14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene STER_0102 on replicon NC_008532
Organism: Streptococcus thermophilus LMD-9



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008532  STER_0102    100 
 
 
264 bp  523  1e-147  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0364    99.59 
 
 
588 bp  476  1e-132  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1209    97.35 
 
 
1354 bp  468  9.999999999999999e-131  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0017    96.21 
 
 
339 bp  444  1e-123  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.159602  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1754    95.83 
 
 
5389 bp  436  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1759  transposase  95.83 
 
 
339 bp  436  1e-120  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0056    93.58 
 
 
609 bp  276  3e-72  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0806    96.3 
 
 
609 bp  174  7.999999999999999e-42  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0500044  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0255    97.62 
 
 
279 bp  151  1.0000000000000001e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.384648  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0290  transposase  96.36 
 
 
147 bp  93.7  2e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.174922  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0900    92.31 
 
 
796 bp  91.7  9e-17  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00475035  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1359  transposase  80.46 
 
 
837 bp  75.8  0.000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00136296  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1373    91.23 
 
 
189 bp  73.8  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1417  IS861, transposase (orf2), IS3 family, truncated  86.44 
 
 
639 bp  54  0.00002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>