8, transposase OrfB  38.78 
 
 		 259 aa  176  4e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.359281  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5066  ISPsy8, transposase OrfB  38.78 
 
 		 259 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.552725  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1975  integrase catalytic subunit  38.97 
 
 		 268 aa  175  7e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.259629 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4860  integrase catalytic subunit  38.97 
 
 		 268 aa  175  9e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.434054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3939  integrase catalytic region  37.36 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.997818  normal  0.816377 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0288  integrase catalytic region  37.36 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.010827  normal  0.364185 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1339  integrase catalytic region  37.36 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00327623 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5561  integrase catalytic region  37.36 
 
 		 278 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.966664  normal  0.319693 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0564  integrase catalytic region  37.86 
 
 		 278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.22633  normal  0.244778 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2352  integrase catalytic region  37.86 
 
 		 278 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  0.149217 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0273  integrase catalytic subunit  38.24 
 
 		 278 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0592  integrase catalytic subunit  38.24 
 
 		 278 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.398355  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1176  integrase catalytic subunit  38.24 
 
 		 278 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.155999  normal  0.139612 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4616  integrase catalytic subunit  38.24 
 
 		 278 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.698457  normal  0.616074 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4680  integrase catalytic subunit  38.24 
 
 		 278 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02200  YadA protein  42.13 
 
 		 279 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.618356  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04289  transposase  42.13 
 
 		 279 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02377  hypothetical protein  42.13 
 
 		 279 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02160  hypothetical protein  42.13 
 
 		 279 aa  172  6.999999999999999e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.604012  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1055  integrase catalytic subunit  40.77 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1362  integrase catalytic subunit  40.77 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0397787 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1478  integrase catalytic subunit  40.77 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.168577  normal  0.117043 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1091  integrase catalytic subunit  40.77 
 
 		 252 aa  170  2e-41  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0430  transposase  38.58 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2079  transposase  38.58 
 
 		 270 aa  170  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4383  integrase core domain protein  36.16 
 
 		 270 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.364071  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1280  integrase core domain protein  36.16 
 
 		 270 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.613069  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1018  integrase core domain protein  36.16 
 
 		 270 aa  169  5e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00171596  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0974  Integrase catalytic region  38.85 
 
 		 277 aa  168  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.382547  normal  0.109209 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2945  Integrase catalytic region  38.85 
 
 		 277 aa  168  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0817746  normal  0.460878 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3208  Integrase catalytic region  38.85 
 
 		 277 aa  168  9e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.928461 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1714  transposase  37.5 
 
 		 278 aa  168  1e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.376694  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1128  IS3 family transposase OrfB  36.88 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00657543  n/a   
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0056  IS3 family transposase OrfB  36.88 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0025  ISSod1, transposase OrfA  37.59 
 
 		 386 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.137209  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0028  ISSod1, transposase OrfA  37.59 
 
 		 386 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.234978  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0038  ISSod1, transposase OrfA  37.59 
 
 		 386 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0053  ISSod1, transposase OrfA  37.59 
 
 		 386 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0065  ISSod1, transposase OrfA  37.59 
 
 		 386 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0090  ISSod1, transposase OrfA  37.59 
 
 		 386 aa  166  4e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1840  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0397967  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4278  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4413  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0993  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.184705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4274  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2540  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4192  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2097  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.253953  n/a   
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4413  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000737696  normal  0.0155639 
 
 
-
 
NC_009661  Shew185_4392  transposase IS3/IS911 family protein  35.99 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0814  integrase catalytic subunit  38.98 
 
 		 278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6205  integrase catalytic subunit  38.98 
 
 		 260 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.346125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2714  integrase catalytic subunit  38.98 
 
 		 278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2564  integrase catalytic subunit  38.98 
 
 		 278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.95917  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1446  integrase catalytic subunit  38.98 
 
 		 278 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.129999  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1165  integrase catalytic region  42.03 
 
 		 222 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000468999 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1365  transposase  41.42 
 
 		 246 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0447e-22 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0109  IS3-family transposase, OrfB  38.72 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0514465  hitchhiker  0.00000245789 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1197  IS3-family transposase, OrfB  38.72 
 
 		 249 aa  160  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000397952  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2862  transposase  41.42 
 
 		 246 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.318  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2546  putative IS1 transposase, InsB  38.17 
 
 		 275 aa  161  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.31349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1432  integrase catalytic subunit  36.33 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0347  integrase core domain protein  40.57 
 
 		 246 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1099  transposase  41 
 
 		 246 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.41959e-57 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4709  integrase catalytic region  35.38 
 
 		 283 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.704343  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0509  transposase  41 
 
 		 246 aa  160  3e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2024  transposase  41 
 
 		 246 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  3.08352e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2994  transposase  41 
 
 		 246 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4078  transposase  41 
 
 		 246 aa  160  3e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0741694  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0298  integrase catalytic subunit  36.33 
 
 		 270 aa  160  3e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>