More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0109 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_3461  ATPase  43.58 
 
 
824 aa  658    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.385513  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1194  ATP-dependent Clp protease ATP-binding subunit  41.79 
 
 
812 aa  646    Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.453766  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1413  chaperone ClpB  41.79 
 
 
812 aa  646    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1575  ATPase AAA-2 domain protein  42.5 
 
 
814 aa  637    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0165  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  45.11 
 
 
817 aa  680    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1825  ATPase AAA-2 domain protein  46.96 
 
 
829 aa  650    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.97 
 
 
811 aa  672    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1200  ATPase  44.24 
 
 
825 aa  641    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0973112  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1828  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  72.64 
 
 
815 aa  1209    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.223086  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0081  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.97 
 
 
811 aa  672    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0078  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  45.97 
 
 
811 aa  672    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0077  negative regulator of genetic competence clpC/mecB (ATP-dependent Clp protease)  45.97 
 
 
811 aa  674    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0327  ATPase AAA-2 domain protein  47.04 
 
 
810 aa  662    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00200367  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0561  ATPase  44.5 
 
 
818 aa  678    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2876  ATPase  43.87 
 
 
830 aa  640    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5224  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  46.21 
 
 
811 aa  675    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000555448  unclonable  1.16962e-24 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1480  ATPase AAA-2 domain protein  49.54 
 
 
823 aa  642    Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0038131  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4070  ATPase  44.5 
 
 
825 aa  639    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0010  ATP-binding subunit of Clp protease  54.3 
 
 
869 aa  655    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0835  ATPase  44.87 
 
 
816 aa  669    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0981203  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0181  ATPase  43.08 
 
 
812 aa  661    Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.551384  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4335  ATPase AAA-2 domain protein  43.47 
 
 
840 aa  636    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1526  ATPase  44.34 
 
 
839 aa  654    Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.00101266  unclonable  2.1897600000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0080  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.97 
 
 
811 aa  672    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.723248  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3416  ATPase AAA-2 domain-containing protein  46.55 
 
 
834 aa  640    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4475  ATPase AAA-2 domain protein  43.26 
 
 
837 aa  635    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0162  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  43.48 
 
 
840 aa  640    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4992  ATPase AAA-2 domain protein  42.89 
 
 
836 aa  637    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384287  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0102  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.97 
 
 
811 aa  674    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0845535  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1220  ATPase  41.66 
 
 
812 aa  643    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0076  ATPase  45.73 
 
 
811 aa  671    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0146  ATPase AAA-2 domain protein  44.96 
 
 
814 aa  713    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2179  ATPase AAA-2  42.48 
 
 
834 aa  653    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.400132  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0083  ATPase AAA-2 domain protein  46.15 
 
 
811 aa  701    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.181403  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1789  ATPase AAA-2  43.69 
 
 
818 aa  665    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.607583  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0111  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.97 
 
 
811 aa  672    Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.2403  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2367  ATPases with chaperone activity, ATP-binding subunit  44.86 
 
 
828 aa  649    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000278199  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1850  ATPase AAA-2 domain protein  42.79 
 
 
826 aa  640    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0630  ATPase  48.94 
 
 
890 aa  638    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.841599  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0666  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  51.02 
 
 
816 aa  804    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.483496  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0514  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  46.98 
 
 
823 aa  737    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.262133  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0283  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  46.67 
 
 
838 aa  712    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.114568  hitchhiker  0.0000140649 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0091  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  45.97 
 
 
811 aa  672    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  4.7884e-59 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0185  ATP-binding subunit of Clp protease and DnaK/DnaJ chaperones  46.5 
 
 
826 aa  694    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0076  ATPase  46.33 
 
 
811 aa  682    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0109  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  100 
 
 
816 aa  1664    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0364  ATPase  43.03 
 
 
822 aa  642    Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2740  ATPase AAA-2 domain protein  45.8 
 
 
812 aa  673    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0180  ATPase  44.57 
 
 
812 aa  669    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0547  ATPase  44.5 
 
 
818 aa  678    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0220  ATPase  43.4 
 
 
839 aa  645    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.230139  normal  0.171327 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0079  ATPase AAA-2 domain protein  46.51 
 
 
810 aa  701    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0255  ATPase AAA-2 domain protein  45.13 
 
 
810 aa  662    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.280276  normal  0.406716 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0389  ATPase AAA-2 domain protein  52.61 
 
 
826 aa  673    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0666957  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1494  ATPase  47.17 
 
 
830 aa  726    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000400156  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0724  negative regulator of genetic competence ClpC/MecB  43.77 
 
 
862 aa  651    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0978513 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1948  ATPase AAA-2 domain protein  44.84 
 
 
812 aa  664    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0130841  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0051  ATPase  48.44 
 
 
824 aa  632  1e-180  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00486444  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1903  ATPase AAA-2 domain protein  42.11 
 
 
829 aa  634  1e-180  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.847755  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1399  ATPase AAA-2 domain protein  42.48 
 
 
815 aa  632  1e-180  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0299  ATPase AAA-2  50.53 
 
 
837 aa  633  1e-180  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24610  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  44 
 
 
866 aa  635  1e-180  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_56  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit  43.3 
 
 
824 aa  634  1e-180  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9148  class III stress response-related ATPase  46.89 
 
 
835 aa  633  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0057  ATP-dependent Clp protease, ATP-binding subunit ClpC  48.52 
 
 
824 aa  631  1e-179  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00724799  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2237  ATPase AAA-2 domain protein  42.38 
 
 
854 aa  630  1e-179  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0474573  normal  0.336579 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00870  ATPase AAA-2 domain protein  43.1 
 
 
806 aa  630  1e-179  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000509164  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4348  UvrB/UvrC protein  50.71 
 
 
814 aa  631  1e-179  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1343  ATPase AAA-2 domain protein  46.6 
 
 
850 aa  631  1e-179  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0449  ATPase AAA-2 domain protein  50.38 
 
 
842 aa  629  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.673117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0641  ATPase AAA-2 domain protein  43.03 
 
 
841 aa  629  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1436  ATPase AAA-2 domain protein  40.07 
 
 
834 aa  630  1e-179  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.327817 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2751  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  42.32 
 
 
814 aa  631  1e-179  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3380  ATPase AAA-2  42.42 
 
 
825 aa  629  1e-179  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.802803  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0355  ATPase AAA-2 domain protein  42.92 
 
 
853 aa  631  1e-179  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  unclonable  0.0000716084  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0168  ATPase  43.39 
 
 
830 aa  630  1e-179  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01540  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  43.59 
 
 
851 aa  626  1e-178  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13030  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  47.52 
 
 
879 aa  626  1e-178  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0171216  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0857  ATPase AAA-2 domain protein  43.72 
 
 
846 aa  627  1e-178  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4704  ATPase AAA-2 domain protein  41.53 
 
 
825 aa  625  1e-178  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.655503 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1369  ATPase AAA-2 domain protein  45.5 
 
 
830 aa  627  1e-178  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.689821 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2437  negative regulator of genetic competence MecB/ClpC  42.66 
 
 
814 aa  627  1e-178  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05080  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  42.94 
 
 
858 aa  626  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6630  ATPase AAA-2 domain protein  41.98 
 
 
844 aa  626  1e-178  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2192  ATPase  43.51 
 
 
836 aa  624  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.158504  normal  0.0967388 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4709  ATPase  43.51 
 
 
844 aa  625  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0549246  normal  0.0242772 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13220  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  42.05 
 
 
862 aa  624  1e-177  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0726  ATPase  43.13 
 
 
820 aa  624  1e-177  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000365895  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19480  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  41.71 
 
 
865 aa  622  1e-177  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  unclonable  0.00000000156144 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0573  ATPase AAA-2 domain protein  43 
 
 
855 aa  622  1e-177  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6311  ATPase AAA-2 domain-containing protein  42.22 
 
 
854 aa  625  1e-177  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0332  ATPase AAA-2 domain protein  43.87 
 
 
830 aa  625  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0334  ATPase  43.08 
 
 
854 aa  623  1e-177  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0190  ATPase  43.29 
 
 
834 aa  624  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.362734 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0028  ATPase  42.05 
 
 
822 aa  623  1e-177  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4275  ATPase  43.39 
 
 
844 aa  621  1e-176  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.219573 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0676  ATPase AAA-2  46.45 
 
 
886 aa  621  1e-176  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  unclonable  0.000220966  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11320  ATPase with chaperone activity, ATP-binding subunit  42.52 
 
 
846 aa  620  1e-176  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.952833  normal  0.628396 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0330  ATPase AAA-2 domain protein  42.21 
 
 
849 aa  621  1e-176  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.711717 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0059  ATPase AAA-2 domain protein  41.53 
 
 
860 aa  620  1e-176  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0310475  normal  0.148916 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>